WesternBlot详解(原理、试剂、步骤及问题解答).pdf
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1、Western Blot详 解(原 理、试 剂、步 骤 及 问 题 解 答)W estern免 疫 印 迹(Western B l o t)是 将 蛋 白 质 转 移 到 膜 上,然 后 利 用 抗 体 进 展 检 测。对 表 达 蛋 白,可 用 相 应 抗 体 作 为 一 抗 进 展 检 测,对 基 因 的 表 达 产 物,可 通 过 融 合 局 部 的 抗 体 检 测。本 文 主 要 通 过 以 下 几 个 方 面 来 具 体 地 介 绍 一 下 Western B l o t技 术:一、原 理 二、分 类 i.放 射 自 显 影 i i.底 物 化 学 发 光 E C Li i i.底
2、物 荧 光 ECFiv.底 物 DAB呈 色 三、主 要 试 剂 四、主 要 步 骤 五、试 验 常 见 的 问 题 指 南 1.参 考 书 推 举 2.针 对 样 品 的 常 见 问 题 3.抗 体 4.滤 纸、胶 和 膜 的 问 题 5.M ark er的 相 关 疑 问 6.染 色 的 选 择 7.参 照 的 疑 问 8.缓 冲 液 配 方 的 常 见 问 题 9.条 件 的 摸 索10.方 法 的 介 绍 11.结 果 分 析 一、原 理 与 S o u th ern或 N o rth ern杂 交 方 法 类 似,但 Western B l o t承 受 的 是 聚 丙 烯 酰 胺
3、凝 胶 电 泳,被 检 测 物 是 蛋 白 质,“探 针”是 抗 体,“显 色”用 标 记 的 二 抗。经 过 分 别 的 蛋 白 质 样 品,转 移 到 固 相 载 体(例 如 硝 酸 纤 维 素 薄 膜)上,固 相 载 体 以 非 共 价 键 形 式 吸 附 蛋 白 质,且 能 保 持 电 泳 分 别 的 多 肽 类 型 及 其 生 物 学 活 性 不 变。以 固 相 载 体 上 的 蛋 白 质 或 多 肽 作 为 抗 原,与 对 应 的 抗 体 起 免 疫 反 响,再 与 酶 或 同 位 素 标 记 的 其 次 抗 体 起 反 响,经 过 底 物 显 色 或 放 射 自 显 影 以 检
4、测 电 泳 分 别 的 特 异 性 目 的 基 因 表 达 的 蛋 白 成 分。该 技 术 也 广 泛 应 用 于 检 测 蛋 白 水 平 的 表 达。二、分 类 w e s te rn显 色 的 方 法 主 要 有 以 下 几 种:i.放 射 自 显 影 i i.底 物 化 学 发 光 E C Li i i.底 物 荧 光 ECFiv.底 物 DAB呈 色 现 常 用 的 有 底 物 化 学 发 光 ECL和 底 物 DAB呈 色,体 同 水 平 和 试 验 条 件 的 是 用 第 一 种 方 法,目 前 发 表 文 章 通 常 是 用 底 物 化 学 发 光 ECLo只 要 买 现 成 的
5、 试 剂 盒 就 行,操 作 也 比 较 简 洁,原 理 如 下(二 抗 用 HRP标 记):反 响 底 物 为 过 氧 化 物+鲁 米 诺,如 遇 到 H R P,即 发 光,可 使 胶 片 曝 光,就 可 洗 出 条 带。三、主 要 试 剂 1、丙 烯 酰 胺 和 N,N-亚 甲 双 丙 烯 酰 胺,应 以 温 热(以 利 于 溶 解 双 丙 稀 酰 胺)的 去 离 子 水 配制 含 有 29%(w/v)丙 稀 酰 胺 和 l%(w/v)N,N-亚 甲 双 丙 烯 酰 胺 储 存 液 丙 稀 酰 胺 29g,N,N-亚 甲 叉 双 丙 稀 酰 胺 1g,加 H20至 100mL)储 于 棕
6、 色 瓶,4 避 光 保 存。严 格 核 实 P H 不 得 超 过 7.0,因 可 以 发 生 脱 氨 基 反 响 是 光 催 化 或 碱 催 化 的。使 用 期 不 得 超 过 两 个 月,隔 几 个 月 须 重 配 制。如 有 沉 淀,可 以 过 滤。2、十 二 烷 基 硫 酸 钠 SDS溶 液:10%金 人)0.185口 5,101出 2 0 去 离 子 水 配 制,室 温 保 存。3、分 别 胶 缓 冲 液:L5mmol/LTris-HCL(pH8.8):18.15gTris 和 48mllmol/LHCL 混 合,加 水 稀 释 到 100ml终 体 积。过 滤 后 40C保 存。
