2023年生化期末重点复习最全面精品资料.pdf
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1、生化期末重点 1 考试题型:一、填空;二、是非题;三、选择题;四、名词解释;五、问答题 每章简要:一、生物氧化 基本概念,与非生物氧化比较 呼吸链;概念、组成、类型、传递顺序、抑制剂。氧化磷酸化;概念、机制、解偶联剂 二、代谢总论 基本概念;代谢、代谢途径、代谢物,分解代谢、合成代谢、代谢组、代谢组学 三、糖酵解 糖的消化;淀粉的酶水解 糖酵解全部反应、三步限速步骤、特异性抑制剂、两步底物磷酸化反应。能量产生、生理意义、丙酮酸去向。四、TCA 循环 乙酰 CoA 的形成,TCA 循环化学途径、能量产生,功能和调节。乙醛酸循环 五、磷酸戊糖途径 发生部位、氧化相反应、功能 六、糖异生 概念、发生
2、部位、与糖酵解比较、底物、几步重要反应、生理意义 七、光合作用 概念,总反应式 光反应;两大光系统的组成(中心色素,电子受体与供体,功能),光合磷酸化以及与氧化磷酸化的比较。暗反应;光反应与暗反应的比较,C3 途径重要的反应,酶和中间物 八、糖原代谢 糖原降解;相关酶;糖原磷酸化酶 糖原合成;相关酶,糖原合成酶,UDP-Glc,需要引物,糖原素 调节 九、脂肪酸代谢 脂肪酸的分解代谢;-氧化,-氧化,-氧化 酮体 脂肪酸的合成代谢 十、胆固醇代谢 胆固醇合成;前体、部位、重要的中间物、HMG-CoA 还原酶 运输;血浆脂蛋白、LDL、HDL 十一、磷脂和糖脂代谢 甘油磷脂的酶水解 十二、蛋白质
3、降解及氨基酸代谢 胞内蛋白质的降解;依赖于 ATP 的降解途径 氨基酸的分解代谢;氨基的去除,铵离子的命运,尿素循环 生物固氮 生化期末重点 2 十三、核苷酸代谢 核苷酸的合成;嘌呤核苷酸、嘧啶核苷酸的合成,从头合成和补救途径。脱氧核苷酸的合成 调节 核苷酸的分解;嘌呤和嘧啶的分解 主要相关疾病 第一章:生物氧化 一、概念 1、生物氧化:糖类、脂肪、蛋白质等有机物质在细胞中进行氧化分解生成 CO2和 H2O 并释放出能量的过程称为生物氧化。其实质是需氧细胞在呼吸代谢过程中所进行的一系列氧化还原反应过程。2、呼吸链:由一系列传递体构成的链状复合体称为电子传递体系(ETS),因为其功能和呼吸作用直
4、接相关,亦称为呼吸链。3、氧化磷酸化:与电子传递偶联在一起的合成 ATP 方式(ADP 被磷酸化)被称为氧化磷酸化。二、生物氧化与非生物氧化反应的比较(1)、共同之处:、反应的本质都是脱氢、失电子或加氧;、被氧化的物质相同,终产物和释放的能量也相同。(2)、不同之处:、生物氧化的主要方式为脱氢;、生物氧化在酶的催化下进行,因此条件比较温和;、生物氧化是在一系列酶、辅酶(辅基)和电子传递体的作用下逐步进行的,每一步释放一部分能量。三、呼吸链 1、组成(1)、NAD+及与 NAD+偶联的脱氢酶,NAD+是一种流动的电子传递体。(2)、黄素及与黄素偶联的脱氢酶 (3)、辅酶 Q,属于一种流动的电子传
5、递体。(4)、铁硫蛋白、细胞色素,细胞色素 c 是一种流动的电子传递体(5)、氧气 2、类型(1)、NADH 呼吸链;位于原核生物的细胞膜和真核生物的线粒体内膜上(2)、FADH2呼吸链;3、呼吸链各组分的排列顺序(1)、测定各成分的标准氧化还原电位(E0)(2)、根据在有氧环境下氧化反应达到平衡时各电子传递体的还原程度来确定 (3)、使用特异性呼吸链抑制剂和人工电子受体 (4)、呼吸链的拆分和重组 4、抑制剂 生化期末重点 3 几种呼吸链抑制剂的作用位点 5、氧化磷酸化的偶联机制(1)、化学偶联假说(2)、构象偶联假说(3)、化学渗透学说 电子在沿着呼吸链向下游传递的时候,释放的自由能转化为
