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1、会计学 1核酸(hsun)B第一页,共45 页。2、RNAase牛胰核糖核酸酶(pancreaticribonuclease)RNaseI或RNaseA最适pH:7.0-8.2产物:3-嘧啶核苷酸或3-嘧啶核苷酸结尾的寡核苷酸,高度专一的内切酶RNaseT1耐热(nair)、耐酸产物:3-鸟苷酸或3-鸟苷酸结尾的寡核苷酸,专一性更高第1 页/共44 页第二页,共45 页。内切核酸酶对RNA的水解(shuji)位点示意图5p p p p OHPy Pu Py Py1p p pG A C Up p pG A3RNAaseIRNAaseIRNAaseT1RNAaseT1Pu:嘌呤(piolng)Py
2、:嘧啶第2 页/共44 页第三页,共45 页。3、DNase牛胰脱氧核糖核酸酶,DNaseI无碱基专一性,切断(qidun)双链或单链DNA产物:以5-磷酸为末端的寡核苷酸,最适pH78牛脾脱氧核糖核酸酶,DNase 无碱基专一性,产物:以3-磷酸为末端的寡核苷酸,最适pH45DNA限制性内切酶第3 页/共44 页第四页,共45 页。外切(wi qi)核酸酶对核酸的水解位点5p p p pOHBp p pp3BB BBB B B牛脾磷酸二酯酶(5 端外切(wiqi)5 得3)蛇毒(shd)磷酸二酯酶(3 端外切3 得5)4 非专一性核酸酶类可作用于RNA 或 DNA第4 页/共44 页第五页,
3、共45 页。二 核酸(h sun)的紫外吸收1天然(tinrn)DNA2变性DNA3核苷酸总吸收值220 240 260 2800.10.20.30.4波长(nm)光吸收123DNA的紫外吸收光谱(x shu un p)最大吸收峰为260 nm第5 页/共44 页第六页,共45 页。三 核酸的变性(binxng)、复性及杂交(一)变性(binxng)DNA的变性(binxng)过程部分(b fen)双螺旋解开 无规则线团 链内碱基配对在物理、化学因素影响下,DNA碱基对间的氢键断裂,双螺旋解开,这是一个是跃变过程,伴有A260增加(增色效应),DNA的功能丧失。第6 页/共44 页第七页,共4
4、5 页。变性因素:热变性 酸碱变性(pH 小于4 或大于11)变性剂(尿素、盐酸胍、甲醛)变性后的理化性质:260nm 吸收值升高。粘度降低(jingd),浮力密度升高。二级结构改变,部分失活。第7 页/共44 页第八页,共45 页。增色效应与减色效应增色效应:在DNA的变性(binxng)过程中,摩尔吸光系数增大减色效应:在DNA的复性过程中,摩尔吸光系数减小。DNA 的变性是爆发式的,变性作用(zuyng)发生在一个很 窄的温度范围内。第8 页/共44 页第九页,共45 页。1 Tm:熔解(rn ji)温度(melting temperature)Polyd(A-T)DNA Polyd(G
5、-C)DNA的变性发生在一个很窄的温度范围内,通常把热变性过程中A260达到最大值一半时的温度称为 该 DNA的 熔 解(rn ji)温度,用Tm表示。某些DNA的Tm值60 80 1001.01.41.2100%A260t0CTm Tm Tm12 312 3第9 页/共44 页第十页,共45 页。熔解温度(Tm)浓度50ug/mL时,双链DNAA260=1.00,完全变性(单链)A260=1.37当A260增加到最大增大(znd)值一半时,即1.185时,对应的温度即为Tm。DNA的Tm一般在8295 之间第10 页/共44 页第十一页,共45 页。2、影响(yngxing)DNA的Tm值的
6、因素DNA均一性。均一性高,变性的温度(wnd)范围越窄,据此可分析DNA的均一性。第11 页/共44 页第十二页,共45 页。G-C含量与Tm值成正比。测定(cdng)Tm,可推知G-C含量。G-C%=(Tm-69.3)2.44第12 页/共44 页第十三页,共45 页。介质中离子(lz)强度离子(lz)强度高,Tm高。第13 页/共44 页第十四页,共45 页。(二)复性(f xn)在一定条件(tiojin)下,变性DNA单链间碱基重新配对恢复双螺旋结构,伴有A260减小(减色效应),DNA的功能恢复。第14 页/共44 页第十五页,共45 页。热变性DNA 在缓慢冷却时可 以复性,快速(
