核酸代谢2学习教案.pptx
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1、会计学 1核酸(h sun)代谢2第一页,共64页。核酸的降解(jin ji)过程核酸酶(磷酸二酯酶)核苷酸酶(磷酸单酯酶)核苷磷酸化酶核酸核苷酸核苷 磷酸嘌呤或嘧啶 戊糖-1-磷酸第1页/共63页第二页,共64页。核酸酶:作用于核酸的磷酸二酯酶称为核酸酶,按其作用位置分为(fn wi):一.核酸外切酶:作用于核酸链的末端(3端或5端),逐个水解下核苷酸。脱氧核糖核酸外切酶:只作用于DNA 核糖核酸外切酶:只作用于RNA二.核酸内切酶:从核酸分子内部切断3,5-磷酸二酯键。l限制性内切酶:在细菌细胞内存在的一类(y li)能识别并水解外源双链DNA的核酸内切酶,可用于特异切割DNA,常作为工具
2、酶。第2页/共63页第三页,共64页。某些(mu xi)核酸外切酶对RNA、DNA均有作用:牛脾磷酸二酯酶3-核苷酸蛇毒(sh d)磷酸二酯酶5-核苷酸第3页/共63页第四页,共64页。第二节 核苷酸的分解代谢一、核酸的分解 核苷酸+H2O 核苷+Pi 核苷+H2O 嘌呤(或嘧啶)+戊糖(核苷水解酶主要(zhyo)存在于植物和微生物体内,并且只能对核糖核苷起作用,对脱氧核糖核苷不起作用。)核苷+H3PO4 嘌呤(或嘧啶)+1-磷酸戊糖(核苷磷酸化酶存在广泛)核苷酸酶核苷水解酶核苷磷酸化酶第4页/共63页第五页,共64页。二、嘌呤(piolng)的降解:这是一个氧化降解过程,不同生物降解的产物不
3、同。第5页/共63页第六页,共64页。腺嘌呤 腺嘌呤 鸟嘌呤 鸟嘌呤 H2O H2O H2O H2O NH3 NH3 NH3 NH3 次黄嘌呤 次黄嘌呤 黄嘌呤 黄嘌呤 H2O+O2 H2O2 H2O+O2 H2O+O2 H2O2 H2O+O2 H2O2 H2O2 尿囊素 尿囊素 尿酸 尿酸 H2O CO2+H2O2 2H2O+O2 H2O CO2+H2O2 2H2O+O2 尿囊酸 尿囊酸 尿素 尿素(nio s)+(nio s)+乙醛酸 乙醛酸 H2O 2H2O H2O 2H2O 4NH3+2CO2 4NH3+2CO2(人类(rnli)和灵长类动物、爬虫、鸟类)(灵长类以外(ywi)的哺乳动
4、物)(植物)(鱼类、两栖类)(海洋无脊椎动物)腺嘌呤脱氨酶鸟嘌呤脱氨酶黄嘌呤氧化酶黄嘌呤氧化酶尿酸氧化酶尿囊素酶尿囊酸酶脲酶别嘌呤醇:别黄嘌呤底物类似物经酶作用后成为酶的灭活物,称之为自杀作用物。自杀性底物第6页/共63页第七页,共64页。三、嘧啶三、嘧啶(m dn)(m dn)的降解:这是一个还原降解过程。的降解:这是一个还原降解过程。胞嘧啶胞嘧啶(m dn)(m dn)尿嘧啶尿嘧啶(m dn)(m dn)二氢尿嘧啶二氢尿嘧啶(m dn)(m dn)H2O NH3 NAD(P)H+H+H2O NH3 NAD(P)H+H+NAD(P)+H2ONAD(P)+H2O-丙氨酸丙氨酸-脲脲基丙酸基丙酸
5、 H2O H2O 胸腺嘧啶胸腺嘧啶(m dn)(m dn)二氢胸腺嘧啶二氢胸腺嘧啶(m(m dn)dn)NAD(P)H+H+NAD(P)+H2O NAD(P)H+H+NAD(P)+H2O-氨基异丁酸氨基异丁酸-脲基异丁酸脲基异丁酸 H2O H2O 胞嘧啶脱氨酶二氢尿嘧啶脱氢酶二氢嘧啶(m dn)酶脲基丙酸酶二氢尿嘧啶脱氢酶二氢嘧啶(m dn)酶脲基丙酸酶NH3+CO2+NH3+CO2+第7页/共63页第八页,共64页。第三节 核苷酸的合成(hchng)一、嘌呤(piolng)核苷酸的生物合成1N:来源于天冬氨酸 2、8C:来源于甲酸 3、9N:来源于谷氨酰胺4、5C和7N:来自甘氨酸 6C:来
