生物化学第三版课后习题答案.pdf
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1、第一章1、举例说明化学与生物化学之间的关系。提示:生物化学就是应用化学的理论与方法来研究生命现象,在分子水平上解释与阐明生命现象化学本质的一门学科、化学与生物化学关系密切,相互渗透、相互促进与相互融合。一方面,生物化学的发展依赖于化学理论与技术的进步,另一方面,生物化学的发展又推动着化学学科的不断进步与创新。举例:略。2、试解释生物大分子与小分子化合物之间的相同与不同之处。提示:生物大分子一般由结构比较简单的小分子,即结构单元分子组合而成,通常具有特定的空间结构。常见的生物大分子包括蛋白质、核酸、脂类与糖类。生物大分子与小分子化合物相同之处在丁:1)共价键就是维系它们结构的最主要的键;2)有一
2、定的立休形象与空间大小;3)化学与|物理性质主要决定于分子中存在的官能团。生物大分子与小分子化合物不同之处在于:(1)生物大分子的分子量要比小分子化合物大得多,分子的粒径大小差异很大;(2)生物大分子的空间结构婴复杂得多,维系空间结构的力主要就是各种非共价作用力;(3)生物大分子特征的空间结构使其具有小分子化合物所不具有的专性识别与结合位点,这些位点通过与相应的配体特异性结合,能形成超分子,这种特性就是许多重要生理现象的分子基础。3、生物大分子的手性特征有何意义?提示:生物大分子都就是手性分子,这种结构特点在生物大分子的分子识别及其特殊的生理功能方面意义重大。主要表现在:(1)分子识别就是产生
3、生理现象的重要基础,特异性识别对于产生特定生物效应出关重要;(2)生物大分了通过特征的三维手性空间环境能特异性识别前手性的小分子配体,产生专一性的相互作用。4、指出取代物的构型:4.指出取代产物的构型。提示:HOOC,CH3S构型HOOC,/B rJ H JCH3R构型CH2OH CH2OHR构型 S构型5.写出下列分子的前手性面。6、举例说明分子识别的概念及其意义。提示:分子识别就是指分子间发生特异性结合的相互作用,如tRNA分子与氨酰tRNA合成醉的相互作用,抗体与抗原之间的相互作用等。分子识别就是生命体产生各种生理现象的化学本质,就是保证生命活动有序地进行的分子基础。7、什么就是超分子?
4、说明拆分超分子的方法与原理。提示:在生物化学领域中,超分子就是指生物分子问或生物分子与配体分子间相互作用与识别所形成的复合物。超分子的形成过程就就是非共价键缔合的过程,就是可逆的过程。该过程受介质极性与休系温度的影响,由于缔合就是放热的过程,所以当介质极性增大与体系温度升高时,超分子就会被拆分。另外,强酸或强碱环境也可使这种非共价键作用遭到破坏,从而将超分子拆分。8、缓冲溶液的缓冲能力与哪些因素有关?提示:(1)缓冲溶液总浓度:缓冲溶液的总浓度越大,溶液中所含的抗酸抗碱成分越多,缓冲能力越强。(2)缓冲比:对于同-缓冲休系的各缓冲溶液,当缓冲溶液的总浓度一定时,缓冲溶液的缓冲能力随缓冲比的改变
5、而改变。9、如果希望某一个生物化学反应在pH5的条件下进行,应该选择哪种缓冲溶液?提示:“正丁酸酸一正丁酸钠”缓冲溶液系统、“乙酸一乙酸钠”缓冲溶液系统、或“柠檬酸一柠檬酸钠”缓冲溶液系统。10、一个生物化学反应要求在p ll-4的条件下进行,可以选择HCOOH/HCOONa缓冲溶液。试计算配制pH0 即该肽在 pH=6、0 时带正电6人 的 促 肾 上 腺 皮 质 激 素 就 是 一 种 多 肽 激 素。它 的 氨 基 酸 序 列 为Scr-Tyr-Scr-Met-Gilu-His-Phe-Arg-T rp-Gly-Lys-Pro-Val-Gly-Lys-Lys-Arg Arg-Pro-Va
