微生物遗传育种课件,基因重组与育种.ppt
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1、第三章 基因重组与育种引言 基因重组(Gene recombination):凡把两个不同性状个体内的遗传基因转移到一起,经过遗传分子间的重新组合,形成新遗传个体的方式,称遗传重组(Genetic recombination)。重组与突变的不同点:突变是指一个细胞的同一个基因组中某一点或某一DNA片段发生的变异;而重组是来自两个细胞的不同基因组间遗传物质交换的结果,重组可在微生物细胞不发生突变的情况下形成新的基因型与表型。杂交(Hybridization):是指不同基因型的亲本个体或细胞(指单细胞生物)交配而产生子代的过程。重组是分子水平上的概念,而杂交是细胞水平上的概念。杂交中必然含有重组,
2、但重组则不限于杂交这一种形式。第一节 细菌、放线菌的接合及育种一、细菌的接合作用 接合(Conjugation):指供体菌与受体菌的完整细胞经过直接接触而传递大段DNA(包括质粒)遗传信息的现象。(一)接合现象的发现 1946年,J.Lederberg和E.L.Tatum将来自E.coli K12的两种营养缺陷型菌株混合培养,其遗传标记如图。结果在单独培养的平板上无菌落,而在混合培养的平板上长出了原养型菌落。对接合现象的解释:(1)可能是细菌接合后发生基因重组的结果;(2)细菌并没有接合,而是交换了DNA(转化);(3)细菌细胞并没有接合,而是通过培养基交换了养料,即互养;(4)细菌细胞并没有
3、接合,而是亲本细菌发生了回复突变的结果;(5)虽经接合而未发生基因重组,只是形成异核体或杂合二倍体。(二)接合作用的证明1、转化作用的排除 由于在报道接合试验结果之前转化实验已经是众所周知,因此有人怀疑该结果是由转化所导致的。1950年,B.D.Davis设计了U形管实验否定了这一推测(见右图)2、互养的排除 营养缺陷型细菌通过培养基交换养料而产生的现象称为互养。Lederberg 和 Tatum将培养过一种营养缺陷型细菌的培养基经过灭菌、过滤,然后加入到另一营养缺陷型菌培养物中。即使前一种菌在培养、灭菌、过滤之前曾发生过裂解,也不能是后一种菌产生原养型。3、回复突变的排除 若要发生两种突变的
4、回复突变,其几率为1012,这是不可能的。4、异核体和杂合二倍体的排除ABABABABAB异核体杂合二倍体 单倍重组体 异核体和杂合二倍体的遗传性状不稳定,在传代过程中会发生性状分离,但事实恰恰相反,原养型菌落的基因型是稳定的,证明是单倍重组体。(三)接合的机制1、接合作用中两菌株性别的存在 Lederberg 和Tatum认为在两个细菌的亲本细胞在接合过程中起同等作用即E.coli 的性系统被认为是同宗配合。1952年,W.Hayes利用Lederberg 和Tatum所做的杂交实验,对(A)MetBio(Sms或Smr)(B)ThrLeuB1(Smr或Sms)进行研究。结果表明,在杂交期间
5、,两品系所起的作用是不同的,是一种单向异宗配合过程,两品系在获得的同时发生了性别的变化。其中,供体品系相当于雄性,而受体品系相当于雌性。2、F因子的存在(1)E.coli 的某些种(如品系A)记为F,带有一个性因子,或致育因子F(fertility factor),而另一个不育型品系记作F,记不带有性因子;(2)杂交F F是可育的,杂交F F是不育的;(3)F因子可以传递,从F到F细菌,但必须通过细胞接触;(4)F因子能够自发丧失,一旦丧失就不再恢复,除非通过另一个F细胞在传递过来。F细胞经低浓度的吖啶橙处理后丧失F因子,也会偶尔自发地或经紫外线处理丧失。3、F因子及F细胞的特性 F是一种可遗
6、传性状,能够自我复制,类似于染色体基因,但不是染色体基因,其转移的频率可高达70以上。F因子是独立于染色体外的小型环状DNA分子,具有自体复制及转移到其他细胞中去的能力。大小约是细菌基因组DNA的2,分子量为6.3 106d、94.5kb。整个基因组编码94个蛋白质,其中13的基因与接合作用有关。F因子基因组有三个主要的基因丛,分别负责插入、复制和转移的功能。A.转移区(Transfer-region):是一个操纵子,由22个基因组成,33kb,位于F因子结构图的6093kb之间。其中,tra J、A、L、E、N、B、W、V、C、U、F、H这些基因与性菌毛的合成与装配有关;tra Y、Z、M、
7、I、G、D等基因产物与DNA的转移有关;traG和traN的基因产物与细菌结合有关;traS和traT的基因产物与表面排斥有关。B.复制区(replication-region):位于F因子结构图谱的4049kb,包含一个特异的复制蛋白基因frp(F replication proteins)、决定不相容性基因inc(incompatibility)和一个复制起始点oriV(vegetative origin of replication)。C.插入区(insertion region):位于F因子结构图谱的9317.6kb,包含四个插入序列,IS3有直接重复的两个,另外两个是IS2和,它们主