6、自CO2第8页/共63页第九页,共64页。PRPPIMPFH4第9页/共63页第十页,共64页。IMP+Asp延胡索酸+AMP GTP GDP+Pi腺苷酸的合成(hchng)腺苷酸琥珀酸合成酶腺苷酸琥珀酸裂解(li ji)酶羽田杀菌(sh jn)素(Asp的类似物)第10页/共63页第十一页,共64页。鸟苷酸的形成(xngchng)谷氨酰胺谷氨酸IMP XMP GMPATP AMP+PPi H2ONAD+NADH+H+脱氢酶合成酶第11页/共63页第十二页,共64页。嘌呤(piolng)核苷酸的生物合成(从头合成):n n 嘌呤核苷酸的合成结果 嘌呤核苷酸的合成结果(ji gu)(ji gu)
7、直接形成 直接形成IMP IMPn n IMP IMP合成从 合成从5 5-P-P-核糖开始的,在 核糖开始的,在ATP ATP参与下先形成 参与下先形成PRPP PRPPn n 嘌呤的各个原子是在 嘌呤的各个原子是在PRPP PRPP的 的C1 C1上逐渐加上去的。由 上逐渐加上去的。由Asp Asp、Gln Gln、Gly Gly、甲酸、甲酸、CO2 CO2 提供 提供N N和 和C Cn n 四氢叶酸(四氢叶酸(FH4 FH4)是一碳单位的载体)是一碳单位的载体n n 第12页/共63页第十三页,共64页。嘧啶核苷酸的嘧啶环是由氨甲酰磷酸(ln sun)和天冬氨酸合成的。二、嘧啶核苷酸的
8、生物(shngw)合成氨甲酰磷酸(ln sun)天冬氨酸第13页/共63页第十四页,共64页。n尿苷酸的生物(shngw)合成其合成与嘌呤(piolng)核苷酸的合成不同,先利用小分子化合物形成嘧啶环,再与核糖磷酸(PRPP)结合形成UMP,其关键的中产物是乳清酸。其他嘧啶核苷酸由尿苷酸转变而来第14页/共63页第十五页,共64页。胞苷酸的生物合成(hchng)UMP UDP UTP ATP ADP ATP ADP UTP+NH3+ATP CTP+ADP+Pi(细菌体内)在动物体内,由谷氨酰胺代替氨参加反应提供氨基 UTP+谷氨酰胺+ATP+H2O CTP+谷氨酸+ADP+Pi CTP合成酶M
9、g2+尿嘧啶核苷酸激酶(jmi)核苷二磷酸激酶CTP合成酶第15页/共63页第十六页,共64页。三、脱氧核糖核苷酸的生物合成(大肠杆菌、动物(dngw)、植物)NMP+ATP NDP+ADP NDP 核糖核苷二磷酸还原酶 dNDP SH S 硫氧还蛋白 硫氧还蛋白 SH S(FAD)硫氧还蛋 白还原酶 NADP+NADPH+H+(dADP、dGDP、dCDP、dUDP)激酶(jmi)B1 B2dATP dGTPdCTP dUTP激酶(jmi)第16页/共63页第十七页,共64页。其它(qt)原核细胞中:n n NTP dNTPn n 到目前为止,脱氧核糖核苷酸的生物合成(hchng)机制仍然不
10、太清楚VB12、二氢硫辛酸还原剂第17页/共63页第十八页,共64页。n n 胸腺嘧啶脱氧核苷酸(胸腺嘧啶脱氧核苷酸(dTMPdTMP)的合成)的合成(hchng)(hchng)n n dUDP+H2O dUMP+Pi dUDP+H2O dUMP+Pin n n n dCMP+H2O dUMP+Pi dCMP+H2O dUMP+Pin n n n 胸腺嘧啶核苷酸合酶胸腺嘧啶核苷酸合酶n n dUMP dTMP dUMP dTMPn n n n N5,10 N5,10亚甲基四氢叶酸亚甲基四氢叶酸 二氢叶酸二氢叶酸酯酶脱氨酶甲基化第18页/共63页第十九页,共64页。n n 辅酶(f mi)核苷酸
11、的生物合成CoA NAD+NADP+FAD第19页/共63页第二十页,共64页。DNA 的生物(shngw)合成第20页/共63页第二十一页,共64页。DNA是生物遗传的主要物质基础,生物机体的遗传信息以密码的形式编码在DNA分子上,表现为特定的核苷酸排列顺序,并通过DNA的复制由亲代传递给子代(zdi)。在后代的生长发育过程中,遗传信息自DNA转录给RNA,然后翻译成特异的蛋白质,以执行各种生命功能,使后代表现出与亲代相似的遗传性状。中 心 法 则1964-1970 劳氏肉瘤病毒(bngd)的遗传方式致癌RNA病毒(bngd)病毒(复制)复制转录DNA RNA 蛋白质翻译逆转录1958年,遗