6、l-Lys-Val-Tyr-Pro-Asp-Ala-Gly-Glu-Asp-GIn-Ser Ala-Glu Ala-Phe Pro Leu-Glu-Phe;在 pH=7条件下,此多肽带有何种电荷?(2)用 CNBr处理此多肽,可以得到多少肽段?提示:(1)当 pH=7时,此多肽带正电荷。(2)CNBr选择性切割Met竣基端肽键,故得到两个肽段。7、环亚乙基亚胺能够与蛋白质的C ys残基作用,生成(S)-乙基氨基衍生物。经修饰后,Cys的较基所形成的肽键能够被腴蛋白酶水解,试解释原因。提示:因为胰蛋白酶能选择性地水解Lys的竣基所形成的肽键,Lys的 R 基为-(CH2)4NH2。C ys的侧链
7、-CH2sH经与环亚乙、基亚胺反应后被修饰为-(CH2)-S-(CH2)2-NH2、与 Lys的 R 基很相似,导致胰蛋白酶无法识别两者的差异,将其作为底物水解。所以经过修饰后,Cys的竣基所形成的肽键能够被胰蛋白酶水解。8、一种蛋白质在用1mmol、L+二硫苏糖醇(一种含有二硫键的糖)处理后,它的SDS凝胶电泳谱带相对位置由原来的0、67减小为0、64,试解释原因。提示:-=硫苏糖醇与肽链中的Cys毓基发生反应,经一二硫键结合到肽链上,蛋白质分子量增大,电泳速度降低,所以它的SDS凝胶电泳谱带相对位置由原米的0、67减小为0、64O9、将含有Asp、Gly、Thr,Leu与 Lys的 pH=
8、3、0 的缓冲溶液,加到预先用同样缓冲溶液平衡过的Dowex-50阳离子交换树脂中,然后用该缓冲溶液洗脱,这 5 种氨基酸洗脱的顺序如何?并说明原因。提示:阳离子交换树脂分离氨基酸的原理就是,各种氨基酸在pH=3、0 时带正电荷多少不同,带正电荷越多,在树胎吸附能力越强,氨基酸越难被洗脱出米。根 据 AP=pl-pH,可算出各种氨基酸的 OP 分别就是:Asp,AP=-0、03;Gly,AP=+2、97;Thr,AP=+2、86;Leu,AP=+2、98;Lys,AP=+6、74O因此,5 种氨基酸洗脱顺序为AspGly Lcu ThrLys,其中的G ly与Leu带电情况几乎相同,但 Gly
9、的分了量相对较小,先被洗脱出来。芒再考虑疏水作用的话,因为Thr侧链的疏水性弱,与树脂的结合能力不如Leu,因此比Leu更快被洗脱,最后的洗脱顺序就足Asp Gily Thr LeuLys、10、用 CNBr与胰凝乳蛋白BS断裂多肽,分别产生如下肽段,试写出该肽的氨基酸序列:CNBr 断裂:Arg-Ala-Tyr-Gly-Asn;Leu-Phe-Met;(3)Asp-Met 膜凝乳蛋白酶断裂:(1)Mct-Arg-Ala-Tyr;Asp-Mct-Lcu-Phe;(3)Gly-Asn提示:Asp-Met-Leu-Phe-Met-Arg-Ala-Tyr-Gly-Asn11、-种多肽经酸水解后分析得
10、知由Lys,Asp,His,Glu,Ala,Vai,Tyr以及两个NII3组成。当用DNFB处理后,得到DNP-Asp;用短肽BS处理可得到游寓的Vai。此多肽用腴蛋白酶降解时,得到两个肽段,其中一个(含Lys,Asp,Glu,Ala,Tyr)在 pH=6、4 时,净电荷为0;另一个(含His,Glu,Vai)可生成DNP-His,在 pH=6、4 时带正电荷。当多肽用膜凝乳蛋白酶降解时,也得到两个肽段,其中一个(Asp,Ala,Tyr)在 pH=6、4 时呈中性,另一个(Lys,His,Glu,Vai)在 pH=6、4 带正电荷。此多肽的氨基酸序列如何?提示:Asn-Ala-Tyr-Glu-