7、kuis)冷却不能复性。DNA 片段越大,复性越慢;DNA 浓度越大,复性越快。复性速度可用Cot 衡量。第15 页/共44 页第十六页,共45 页。Cot 是Co 与 t 的乘积,Co 为变性DNA(复性前)的原始(yunsh)浓度,以摩尔浓度(mol/L)表示,t为复性时间,以秒(s)表示。复性分数 f=1/1+kCot Cot 是指复性完成一半时的Cot值。第16 页/共44 页第十七页,共45 页。不同DNA 的复性(fxn)动力学曲线。第17 页/共44 页第十八页,共45 页。(三)分子(fnz)杂交第18 页/共44 页第十九页,共45 页。分子(fnz)杂交的原理示意图不同来源
8、的DNA单链间或单链 DNA与 RNA之间只要有碱基配对的区域,在复性时可形成局部双螺旋区,称核酸分 子 杂 交(hybridization)制备(zhbi)特 定 的 探 针(probe)通过杂交技术可进行基因的检测和定 位 研 究。实 例:southern印迹法第19 页/共44 页第二十页,共45 页。Southern印迹(yn j)法限制(xinzh)片段限制性酶切割(qig)琼脂糖电泳转移至硝酸纤维素膜上与放射性标记DNA探针杂交放射自显影用缓冲液转移DNA吸附有DNA片段的膜带有DNA片段的凝胶凝胶滤膜第20 页/共44 页第二十一页,共45 页。四 核酸的沉降(chnjing)特
9、性与超速离心沉降系数(S)生 物 大 分 子 在 单 位(dnwi)离 心 力 场 作 用 下 的 沉 降 速 度称 为 沉 降 系 数。即 沉 降 系 数 是 微 颗 粒 在 离 心 力 场 的 作 用下,从 静 止 状 态 到 达 极 限 速 度 所 需 要 的 时 间。其 单 位(dnwi)用Svedberg,即s 表示,s=110-13 秒。沉降系数(S)与分子量(M)的关系(gun x)M=RTsD(1-)Svederg方程:第21 页/共44 页第二十二页,共45 页。不同构象的核酸(线形、环形、超螺旋),密度和沉降速率不同,用Cs-Cl 密度梯度离心可以将不同构象DNA、RNA
10、与蛋白质区分开来这一方法常用(chnyn)于质粒DNA 的纯化。第22 页/共44 页第二十三页,共45 页。第四节 核酸(h sun)的分离,合成,鉴定和序列测定 一 分离,纯化和定量尽 可 能 保 持 其 天 然 状 态,防 止(fngzh)降 解 和 变性。条件温和,防止(fngzh)过酸、过碱、剧烈搅拌。抑制核酸酶。第23 页/共44 页第二十四页,共45 页。真核DNA以核蛋白(DNP)形式(xngsh)存在,DNP溶于水或高盐溶液(1mol/LNaCl),但不溶于低盐溶液(0.14mol/LNaCl),据此,采用高盐提取,低盐沉淀,可将DNP与RNA核蛋白分开,提取出DNP。DNP
11、可用水饱和的酚抽提,去除蛋白质。还可用氯仿异戊醇去除蛋白质。水相中的DNA可被0.3MNaAC-70%乙醇沉淀 DNA分离(fnl)纯化第24 页/共44 页第二十五页,共45 页。紫外分光(fnun)光度法(A260)定磷法(DNA含磷9.2%,RNA含磷9.0%)定糖法(DNA;二苯胺法,RNA;苔黑酚法)(三)核酸(h sun)的定量 第25 页/共44 页第二十六页,共45 页。二 DNA的化学合成:合成(hchng)方向:35端5-OH用二对甲氧三苯甲基(DMT)保护。3-OH用氨基亚磷酸化合物活化碱基上氨基用苯甲酸保护第26 页/共44 页第二十七页,共45 页。三 一级结构(ji
12、gu)的测定(1)双脱氧终止法英国Sanger1955 确 定 牛 胰 岛 素 结 构(jigu),1958 获 诺 贝 尔 化学奖1975 设计出DNA 测序法,1980 获诺贝尔化学奖合成一段与待测DNA 序列互补的DNA 片段群。第27 页/共44 页第二十八页,共45 页。第28 页/共44 页第二十九页,共45 页。第29 页/共44 页第三十页,共45 页。第30 页/共44 页第三十一页,共45 页。MOV:MCB4.0DideoxysequencingofDNA第31 页/共44 页第三十二页,共45 页。第32 页/共44 页第三十三页,共45 页。(2)化学裂解法Maxam