12、传信息的单向(dn xin)第21页/共63页第二十二页,共64页。复制:亲代DNA或RNA在一系列酶的作用下,生成与亲代相同的子代DNA或RNA的过程。转录:以DNA为模板,按照碱基配对原则将其所含的遗传信息传给RNA,形成一条与DNA链互补(h b)的RNA的过程。翻译:亦叫转译,以mRNA为模板,将mRNA的密码解读成蛋白质的AA顺序的过程。逆转录:以RNA为模板,在逆转录酶的作用下,生成DNA的过程。Reverse transcription第22页/共63页第二十三页,共64页。一、DNA的复制方式(fngsh)半保留复制定义:由亲代DNA生成子代DNA时,每个新形成的子代DNA中,
13、一条链来自亲代DNA,而另一条链则是新合成的,这种复制方式(fngsh)叫半保留复制半保留复制的实验证据:1958年Meselson和Stahl用同位素15N标记大肠杆菌DNA,首先证明了DNA的半保留复制。第23页/共63页第二十四页,共64页。DNA的半保留复制(fzh)的生物学意义:n n DNA的半保留复制表明DNA在代谢上的稳定性,保证亲代的遗传信息稳定地传递(chund)给后代。n n n n DNA在代谢上的稳定性并非指DNA是一种惰性物质。第24页/共63页第二十五页,共64页。二、与DNA复制有关的酶和蛋白质 原料:四种脱氧核苷三磷酸(dATP、dGTP、dCTP、dTTP)
14、模板(mbn):以DNA的两条链为模板(mbn)链,合成子代DNA。引物:一小段RNA(或DNA)为引物,在大肠杆菌 中,DNA的合成需要一段RNA链作为引物。第25页/共63页第二十六页,共64页。n 催化因子n 1.引物合成酶(引发酶):此酶以DNA为模板合成一段RNA,这段RNA作为合成DNA的引物(Primer)。实质是以DNA为模板的RNA聚合酶。n 2.DNA聚合酶:以DNA为模板的DNA合成酶,其催化反应的特点(1)以四种脱氧核苷酸三磷酸(ln sun)为底物;(2)反应需要有模板的指导;(3)反应需要有3-OH存在;n(4)DNA链的合成方向为5 3 生物大分子合成(hchng
15、):底物、酶、能量、模板第26页/共63页第二十七页,共64页。(5)DNA聚合酶的反应(fnyng)可以利用DNA双链作为模板和引物,亦可以单链DNA作为模板和引物(6)DNA的体外聚合必须加入少量的DNA才能进行(jnxng)。DNA在提取过程中易形成切口(nick)或缺口(gap).则加入的DNA一条链作为模板而另一条链可作为引物。第27页/共63页第二十八页,共64页。原核(yun h)生物中的DNA聚合酶在大肠杆菌中发现有三种 在大肠杆菌中发现有三种DNA DNA聚合酶(用突变株研究其功能):聚合酶(用突变株研究其功能):DNA DNA聚合酶 聚合酶:单体酶 单体酶,它具有 它具有5
16、 5 3 3 聚合酶功能(对脱氧核 聚合酶功能(对脱氧核苷酸的选择);苷酸的选择);3 3 5 5外切酶活性(对双链无作用,校对 外切酶活性(对双链无作用,校对(jio du)(jio du)功能。但在正常聚合条件下,此活性不能作用于生长 功能。但在正常聚合条件下,此活性不能作用于生长链)及 链)及5 5 3 3外切酶活性(双链有效,主要是对 外切酶活性(双链有效,主要是对DNA DNA损伤的修 损伤的修复,以及在 复,以及在DNA DNA复制时 复制时RNA RNA引物切除及其空隙的填补);在 引物切除及其空隙的填补);在DNA DNA链的 链的3 3 形成焦磷酸解(生理意义不大);无机焦磷
17、酸盐与 形成焦磷酸解(生理意义不大);无机焦磷酸盐与dNTP dNTP之间的 之间的焦磷酸基交换。焦磷酸基交换。DNA DNA聚合酶 聚合酶:多亚基酶,聚合作用,但聚合活力很低;具:多亚基酶,聚合作用,但聚合活力很低;具有 有3 3 5 5外切酶活性。其它生理功能尚不清楚,可能在修复紫 外切酶活性。其它生理功能尚不清楚,可能在修复紫外光引起的 外光引起的DNA DNA损伤中起作用。损伤中起作用。第28页/共63页第二十九页,共64页。DNA聚合酶:是原核生物DNA复制的主要聚合酶,该酶由10种亚基组成,其中、形成全酶的核心酶。具有53DNA聚合酶活性(亚基,速率高);具有3 5外切酶(亚基)的
