微生物教程yyd第十一章微生物的分类和鉴定.ppt
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1、第十一章第十一章微生物的分类和鉴定微生物的分类和鉴定 l l前言l l第一节通用分类单元l l第二节微生物在生物界的地位l l第三节各大类微生物的分类系统纲要l l第四节微生物分类鉴定的方法至今已记载过的生物种数约为至今已记载过的生物种数约为150150余万种,余万种,其中微生物为其中微生物为1515万万2020万种。在如此纷繁的物种万种。在如此纷繁的物种多样性面前,一个微生物工作者只有在充分掌握多样性面前,一个微生物工作者只有在充分掌握分类学知识和理论的基础上,先对如此庞大的微分类学知识和理论的基础上,先对如此庞大的微生物类群有一个清晰的轮廓,才有可能对他们开生物类群有一个清晰的轮廓,才有可
2、能对他们开展分类、鉴定和命名等工作。展分类、鉴定和命名等工作。返回目录第一节 通用分类单元一、种以上的系统分类单元(一)七级分类单元 界(界(KingdomKingdom)、门()、门(PhylumPhylum)、纲)、纲(ClassClass)、目()、目(OrderOrder)、科()、科(FamilyFamily)、属)、属(GenusGenus)、种()、种(SpeciesSpecies),在以上七个主要级),在以上七个主要级别中,当必要时都可补充若干辅助单元,包括加别中,当必要时都可补充若干辅助单元,包括加上上“亚亚”、“超超”或添上或添上“族族”等。等。(二)种的概念(二)种的概念
3、在微生物尤其是原核生物中,种的定义是很在微生物尤其是原核生物中,种的定义是很难下的,至今还找不到一个公认的、明确的种的难下的,至今还找不到一个公认的、明确的种的定义。这是因为,微生物与高等生物不同,在高定义。这是因为,微生物与高等生物不同,在高等生物中可用于定义种的几个主要性状,在微生等生物中可用于定义种的几个主要性状,在微生物中是无法使用的。我们认为,微生物的种是一物中是无法使用的。我们认为,微生物的种是一个基本分类单元,它是一大群表性特征高度相似、个基本分类单元,它是一大群表性特征高度相似、亲缘关系极其接近、与同属内其它种有着明显差亲缘关系极其接近、与同属内其它种有着明显差异的一大群菌株的
4、总称。在微生物中,一个种只异的一大群菌株的总称。在微生物中,一个种只能用该种内的一个典型菌株(能用该种内的一个典型菌株(type straintype strain)当作它)当作它的具体代表,故此典型菌株就成了该种的模式种的具体代表,故此典型菌株就成了该种的模式种(type speciestype species)或模式活标本。)或模式活标本。二、学名 物种的学名是用拉丁词或拉丁化的词组成。在一般的出版物中,学名应排斜体字,在书写或打字材料中,应在学名之下划一横线,以表示它应是斜体字母。学名的表示方法分双名法与三名法两种。(一)双名法 双名法指一个物种的学名由前面一个属名和双名法指一个物种的学
5、名由前面一个属名和后面一个种名加词两部分构成。属名的词首须大后面一个种名加词两部分构成。属名的词首须大写,种名加词的字首须小写(包括由人名或地名写,种名加词的字首须小写(包括由人名或地名等专用名词衍生的)。出现在分类学文献中的学等专用名词衍生的)。出现在分类学文献中的学名,在上述两部分之后还应加写三项内容,即首名,在上述两部分之后还应加写三项内容,即首次定名人(正体字,用括号括住)、现名定名人次定名人(正体字,用括号括住)、现名定名人(正体字)和现名的定名年份。如在一般书刊中(正体字)和现名的定名年份。如在一般书刊中出现学名时,则不必写上后出现学名时,则不必写上后3 3项内容。项内容。学名=属
6、名+种的加词+(首次定名人)+现名定名人+现名定名年份 前两项排斜体字,后三项排正体字前两项排斜体字,后三项排正体字(一般可省略一般可省略)。如大肠埃希氏菌(简称如大肠埃希氏菌(简称“大肠杆菌大肠杆菌”)Escherichia coliEscherichia coli(MigulaMigula)Castellani et Castellani et Chalmers 1919Chalmers 1919枯草芽孢杆菌(简称枯草芽孢杆菌(简称“枯草杆菌枯草杆菌”)Bacillus subtilisBacillus subtilis(EhrenbergEhrenberg)cohn 1872cohn 1
7、872(二)三名法当某种微生物是一个亚种或变种时,学名就当某种微生物是一个亚种或变种时,学名就应按应按三名法三名法三名法三名法拼写。拼写。学名学名=属名属名+种名加词种名加词+符号符号subspsubsp或或var+var+亚种亚种或变种的加词或变种的加词属名和种名加词排斜体,符号属名和种名加词排斜体,符号subspsubsp或或varvar排排正体可省略,亚种或变种的加词排斜体不可省略。正体可省略,亚种或变种的加词排斜体不可省略。如酿酒酵母椭圆变种(椭圆酿酒酵母)如酿酒酵母椭圆变种(椭圆酿酒酵母)Saccharomyces cerevisaeSaccharomyces cerevisae(v
8、arvar)ellipsoideusellipsoideus(三)有关学名的其它知识1、属名是一个表示该微生物主要特征的名词或用作是一个表示该微生物主要特征的名词或用作名词的形容词,单数,第一个字母应大写。其词名词的形容词,单数,第一个字母应大写。其词源可来自拉丁词、希腊词或其它拉丁化的外来词,源可来自拉丁词、希腊词或其它拉丁化的外来词,也有以组合的方式拼成。当前后有两个或更多的也有以组合的方式拼成。当前后有两个或更多的学名连排在一起时,若他们的属名相同,则后面学名连排在一起时,若他们的属名相同,则后面的一个或几个属名可缩写成一个、两个或三个字的一个或几个属名可缩写成一个、两个或三个字母,在其
9、后加上一个点。如母,在其后加上一个点。如BacillusBacillus(芽孢杆菌属)(芽孢杆菌属)可缩写成可缩写成“B.”“B.”或或“Bac.”“Bac.”等。等。、种名加词 种名加词又称种加词,它代表一个物种的次要特征。与属名一样,种名加词也由拉丁词、希腊词或拉丁化的外来词组成。字首一律小写。可由形容词或名词组成,如果是形容词,要求其性与属名一致,如Staphylococcus aureus(金黄色葡萄球菌)中,属名与种的加词均为阳性词。在实际工作中,经常遇到自己已经筛选到一株或一批有用菌种,他的属名很易确定,但菌种的最后鉴定还未结束,这时若要进行学术交流或发表论文,其学名中的种的加词可
10、以暂时先用“sp.”(正体,单数)或“spp.”(正体,复数)来代替。例如,“Bacillus sp.”可译为“一种芽孢杆菌”,而“Bacillus spp.”则可译为“若干种芽孢杆菌”或“一批芽孢杆菌”等。三、种以下的几个分类名词亚种以下的分类单元很多,它们的提出和使用均不受“国际命名法规”的限制。(一)亚种(subspecies,subsp,ssp.)亚种是进一步细分种时所用的单元,一般指除某一明显而稳定的特征外,其余鉴定特征都与模式种相同的种。其命名方法按“三名法”处理。(二)变种(variety,var)变种是亚种的同义词,现已不在主张再用这一名词。(三)型(form)曾用作菌株的同义
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