13、-Gilbert,1977原理:利 用 特 异 性 的 化 学 裂 解 法,制 备 出 长 度 只 差 一 个 核苷 酸 的 片 段(pin dun)群,然 后 将 此 片 段(pindun)群经侧序胶电泳和放射自显影得到侧序图谱。32P-GCTACGTA:在A 处:32P-GCT 和32P-GCTACGT在G 处:32p,32p-GCTAC在C 处:32P-G 和32P-GCTA在T 处:32P-GC 和32P-GCTACG第33 页/共44 页第三十四页,共45 页。第五节 核酸(h sun)的生物学功能和实践意义 一 核酸(h sun)与遗传信息的传递和表达(一)DNA是基本遗传物质19
14、44,O.Avery 肺炎双球菌转化(zhunhu)实验1952,A.D Hershey 和M.Chase 噬菌体感染实验第34 页/共44 页第三十五页,共45 页。遗 传 密 码遗 传 密 码:DNA(或mRNA)中 的 核 苷 酸序列与蛋 白 质 中 氨 基 酸 序 列 之 间 的 对 应 关 系(gunx)称 为遗传密码。密 码 子(codon):mRNA 上 每3 个 相 邻 的 核苷酸编 码蛋白质多肽链中的一个氨基酸,这三个核苷酸就称为一个密码子或 三联体密码。第35 页/共44 页第三十六页,共45 页。遗传密码(m m)字典UACGUCAGU C A G第二位第一位(5)第三位
15、(3)UCAGUCAGUCAG第36 页/共44 页第三十七页,共45 页。遗传密码(m m)的性质1、密码是无标点符号的且相邻密码子互不重叠(chngdi)。2、密码的简并性:由一种以上密码子编码同一个氨基酸的现象称为简并性(dogeneracy),对应于同一氨基酸的密码子称为同义密码子(Synonymouscodon)。密码的简并性可以减少有害突变。3、密码的摆动性(变偶性):密码的专一性主要是由第一第二个碱基所决定,tRNA上的反密码子与mRNA密码子配对时,密码子的第一、二位碱基是严格的,第三位碱基可以有一定的变动。Crick称这一为变偶性(wobble).4、密码的通用性和变异性5、
16、64组密码子中,AUG既是的Met密码,又是起始密码;有三组密码不编码任何氨基酸,而是多肽链合成的终止密码子:UAG、UAA、UGA。第37 页/共44 页第三十八页,共45 页。(二)RNA 功能(gngnng)1、参与蛋白质的合成 2、RNA 的转录(zhun l)后加工与修饰3、参与基因表达的调控4、生物催化作用第38 页/共44 页第三十九页,共45 页。二 核酸(h sun)与病变(一)核酸(h sun)与遗传疾病第39 页/共44 页第四十页,共45 页。(二)核酸(h sun)与病毒噬菌体T2结构(jigu)头部颈圈尾部基板尾丝尖钉第40 页/共44 页第四十一页,共45 页。动
17、物病毒(bngd)切面模式图被膜(脂蛋白、碳水化合物)衣壳(蛋白质)突起(tq)(糖蛋白)病毒(bngd)粒(DNA或RNA)核酸第41 页/共44 页第四十二页,共45 页。乙肝病毒艾滋病毒第42 页/共44 页第四十三页,共45 页。三 人类基因组计划(jhu)简介(Human Genome Project,HGP)该计划是美国科学家在1985年率先提出,1990年正式启动。美、英、德、法、日先后参加了此项工作,1999年我国成为HGP的第六个成员国。HGP旨在阐明人类基因组DNA所具有的3109核苷酸的序列,发现所有的人类基因并阐明其在染色体上的位置,破译人类的全部遗传信息,使得人类第一次在分子水平上全面地认识自我(zw)。到目前为止,已完成了人类基因组的框架图,测序的工作已基本完成。HGP的实施,揭开了生命科学新的一页,它可以造福于人类,但也面临的伦理的挑战。第43 页/共44 页第四十四页,共45 页。感谢您的观看(gunkn)。第44 页/共44 页第四十五页,共45 页。
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