8、要与F因子的整合、切除、易位有关。F因子的主要表现型是细胞表面有性菌毛,即F细胞表面都有性菌毛。F性菌毛分布在大肠杆菌的表面,数目与F因子相当,长度为120um。性菌毛的功能:A.是两性细胞接合时转移DNA的通道,又叫性纤毛桥(sex pili bridge);B.又是特异phage吸附的部位。4、接合时DNA转移的机制 接合时DNA转移的机制目前不详,但可以确定的是:在接合时,性菌毛的存在是必需的。(四)F因子的三种存在形式1、F:F因子在细胞中以游离状态存在。2、Hfr(high frequency of recombination):F因子在细胞中以整合状态存在。Hfr与F的异同:(1)
9、F与Hfr均能与F菌株杂交;(2)F与Hfr均能合成细胞表面附属物性菌毛;(3)Hfr菌株总是从F菌株中得到,而F却从未在Hfr菌株中得到过;(4)Hfr经吖啶橙处理后性质不变,而F经吖啶橙处理后失去F因子;(5)Hfr与F杂交后,F性质一般不会变;而F与F杂交后,F变为F。3、F:携带有部分核染色体基因的F 因子,含有F 因子的菌株称为F 菌株。(五)三种“雄性”菌株与F接合后的结果1、F F 2F 由性菌毛将不同接合型的的细菌连在一起,并且在细胞间形成胞质桥(也称接合管)。在形成接合对以后,F菌的F因子进行DNA滚环复制。单链转入F菌,并合成新的互补链。2、Hfr F HfrF Hfr的染
10、色体双链中的一条链在F因子处发生断裂,由环状变为线状,F因子则位于线状单链DNA的末端,整段线状染色体(单链)也以5 末端引导,等速地转移至F细胞。通过接合而获得新性状的受体细胞称为接合子。(conjugant)3、F F 2F Hfr菌株的F因子的反常切除所形成的F因子有两种类型:I 型:包含了染色体一个区域和不完全的F 因子。II型:带有完整的F因子DNA和位于F因子插入两端的染色体基因。F 菌的共同特征(1)I 型F 一般携带的基因是Hfr上的末端,这部分基因在Hfr F时是低频转移的,而在F F时却是高频转移的。(2)II型F 菌使本来转移频率差异悬殊的两部分基因具有相同的频率。(3)
11、F 菌的最大特点是能构建稳定的部分二倍体。F因子转导:通过F 因子的转移而使受体菌改变 它的遗传性状的现象称为F因子转导或 或性因子转导或简称性导(F duction 或 sex duction)拟表型菌:指表型上属于F 而遗传性上仍是F 的菌,也就是说表面没有性菌毛,因而 丧失了表面排斥性。(六)中断杂交实验原理:如果人为地中断正在基因转移的杂交对,然后测定受体菌里遗传标记重组频率,就能知道基因连锁情况。1957年,E.L.Wollman和F.Jocob设计了中断杂交实验。供体菌Hfr,受体菌F thr leu lac gal azir tonr strr,将大约10倍的F菌和Hfr对数期菌
12、混合,轻轻振荡培养,在不同时间间隔取样,在组织搅拌器中剧烈振荡后,将培养物经适当稀释后,涂布在含链霉素且以葡萄糖作为碳源的基本培养基上进行选择。中断杂交实验中断杂交实验的结果:基因是以ori、thr、leu、azi、ton、lac、gal的顺序连续转移的。在这个实验中,对Hfr菌的条件是,str基因在整个待测顺序的后端,如果strs基因率先进入受体,获得的重组体将在第一次选择性培养基上被str杀死。另外,thr、leu选择性标记应位于前端,如位于后端则无法测序。二、放线菌的接合作用(一)放线菌基因重组的发现1955年,Sermonti夫妇在天兰色链霉菌(streptomyces coelico
13、ler)ISS株中首次发现通过遗传性交换而产生的重组,接着,Hopwood也用S.coelicoler A 3(2)发现了同样的重组。(二)放线菌的性别1、三种性别原始致育型(IF,initial fertility):相当于E.coli的F正常致育型(NF,normal fertility):相当于E.coli的Hfr超致育型(UF,ultra fertility):相当于E.coli的F2、认为IF相当于E.coli的F、UF相当于E.coli的F的理由(1)IF以0.3的频率转变为UF,在经uv处理的IF群体中曾经得到作为受体高度可育的UF菌株,这种情况类似于从F菌株中得到F菌株;(2)