6、跨线粒体内膜(或跨细菌质膜)的质子梯度,质子梯度中蕴藏的电化学势能直接用来驱动 ATP的合成。驱动 ATP合成的质子梯度通常被称为质子驱动力,由化学势能(质子的浓度差)和电势能(内负外正)两部分组成。6、氧化磷酸化的解偶联 线粒体通常是部分解偶联的。解偶联剂的作用机制:快速地消耗跨膜的质子梯度,使得质子难以通过 F1F0-ATP 合酶上的质子通道来合成 ATP,从而将贮存在质子梯度之中的电化学势能转变成热。解偶联剂:(1)、有机小分子化合物:脂溶性的质子载体,带有酸性基团(2)、天然的解偶联蛋白(UCP)。三种解偶联剂的化学结构 生化期末重点 4 解偶联蛋白:UCP(UCP1UCP5)UCP1
7、 又名产热素,与机体的非颤抖性产热有关;UCP2 存在于多数细胞;UCP3 主要存在于骨骼肌;UCP4 和 UCP5 存在于脑。第二章:代谢总论 概念:1、代谢:生命最基本的特征之一,它是指生物体内发生的所有化学反应的总称,包括物质代谢和能量代谢。2、代谢途径:导致某一种物质合成或者分解的一系列反应。(线状、环状或分支状)3、代谢物:在一条代谢途径之中,前一个酶的产物刚好作为后一个酶的底物,很难孤立地把它们归为底物还是产物,一般就称其为代谢物或代谢中间物。4、分解代谢:复杂代谢物转变为简单的代谢物的过程。5、合成代谢:简单的分子变成了复杂的分子,小分子物质变成大分子物质的过程。6、代谢组:也叫
8、做小分子清单,是指反映细胞状态的各种小分子的样式,包括所有代谢过程的总和以及相关的细胞过程。它是基因组和蛋白质组表达对细胞环境的反应。7、代谢组学:研究单个细胞或组织内所有小分子成分及其波动规律的一门学科。第三章:糖酵解 一、糖的消化 淀粉的酶水解:(动物体),(植物体)-淀粉酶:都能水解-1、4 苷键,但不能水解-1、6 苷键。-1、6 葡萄糖苷酶:水解-1、6 苷键 水解任何部位的-1、4 糖苷键产物:糊精、寡糖、少量麦芽糖 水解从非还原端开始产物:麦芽糖、极限糊精 二、糖酵解的全部反应 糖酵解(EMP 途径):是将葡萄糖降解为丙酮酸并伴随着 ATP 生成的一系列反应,是生物体内普遍存在的
9、葡萄糖降解的途径。糖酵解概述:1、发生在所有的活细胞 2、位于细胞液 3、共有十步反应组成在所有的细胞都相同,但速率不同。4、两个阶段:第一个阶段(5 步、消耗 2 个 ATP)投资阶段或引发阶段:葡萄糖 F-1,6-2P 2G-3-P 第二个阶段(5 步、产生 4 个 ATP、2 个 NADH)获利阶段:产生 2 丙酮酸+2ATP 全部反应:第一步:葡萄糖的磷酸化 1、酶:己糖激酶或葡萄糖激酶(需要 Mg2+和其他二价金属离子)已糖激酶 I、II、III 已糖激酶 IV 别名 已糖激酶 葡糖激酶 分布 不同组织 肝脏 底物 Glc、Fru、Man 等 Glc 对 Glc 的亲和力 Km 低,
10、亲和力高 Km 高,亲和力低 生化期末重点 5 抑制 受 G-6-P抑制 不受 G-6-P抑制 用途 糖的分解 糖的合成 2、消耗 1 个 ATP 3、G 是一个大的负值 4、意义:(1)、葡萄糖因此带上负电荷,极性猛增,很难再从细胞中“逃逸”出去;(2)、葡萄糖由此变得不稳定,有利于它在细胞内的进一步代谢。(G-6-P)第二步:葡糖-6-磷酸的异构化 1、酶:磷酸己糖异构酶(既是一种兼职蛋白,还是一种神经生长因子;需要 Mg2+)2、这是一步异构化反应,反应的机制牵涉到不稳定的烯二醇中间体。3、酮基从 1 号位变到 2 号(F-6-P)第三步:磷酸果糖的激活(糖酵解的限速步骤)1、酶:磷酸果