18、校对功能,提高(t go)DNA复制的保真性;还具有5 3外切酶活性(单链有效,其意义未知)。(4)DNA聚合酶IV和V:1999年发现,当DNA严重损伤时,诱导产生。第29页/共63页第三十页,共64页。DNA聚合酶 DNA聚合酶 DNA聚合酶 亚基数目 1(单体酶)1(多亚基酶)1(多亚基酶)5 3聚合活性+中+很低+很高3 5外切(wi qi)活性+(保护DNA复制的忠实性fidelity)5 3外切(wi qi)活性+-主要是对DNA损伤的修复;以及在DNA复制时切除(qich)RNA引物并填补其留下的空隙。修复(xif)紫外光引起的DNA损伤DNA 复制的主要聚合酶,还具有3-5 外
19、切酶的校对功能,提高DNA复制的保真性第30页/共63页第三十一页,共64页。在真核细胞内有五种在真核细胞内有五种DNADNA聚合酶聚合酶(与细菌(与细菌(xjn)DNA(xjn)DNA聚聚合酶的性质基本相同:底物、模板、引物、方向)合酶的性质基本相同:底物、模板、引物、方向)定位定位 细胞核细胞核 细胞核细胞核 线粒体线粒体 细胞核细胞核 细胞核细胞核3-53-5外切外切-+-+酶活性酶活性功能功能引物 合成(hchng)修复(xif)作用线粒体DNA的复制核DNA的复制修复作用第31页/共63页第三十二页,共64页。3.DNA 3.DNA连接酶(连接酶(19671967年发现):若双链年发
20、现):若双链DNADNA中一条链有切中一条链有切口,一端口,一端(ydun)(ydun)是是3-OH3-OH,另一端,另一端(ydun)(ydun)是是5-5-磷酸基,磷酸基,连接酶可催化这两端形成磷酸二酯键,而使切口连接。连接酶可催化这两端形成磷酸二酯键,而使切口连接。但是它不能将两条游离的但是它不能将两条游离的DNADNA单链连接起来。单链连接起来。大肠杆菌和其它细菌的大肠杆菌和其它细菌的DNADNA连接酶要求连接酶要求NAD+NAD+提供能量,提供能量,在高等生物和噬菌体中,则要求在高等生物和噬菌体中,则要求ATPATP提供能量。提供能量。T4T4噬菌体噬菌体的的DNADNA连接酶不仅能
21、在模板链上连接连接酶不仅能在模板链上连接DNADNA和和DNADNA链之间链之间的切口,而且能连接无单链粘性末端的平头双链的切口,而且能连接无单链粘性末端的平头双链DNADNA。DNADNA连接酶在连接酶在DNADNA复制、损伤修复、重组等过程中起重要复制、损伤修复、重组等过程中起重要作用作用作用作用3535OH P第32页/共63页第三十三页,共64页。拓扑异构酶拓扑异构酶:使:使DNADNA一条链发生断裂和再连接。作用是一条链发生断裂和再连接。作用是松解松解(sn ji)(sn ji)负超螺旋,反应不需要能量。主要集中在负超螺旋,反应不需要能量。主要集中在活性转录区,同转录有关。活性转录区
22、,同转录有关。拓扑异构酶 拓扑异构酶:使:使DNA DNA两条链发生断裂和再连接 两条链发生断裂和再连接(linji)(linji)。当引入负超螺旋时需要由 当引入负超螺旋时需要由ATP ATP提供能量,同复制有关。提供能量,同复制有关。二者共同控制 二者共同控制DNA DNA的拓扑结构。的拓扑结构。5 5、解螺旋酶、解螺旋酶(解链酶):通过水解(解链酶):通过水解ATP ATP将 将DNA DNA两条链打开。两条链打开。E.coli E.coli中的 中的rep rep蛋白就是解螺旋酶,还有解螺旋酶 蛋白就是解螺旋酶,还有解螺旋酶I I、II II、III III。每解开一对碱基需要水解。每
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