14、IFUF杂交中,UF受体菌株全部转变为IF,而染色体基因重组频率大约为104,两者相差万倍。这种情况与F F相似。3、认为NF相当于Hfr的理由(1)IF和NF都产生对于UF菌株具有抑制作用的次甲霉素,而UF菌株则不产生这一抗菌素;(2)IF UF杂交子代全部都是IF,这种转变和染色体基因转移无关,但是NF UF杂交则不同,UF转变为NF都伴随着染色体重组;(3)NF菌株来自IF或是IF的杂交子代,与E.coli中的一样。(三)放线菌的致育因子 经研究发现在S.coelicoler中存在着一种称为Scp1的致育因子。Scp1和F因子一样也是一种质粒,具有转移性,在自身转移的同时还能够带动染色体
15、进行转移。此外Scp1还带有与产生次甲霉素有关的基因,Scp1属于附加体质粒。(四)天兰色链霉菌三种致育类型与大肠杆菌的三种致育类型之间的区别1、大肠杆菌中F F是不育的,但在天兰色链霉菌中UF UF是可育的,只是频率较低,说明还有另外一种致育因子的存在;2、大肠杆菌中F F或Hfr Hfr杂交的可育性很低,除非使其中一个成为 F的拟表型,但在天兰色链霉菌中NF NF和IF IF杂交中一部分是高度可育的;3、大肠杆菌中F F的子代都是F 而Hfr F的子代都是F,但在天兰色链霉菌中IF UF的子代是IF,NF UF的子代也是NF。三、采用接合技术育种 Hfr细菌和F细菌接触带来两个细菌细胞的接
16、合和染色体从Hfr细菌向F细菌转移。因此,接合杂交是确定特定基因的粗略位置的有效方法,也是育种的一种手段。一般采用液体接合培养法,在接合时注意通气和选择标记。选择性标记可以用抗性标记,也可以用营养缺陷型。第二节 转化与育种 转化(transformation):受体细胞直接吸收来自供体细胞的离体DNA片段,并通过交换把它整合到自己的基因组中,从而获得了供体细胞的某些遗传性状的现象。获得新性状的受体称为转化子(transformant)。转化不是两个细胞的直接接触,而是供体细胞的离体DNA与受体细胞直接接触而转移遗传物质。一、转化过程转化包括两个基本过程(1)从供体菌中提取遗传物质DNA并转移到
17、受体中;(2)供体的遗传物质在受体中的作用。(一)转化DNA的特点1、转化子的数目与DNA浓度的关系在一定条件下转化子的数目与转化DNA的浓度成正比。细菌生长量每毫升中转化子数10410510310210220 40 60 80 100 12010100培养时间每毫升中转化子数103102101DNA转化的饱和浓度2、DNA片段的大小与转化子数目的关系 对于转化作用来说,转化DNA片段必须具有一定的大小。一般认为,转化DNA片段的大小没有上限,但是在制备转化子过程中,往往人工打断供体DNA分子,获得的片段约107dal(大约10个基因左右)。在受体细胞摄取DNA时,可能还会进一步断裂,所以仅仅
18、有大约0.5的供体基因组能够进入受体细胞。能发生转化作用的核苷酸链至少不低于450bp。3、单双链DNA与转化活性的关系 单链DNA的转化活性低,而双链DNA的转化活性高。因而,DNA完整的双链结构对于转化活性来说是必要的。4、转化DNA的命运 大量的实验证明,在转化作用中遗传重组是由供体的单链序列取代了受体DNA的单链序列,使受体的DNA标记变成了供体的遗传标记,并恒定表达,遗传给它的后代。(二)受体细胞的特点1、受体细胞的感受态(1)概念 只有在某一特定条件下培养的部分细胞才有吸收DNA的能力,这种细胞称为感受态细胞。这种感受态细胞所处的状态称为感受态(competence)。(2)感受态
19、的特点和影响因素 特点:感受态不是一种透性特征,而是在适当的生长条件下获得的一种生理特征 影响因素:a.受菌龄的影响:一般认为感受态出现在细菌生长对数期的后期;b.受遗传因素的影响;c.受环境条件的影响。2、感受态的比例 不同的细菌的感受态的比例是不同的,一般为1020。3、感受态可在细胞间转移4、感受态因子(CF)1963年,R.Pakula 和 W.Walczak 首次从链球菌中分离得到;1972年,Leonard 和 Cale 纯化的一种蛋白质,称为CF。该蛋白质在感受态转移中起作用。在感受态细胞表面存在着一种特定的抗原,而非感受态细胞则没有这种抗原。细菌细胞在特定的时期产生一种感受态因
20、子(CF),CF与膜上的受体结合,刺激核内DNA产生另一个蛋白自溶素(Autolysin),自溶素转运至细胞膜和细胞壁之间的周质内作用于细胞膜,并改变膜的成分,使细胞膜便于DNA的吸收。二、转化过程的基因重组及育种(一)转化技术用于基因定位 在转化过程中,两个连锁的基因可以同时转化,但能够同时转化的基因却不一定是连锁的,因为包含这两个基因的DNA片段可以同时被受体细菌所吸收。如果a+和b+是连锁的,那么当DNA浓度下降时,a+b+转化频率的下降与a+或b+的转化频率下降相同;相反,如果a+和b+并不连锁,那么a+b+转化频率下降将远远超过a+或b+的转化频率。这是因为在DNA低浓度范围内,转化
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