11、糖激酶1(需要 Mg2+)2、有大的自由能降低,受到高度的调控,消耗 1 个 ATP(F-1,6-diP)第四步:果糖-1,6-二磷酸的裂解 1、酶:醛缩酶 第一类:动物内,共价催化,底物与活性中心的赖氨酸残基形成共价的 Schiff 氏碱中间物;第二类:来源于其它生物,其活性中心含有二价的 Zn2,为金属催化 生化期末重点 6 第五步:磷酸丙糖的异构化 酶:磷酸丙糖异构酶(TIM)第六步:甘油醛-3-磷酸的氧化及磷酸化 1、酶:甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)(抑制剂:碘代乙酸、有机汞)辅基:NAD+2、唯一的氧化还原反应 3、产生 1,3-BPG和 NADH 甘油醛-3-磷酸脱氢酶的抑
12、制剂作用机理 第七步:甘油酸-1,3-二磷酸的底物水平磷酸化 1、酶:磷酸甘油酸激酶(需要 Mg2+)生化期末重点 7 2、从高能磷酸化合物合成 2 个 ATP 3、这是一步底物水平的磷酸化反应,可逆的 4、红细胞内存在生成 2,3-BPG的支路 第八步:甘油酸-3-磷酸的异构化 1、酶:磷酸甘油变位酶(需要 Mg2+)第一类:需要微量的甘油酸-2,3-二磷酸(2,3-BPG)作为辅助因子,并需要活性中心的一个His 残基;第二类:不需要 2,3-BPG,其变位实际上是甘油酸-3-磷酸分子内的磷酸基团的转移。2、磷酸基团从 C-3 转移到 C-2 依赖于甘油酸-2,3-二磷酸的磷酸甘油酸变位酶
13、的作用机制 生化期末重点 8 第九步:甘油酸-2-磷酸的烯醇化 酶:烯醇化酶(需要 Mg2+)(抑制剂:氟合物)酶作用:促进甘油酸-2-磷酸上某些原子的重排形成具有较高的磷酸转移势能的高能分子。(PEP)第十步:烯醇式丙酮酸的底物水平化磷酸化 1、酶:丙酮酸激酶(需要 Mg2+和 K+)2、产生 2 个 ATP 3、第二步底物水平磷酸化反应 4、G 为大的负值受到调控 生化期末重点 9 糖酵解的全部反应 两步底物水平磷酸化反应:第七步和第十步。三、能量的产生 无氧情况下:GG-6-P -1ATP F-6-P F-1,6-dip -1ATP 2 1,3-二磷酸甘油酸2甘油酸-3-磷酸 +2ATP
14、 2PEP2Py +2ATP 净增 2ATP 除 2 分子 ATP 外,还生成 2 分子 NADH 四、糖酵解的生理意义 1、产生 ATP;2、提供生物合成的原料;3、糖酵解与肿瘤;4、缺氧与缺氧诱导的转录因子;5、为糖的彻底降解作了准备;6、不仅是葡萄糖的降解途径,也是其它一 些单糖的分解代谢途径。五、丙酮酸的去向 1、有氧条件下:丙酮酸经过线粒体内膜上丙酮酸运输体与质子一起进入线粒体基质,被基质内的丙酮酸脱氢酶系氧化成乙酰 CoA。生化期末重点 10 2、无氧条件下:(1)乳酸发酵(2)酒精发酵 丙酮酸的代谢去向 第四章:TCA 循环 一、乙酰 CoA 的形成 1、脂肪酸的氧化 2、氨基酸
15、的氧化分解 3、丙酮酸的氧化脱羧由丙酮酸脱氢酶系催化 丙酮酸的氧化脱羧分四步:E1、Py+TPP 羟乙基-TPP+CO2 OX、羟乙基-TPP 乙酰基-硫辛酰胺 E2 E2、乙酰基-硫辛酰胺CoA 乙酰 CoA+硫辛酰胺 E3、Red 型硫辛酰胺 OX 型硫辛酰胺 二、三羧酸循环的全部反应 第一步:柠檬酸的合成 1、酶:柠檬酸合酶 2、柠檬酸合酶:由两个相同的亚基组成,它被视为酶“诱导契合”学说又一代表性的例子。HNADHSSFADNADSHSFADH2 生化期末重点 11 柠檬酸合酶催化的反应 氟代乙酸是三羧酸循环强烈的抑制剂。第二步:异柠檬酸的形成 酶:顺乌头酸酶(使用铁硫蛋白)第三步:异