11、Lys-His-GIn-Val12、有一个七肽,经分析其氨基酸组成为Lys,Pro,Arg,Phe,Ala,Tyr与 Ser。此肽与DNFB不反应。用膜凝乳蛋白酶降解,得到两个肽段,其氨基酸组成分别为Ala,Tyr,Ser与 Pro,Phe,Lys,Argo这两个肽段与DNFB反应,分别生成DNP-Ser与 DNP-Lyso此肽与膜蛋白酶作用,同样生成两个肽段,它们的氨基酸组成分别为Arg,Pro与 Phe.Tyr,Lys,Ser,Ala0试推测此多肽的结构与氨基酸序列。提示:此七肽为环状结构,结构如下“Arg-P ro-LysPhe f、Ser-Ala*T y r13、说明多肽氨基酸序列自动
12、分析法的基本原理。根据此原理,试设计一台多肽氨基酸序列自动分析仪。提示:(1)Edman降解法是现代蛋白质氨基酸顺序自动分析仪的设计基础。原理如下:PITC N 拨额率酸HN 大 4八 )-C N H-C H-CRi。HPITC标记%C-NH-PhC H-C-N H-C H-CI IK“R2成环S又9HN N-Ph+H iN-C H-S)R2RI O zPTH-区喝他(2)氨基酸序列自动分析仪的设计如下图所示:14、根据以下分析结果确定蛋白质的亚基数目及连接方式:(1)凝胶过滤测得分子量为200 KD;(2)SDS-PAGE测得分子量为100 KD;2疏基乙醇存在下的SDS-PAGE测得分子量
13、为40KD与60KD。提示:根据分析,可以确定该蛋白质分子由两个相对分子质量为40 KD的亚基和两个相对分子质量为60 KD的亚基组成。连接方式如下图:40KD-SS-60KD40KD-SS-60KD15、试设计对下列十肽进行一级结构测定的研究方法及步骤。Val-Cys-Met-Thr-Lys-Gly-Cys-Arg-Ser-Glu提示:(1)氨基酸组成分析(2)过氧甲酸氧化法切断=硫健。(3)末端氨基酸测定(4)测序(5)一硫键定位16、请指出2008年的“奶粉事件”中的罪魁祸首“三聚晶胺”能充当蛋白质的原因。提示:因为蛋白质占生物组织中所有含氮物质的绝大部分。因此,可以将生物组织的含氮量近
14、似地瞧作蛋白质的含氮量、而三聚富胺(melamine)就是一种有机含氮杂环化合物,学名1、,3,5-三嗪-2,4,6-三胺,或称为2,4、6-三氨基-1,3,5-三嗪,简称三胺、蜜胺、富脉酰胺,就是一种重要的化工原料,其化学结构如右图所示。食品工业中常常需要检在蛋白质含量,但就是直接测量蛋白质含量技术上比较复杂,成本也比较高,不适合大范围推广,所以业界常常使用种叫傲“凯氏定氮法(Kjeldahl method)”的方法,通过食品中HN,NH2氮原子的含量来间接推算蛋白质的含量。也就就是说,食品中氮原子含量越高,蛋白质含量就越高。三聚富胶的最大的特点就是含氮量很高(66%),这样一来,三聚葡胺由
15、于其分子中含氮原子比较多,日、其生产工艺简单、成本很低,给了掺假、造假者极大的利益驱动。有人估算在植物蛋白粉与饲料中使蛋白质增加一个百分点,用二聚窗胺的花费只有真实蛋白原料的1/5、所以“增加”产品的表观蛋白质含量就是添加三聚富胺的主要原因,三聚富胺作为一种白色结晶粉末,没有什么气味与味道,掺杂后不易被发现等也成了掺假、造假者心存侥幸的辅助原因。17、说明蛋白质的一级结构、二级结构与三级结构的概念。提示:略18、为什么在a 螺旋片段中很少发现Pro?提示:P ro 残基中的侧链成环,当片段中存代Pro残基时,由于其不能形成链内氢键,并且五元环的刚性结构导致肽键不能自出旋转,因此a 螺旋结构会在