7、4、浓 缩 胶 缓 冲 液:0.5mmol/LTris-HCL(pH6.8):6.05gTris 溶 于 40mlH20 中,用 约 48ml 1mol/L HCL调 至 pH6.8 加 水 稀 释 到 100ml终 体 积。过 滤 后 40C保 存。这 两 种 缓 冲 液 必 需 使 用 Tris碱 制 备,再 用 HCL调 整 P H 值,而 不 用 Tris.CL。5、TEMED原 溶 液 N,N,N N 四 甲 基 乙 二 胺 催 化 过 硫 酸 铁 形 成 自 由 基 而 加 速 两 种 丙 稀 酰 胺 的 聚 合。P H 太 低 时,聚 合 反 响 受 到 抑 制。10%(w/v)
8、过 硫 酸 胺 溶 液。供 给 两 种 丙 稀 酰 胺 聚 合 所 必 需 的 自 由 基。去 离 子 水 配 制 数 ml,临 用 前 配 制.6、SDS-加 样 缓 冲 液:pH6.8 0.5mol/L Tris 缓 冲 液 8ml,甘 油 6.4mL 10%SDS 12.8ml,筑 基 乙 醇 3.2ml,0.05%漠 酚 蓝 1.6mL H20 32ml混 匀 备 用。按 1:1或 1:2比 例 与 蛋 白 质 样 品 混 合,在 沸 水 终 煮 3min混 匀 后 再 上 样,一 般 为 20-25U1,总 蛋 白 量 100“g。7、Tris-甘 氨 酸 电 泳 缓 冲 液:30.
9、3gTris,188g甘 氨 酸,lOgSDS,用 蒸 偏 水 溶 解 至 1000ml,得 0.25mol/L Tris-1.92mol/L甘 氨 酸 电 极 缓 冲 液。临 用 前 稀 释 10倍。8、转 移 缓 冲 液:配 制 1L转 移 缓 冲 液,需 称 取 2.9 g 甘 氨 酸、5.8gTris碱、0.37g SDS,并 参 加 200ml甲 醇,加 水 至 总 量 1L,9、丽 春 红 染 液 储 存 液:丽 春 红 S 2 g 三 氯 乙 酸 30g磺 基 水 杨 酸 30g加 水 至 100ml用 时 上 述 储 存 液 稀 释 1 0 倍 即 成 丽 春 红 S 使 用
10、液。使 用 后 应 予 以 废 弃。10、脱 脂 奶 粉 5%(w/v)。II、NaN3 0.02%叠 氮 钠(有 毒,戴 手 套 操 作),溶 于 磷 酸 缓 冲 盐 溶 液(PBS)。12、Tris 缓 冲 盐 溶 液(TBS):20mmol/LTris/HCL(pH7.5),500mmol/LnaCl 13、Tween20(15)鼠 抗 人-MMP-9(16)鼠 抗 人-TIMPT。14、过 氧 化 物 酶 标 记 的 其 次 抗 体。15、NBT(溶 于 70%二 甲 基 甲 酰 胺,75mg/fnl)。16、BCIP(溶 于 100%二 甲 基 甲 酰 胺,50mg/ml)017、1
11、00mmol/LTris-HCL(pH9.5),18、100mmol/L NaCl.19、50mmol/LTris-HCL(pH7.5),5mmol/L EDTA.(可 以 参 看 分 子 克 隆)四、主 要 步 骤 生 物 秀 为 您 搜 集 了 现 阶 段 几 乎 网 上 全 部 的 Western Blot的 中 英 文 资 料,仅 供 试 验 参 考,可 以 依 据 自 己 试 验 的 实 际 状 况 进 展 调 整:Western Blot PROTOCOL:点 击 杳 看 全 部 相 关 文 章 五、试 验 常 见 的 问 题 指 南 依 据 问 题 的 类 型 主 要 分 成 以
12、 下 几 类(以 下 资 料 权 作 参 考,请 勿 盲 目 仿 照!):1.参 考 书 推 举A.对 初 学 者 看 什 么 资 料 比 较 好?解 答:抗 体 技 术 试 验 指 南 和 Antibodies(a laboratory manual,wrote by Ed Hariow,david lan e)两 本 书 不 错。2.针 对 样 品 的 常 见 问 题 B.做 线 粒 体 膜 UCP2蛋 白 的 Western Blot(以 下 简 写 成 Western B lo t),提 取 线 粒 体 后 冻 存(未 加 蛋 白 酶 抑 制 剂),用 的 博 士 德 的 一 抗,开