16、柠檬酸的氧化脱羧 1、酶:异柠檬酸脱氢酶 2、分为两步:、脱氢,形成草酰琥珀酸;、-脱羧产生 CO2和 -酮戊二酸 3、有两种形式的异柠檬酸脱氢酶,分别使用辅酶 I 和辅酶 II 作为氢的受体 总反应 生化期末重点 12 分步反应 第四步:-酮戊二酸的氧化脱羧 1、酶:-酮戊二酸脱氢酶系 2、5 种辅酶TPP、CoASH、硫辛酸、NAD+、FAD 3、亚砷酸可抑制此反应 第五步:底物水平的磷酸化 1、酶:琥珀酰-CoA 合成酶 2、TCA 循环唯一的一步底物水平磷酸化反应 3、ATP 或 GTP 被合成 第六步:琥珀酸的脱氢 1、酶:琥珀酸脱氢酶(呼吸链复合体 II 的主要成分)2、丙二酸是琥
17、珀酸脱氢酶的竞争性抑制剂 生化期末重点 13(延胡索酸)第七步:苹果酸的形成 1、酶:延胡索酸酶(富马酸酶)2、是水合反应 第八步:草酰乙酸的再生 酶:苹果酸脱氢酶 三、TCA 循环总结:总反应:乙酰-CoA+3NAD+FAD+GDP+Pi+2H2O2CO2+3NADH+FADH2+GTP+2H+CoA 1、1 个乙酰-CoA 通过三羧酸循环产生 2 分子 CO2,1 分子 ATP,3 分子 NADH,1 分子 FADH2 2、2 分子 H2O 被使用作为底物 3、绝对需要 O2 四、TCA 循环的生理功能 1、产生更多的 ATP(1 对 H 走 NAD 呼吸链产生 2.5 个 ATP;走 F
18、AD 呼吸链产生 1.5 个 ATP)2、提供生物合成的原料 3、是糖、氨基酸和脂肪酸最后的共同分解途径 4、某些代谢中间物作为其它代谢途径的别构效应物 5、产生 CO2 生化期末重点 14 完整的三羧酸循环 五、TCA 循环的调节 1、调节位点:(1)、柠檬酸合酶(限速酶)草酰乙酸+乙酰 CoA柠檬酸,柠檬酸合酶,限速酶,受琥珀酰 CoA、NADH、ATP 和脂酰CoA 的抑制。(2)、异柠檬酸脱氢酶 异柠檬酸-酮戊二酸,异柠檬酸脱氢酶,ADP 是别构激活剂,ATP 和 NADH 是抑制剂。(3)、酮戊二酸脱氢酶-酮戊二酸琥珀酰 CoA,-酮戊二酸脱氢酶被反应产物琥珀酰 CoA 和 NADH
19、 抑制,也被高的能荷抑制。2、底物和产物对三羧酸循环的调节 三羧酸循环中最主要的调控物质是底物乙酰 CoA 和草酰乙酸(在线粒体内),以及它的产物NADH。3、Ca2+对三羧酸循环的调节 (1)、激活丙酮酸脱氢酶磷酸酶,从而激活丙酮酸脱氢酶复合物,产生乙酰 CoA;(2)、激活异柠檬酸脱氢酶和-酮戊二酸脱氢酶;生化期末重点 15(3)、Ca2+不仅是刺激肌肉收缩的信号,而且也促进 ATP 的生成,以提供能量。六、乙醛酸循环 1、在每一轮循环中,前者有两分子乙酰-CoA 进入 2、只产生 NADH,但不产生 FADH2 3、无底物水平磷酸化反应,因此 不产生 ATP 4、不生成 CO2,无碳单位
20、的损失,净合成了糖异生的前体苹果酸 乙醛酸循环与三羧酸循环的比较 第五章:磷酸戊糖途径(PPP)一、发生部位:细胞液 二、氧化相 由三步不可逆的反应组成:第一步:葡糖-6-磷酸的脱氢 1、酶:葡糖-6-磷酸脱氢酶(对 NADP+高度特异性;对 NAD+的 Km 比对 NADP+高 1000 倍)2、受到 NADPH 抑制 生化期末重点 16 第二步:葡萄糖酸内酯的水解 1、酶:葡糖酸内酯酶 2、没有酶催化,也能发生 第三步:6-磷酸葡糖酸的脱氢 1、酶:6-磷酸葡糖酸脱氢酶 2、氧化脱羧反应 三、磷酸戊糖途径的功能 1、与 NADPH 有关的功能(1)、提供生物合成的还原剂 NADPH (2)