16、此处中断。19、如果在生理条件下,多聚赖氨酸呈现为松散的环结构。那么,在何种条件下,它会形成a 螺旋结构?提示:一条肽链能否形成a 螺旋,与它的氨基酸组成与序列有极大的关系。R 基小,并且不带电荷的有利于a-螺旋的形成与稳定。多聚顿氮酸在pH=7时,赖氨酸残基侧链带有正电荷,彼此间存在静电排斥作用,难以折叠成紧密的a 螺旋二级结构形式。随 着 p H 升高,当pH12时,赖氨酸残基侧链上的氨基去质子化,多聚赖氨酸将从无规则线团转变形成a 螺旋结构。20、您如何理解“蛋白质结构决定了它的生物功能”这句话?请简述之。提示:蛋白质结构与功能之间存代着密切的联系。(1)一级结构与功能的关系(2)高级结
17、构与功能的关系21、试设计应用化学法与不对称合成法合成L-Val。提 示如 下 图 所 示H,/P tAC2OCO、E 1CHNHAcNaOAcZCH CIH5C化学法:C(),EiI 一C=NOHICO,EtHNO,C H:(CO2Et):-/CHCHNH?(D国L)化学法或曲解法拆分L-ValCOOH不对称法:H2N C H2C O2B u-tCOOHCH(CH3)2L-V al22、解释为什么应用酰氯法形成肽键过程中容易发生消旋化。提示:如下图所示。23、含有乳清蛋白(pl=4、6),B 乳球蛋白(p=5、2),以及胰凝乳蛋白酶(pl=9、5)的溶液,用 DEAE一纤维素(一种阴离子交换
18、树脂)pll=6、0 时的色谱柱分离,然后用pH为 6、0 的媛冲溶液洗脱,媛冲液盐浓度逐步增加,请预测三种待分离蛋白质组分的洗脱顺序,并简要说明理由。提示:这三种蚩白质被洗脱出来的顺序为:胰凝乳蛋白酶B 乳球蛋白 乳清蛋白。24、写出用DCC法与固相合成法合成四肽Ser-Phe-Asp-A la的基本反应过程,并指出它们之间的异同。提示:不同;DCC法合成方向就是从N 端到C 端,固相合成法合成方向就是从C 端到N 端。固相合成法不必分离纯化中间产物,合成过程可以连续进行。相同:都用DCC作为肽键形成的脱水偶联剂。不反应基团都被保护。25、设计合成由Gly,Leu,Tyr组成的三肽库方法。提
19、示:用均分法合成三肽库26、筒述蛋白质组学的概念及研究意义。提示:货白质组就是指在一定条件下有一个特定细胞或牛物休产生的所有蛋白质。蛋白质组学就就是通过对细胞或生物体所产生的蛋白质的全面分析,系统与全面地描述细胞或生物体的功能。研究意义:因为转水调节、RNA加工、蛋白质合成以及加工等过程使得转冰物组与蛋白质组比基因组要复杂得多,因而它所提供的关于生命体系与生命活动化学本质的信息就是单-的“基因组学”所不能比拟的,亦即,通过蛋白质组的研究可以更好地、更全面地了解生命整体的性状与功能。第四章1、褥作为生物催化剂有什么特点?提示:酶与化学催化剂一样,能够改变化学反应的速度,但不能改变化学反应的平衡。
20、酶的催化特点表现为:(1)高效性。(2)高度专一性。(3)反应条件温与。(4)可调控性。2、辅酶与金属离子在旃促反应中有何作用?水溶性维生素与辅酶有什么关系?提示:(1)辅酶与金属寓子作为结合蛋白酶类的非蛋白部分(又称辅因子),在酶实施催化作用过程中起到非常重要的作用。只有酶蛋白与辅囚子结合成的全酶才具有催化性能。辅酶与金属酶中的金属离了在酶促反应中直接参加了反应,起到电子、原了或者某些化学基团转移的作用,决定了酶催化反应类型的专一性;而金属激酶中的金属离子主要起到激活酶的催化活性的作用。(2)大部分辅酶的前体都就是水溶性B族维生素,许多水溶性维生索的生理功能与辅酶的作用息息相关。3、现 有1