21、、解毒细胞色素 P450 单加氧酶解毒系统需要 NADPH 参与对毒物的羟基化反应。(3)、免疫(4)、维持红细胞膜的完整 (5)、间接进入呼吸链 2、与核糖-5-磷酸有关的功能 提供核苷酸衍生物合成的前体核糖-5-磷酸 3、与赤藓糖-4-磷酸有关的功能及其 芳香族氨基酸和维生素 B6 的合成需要赤藓糖。第六章:糖异生 一、概念 泛指细胞内由乳酸或其它非糖物质净合成葡萄糖的过程。生化期末重点 17 二、发生部位 它主要发生在动物的肝脏(80)和肾脏(20),是动物细胞自身合成葡萄糖的唯一手段。植物和某些微生物也可以进行糖异生。三、糖异生与糖酵解的比较 并不是糖酵解的简单逆转,原因是:1、糖酵解
22、有三步不可逆反应 2、机体在对这两种代谢实行交互调控的时候不允许它们同时被激活或被抑制,否则就会陷入无效循环之中。糖异生与糖酵解途径的比较 四、糖异生的底物(前体物质)丙酮酸,乳酸,甘油,生糖氨基酸,奇数脂肪酸、所有 TCA 循环的中间物 不能用的物质:偶数脂肪酸、乙酰 CoA 和严格的生酮氨基酸(Leu 和 Lys)五、糖异生中几步重要反应和酶 第一步:丙酮酸转变为草酰乙酸 1、酶:丙酮酸羧化酶 2、糖异生的第一步反应 3、存在于线粒体基质,需要生物素辅基 4、由 ATP 驱动羧化反应 生化期末重点 18 丙酮酸羧化酶的作用机理 第二步:草酰乙酸转变为磷酸烯醇式丙酮酸(PEP)1、酶:PEP
23、 羧激酶(PEPCK)2、PEPCK 在人类的线粒体基质和细胞液均存在,而小鼠只存在于细胞液,兔子只存在于线粒体。3 如果 PEPCK 存在于线粒体基质,则生成的 PEP 可以直接通过内膜上专门的运输体运出线粒体;但是,如果 PEPCK 存在于细胞液,则首先需要通过特殊的转运系统,将不能直接透过线粒体内膜的草酰乙酸先转变成能够通过内膜的苹果酸或天冬氨酸运出线粒体,然后在细胞液按照逆反应的方向重新转变为草酰乙酸。磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶的作用机理 第三步:果糖-1,6-二磷酸水解为果糖-6-磷酸(不可逆反应)生化期末重点 19 酶:果糖-1,6-二磷酸酶 第四步:葡糖-6-磷酸水解为葡萄糖(不可逆
24、反应)1、酶:葡糖-6-磷酸酶 2、存在于肝、肾细胞内质网膜上。3、肌肉和脑细胞没有这种酶,故不能进行糖异生 4、G-6-P需要进入内质网腔才能水解 六、糖异生的生理意义 1、补充血糖,维持血糖浓度的稳定。2、减轻或消除代谢性酸中毒。3、能使某些植物和微生物以乙酸作为唯一碳源。第七章:光合作用 一、概念 生物利用太阳光能合成有机分子的过程。二、光合作用的总反应式:光 CO2+2H2A(CH2O)+H2O+2A 叶绿素 光 CO2+2H2O(CH2O)+H2O+O2 叶绿素 三、光反应阶段:光能化学能 H2OO2 H+,e-;ATP,NADPH 四、光系统(PS):组织在类囊体膜上的独立的色素单
25、位 光系统(PS)的组分 1、PS I:(1)200 或者更多的叶绿素 a(2)少量的叶绿素 b(3)与蛋白质结合的类胡萝卜素(4)一对特殊的叶绿素 a(中心色素,被称为 P700)生化期末重点 20(5)初级电子受体(A0)2、PS II:(1)叶绿素 a(2)与蛋白质结合的 -胡萝卜素(3)少量的叶绿素 b(4)一对特殊的叶绿素 a(中心色素,被称为 P680)(5)初级电子受体脱镁叶绿素 光系统(PS-):作用中心叶绿素为 P700,激发波长是 680700nm,激发 后产生强还原剂和弱氧化剂,还原剂导致 NADPH 的产生。光合系统 光系统(PS-):作用中心叶绿素为 P680,激发波
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