21、mL乙醇脱氢酶制剂,用媛冲溶液稀释至100mL后,从中吸取500uL测定酶的活力。得知2 min使 0、5 mm。1乙醇转化为乙醛。清计算每毫升酶制剂每小时能转化多少乙醇?(设:最适条件下,每小时转化I mmol乙醇所需要的酶曜为1 个活力单位)。提示:500 pL的酶活力为15Uo1 m L酶制剂每小时能转化的乙醇量为3moi乙醇,即 3X46=138克乙醇。4、称取25 m g蛋白酶粉配成25 mL溶液,取 0、1 m L溶液测酶活力,结果每小时可以水解酪蛋白产生1500 ug酪氨酸。假 定 1 个酶活力单位定义为每分钟产生1ug酪氨酸的酶量,请计算:(1)酶溶液的比活力;(2)每克酶粉的
22、总活力。提示:25 m L溶液的醇活力为6250Uo比活力为:6250+25=250(U/mg)每克酶粉的总活力为:250X1000=2、5X 10(U)5、说明米氏方程的生物学意义。提示:(1)米氏方程就是酶促反应动力学最重要的一个数学表达式,根据它可以知道酶促反应速率与底物浓度之间的关系。(2)米氏方程所规定的动力学规律,就是酶促反应的一项基本属6、某种酶遵循米氏方程,其 Km=1 umolL;当底物浓度为100 pmol:L!时,反应初速率为0、1 pumolLmino有-竞争性抑制剂,当S=10 pumolLI时,其初速率为无抑制剂时的1/10。请计算:(1)S=1 mmok LI时的
23、初速率;(2)竞争性抑制剂存在时酶的Km值。提示:(1)根据米氏方程:-/+LMc.,iW KlOQfimai-L-1。1曲1&廿.加1 =q邛 m d一 L,-,一+1芸9Q八|ijno i.L,arm tx*0.Iff moi*L*1 min因此,S=lm m ol L“时的初速率为:,二 X-1mmd Li=O.GOlmmoi.L-+Imnwl.lrr i*vm tx A(XiRmal-L-1(2)由于竞争性抑制匕皿不变_工旧3=XWI F X SQ +间两式相除得三一%+间10 _ 4-tO ym ol-L-1丁=出 L7+二 即 moi L-3解得竞争性抑制剂存在时酶的Km值为:Q=
24、1州师小厂17、举例说明各种类型抑制剂的作用特点。如何判断两种抑制剂的抑制类型?提示:(1)抑制剂分两大类:可逆抑制剂与不可逆抑制剂。可逆抑制剂根据抑制剂与酶结合情况,又分三类:竞争性抑制剂、反竞争性抑制剂与非抑制性抑制剂。(2)判断种抑制剂为可逆还就是不可逆抑制剂时,主要瞧能不能用透析等物理方法除去抑制剂,如果能可初步判定为可逆抑制剂,反之为不可逆抑制剂。判断种抑制剂为竞争性,非竞争性还就是反竞争性抑制剂,可用抑制动力学研究方法进行判断,即通过抑制剂作用前后酶促反应动力学研究中的双倒数图进行判断。如果双倒数图中的直线交于纵坐标,Vmax、不变,Km变大,则为竞争性抑制剂;如果双倒数图中的直线
25、交于横坐标或第二、三象限,且 Vmax、变小,Km 可变可不变,则为非竞争性抑制剂:如果双倒数图中的直线为平行线,且Vmax、变小,Km变小,则可能为反竞争性抑制剂。B、说明BS活性中心的结构与功能特点。研究酶活性中心的主要方法及原理。提示:(1)酶的活性中心就是酶催化作用的核心部分。结构特点:一个酶的活性中心就是一个空间部位。组成活性中心的氨基酸残基可能位于同一肽链的不同部位,也可能位于不同的肽链上。酶活性中心的氮基酸残基在一级结构上可以相距较远,但通过肽链的盘旋折叠,在空间结构中都处于相近位置。功能特点:酶的活性中心含有多种不同的基团,其中一些基团就是酶的催化活性所必需的,称为必需共团。在
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