13、头 还 有 点 痕 迹,现 在 越 来 越 差,上 样 量 已 加 到 1 2 0/z g,换 了 个 santa c l o z 的 一 抗 仍 不 行。是 什 么 缘 由?蛋 白 酶 抑 制 剂 单 加 PMSF行 吗?解 答:疑 心 是 样 品 问 题,可 能 是:1,样 品 不 能 反 复 冻 融;2,样 品 未 加 蛋 白 酶 抑 制 剂。同 时,建 议 检 查 Western B l o t过 程,提 高 一 抗 浓 度。对 于 加 蛋 白 酶 抑 制 剂 来 说,一 般 加 PMSF就 可 以 了,最 好 能 多 加 几 中 种 蛋 白 酶 抑 制 剂。C.细 胞 水 平 要 做
14、 Western B l o t,多 少 细 胞 提 的 蛋 白 够 Western Blot?解 答:一 般 地 5*1 0 6就 足 够 了。D.同 一 样 品 能 同 时 提 RNA又 提 蛋 白 吗,这 样 对 Western B l o t有 无 影 响?解 答:能,没 有 问 题,我 们 做 过。E.同 一 蛋 白 样 品 能 同 时 进 展 两 种 因 子 的 Western B l o t检 测 吗?解 答:固 然 可 以,有 的 甚 至 可 以 同 时 测 几 十 种 样 品。F.假 设 目 标 蛋 白 是 膜 蛋 白 或 是 胞 浆 蛋 白,操 作 需 要 留 意 什 么?
15、解 答:假 设 是 膜 蛋 白 和 胞 浆 蛋 白,所 用 的 去 垢 剂 就 要 温 存 得 多,这 时 最 好 加 上 N aF去 抑 制 磷 酸 化 酶 的 活 性。G.我 的 样 品 的 蛋 白 含 量 很 低,每 微 升 不 到 1 微 克,但 是 在 转 膜 时 经 常 会 觉 察 只 有 一 局 部 蛋 白 转 到 了 膜 上,就 是 在 转 膜 后 染 胶 觉 察 有 的 孔 全 部 的 蛋 白 条 带 都 在,只 是 颜 色 变 淡 了,有 什 么 方 法 可 以 解 决?解 答:你 可 以 加 大 上 样 量,没 有 问 题,还 有 转 移 时 你 可 以 用 削 减 电
16、流 延 长 时 间,多 加 5-1 0%甲 醇。H.想 分 别 的 蛋 白 是 分 子 量 260kd的,SDS-电 泳 的 分 别 胶 浓 度 多 大 适 宜?积 层 胶 的 浓 度 又 该 用 多 少?这 么 大 分 子 量 的 蛋 白 简 洁 作 Western Blot吗?解 答:260kd的 蛋 白 不 好 做,分 别 胶 用 6%,Stacking Gel 3.5%。I.假 设 上 样 量 超 载,要 用 什 么 方 法 来 增 加 上 样 量?假 设 需 要 加 大 上 样 量 使 原 来 弱 的 条 带 能 看 清 楚。解 答:可 以 浓 缩 样 品,也 可 以 依 据 你 的
17、 目 标 分 子 量 透 析 掉 一 局 部 小 分 子 蛋 白。一 般 地,超 载 30%是 不 会 有 问 题 的。假 设 己 经 超 了 不 少 了,而 且 小 分 子 量 的 也 要,可 以 考 虑 加 大 胶 的 厚 度,可 以 试 试 1.5mm的 comboJ.蛋 白 变 性 后 可 以 存 放 多 久?解 答:一 80,一 两 年 没 有 问 题。最 关 键 两 条:不 要 被 蛋 白 酶 水 解 掉;不 要 被 细 菌 消 化 掉(也 是 被 酶 水 解 了)。K.我 所 测 定 的 蛋 白 分 子 量 是 105KD,按 理 说 分 别 胶 应 当 承 受 7.5%,但 我
18、 所 查 资 料 却 要 求 分 别 胶 和 浓 缩 胶 均 承 受 11%的 配 方,不 知 为 何?解 答:上 述 您 提 到 的 两 种 凝 胶 均 可 以 使 用,由 于 105KD的 蛋 白 在 上 述 两 种 胶 的 线 性 区 分 范 围 内,但 需 留 意 条 带 位 置。L.接 下 来 我 预 备 承 受 DAB显 色 技 术,二 抗 是 生 物 素 化 的 多 克 隆 抗 体,三 抗 是 亲 和 素 生 物 素 体 系,不 知 承 受 这 样 的 方 案 后,封 闭 液 是 否 要 作 调 整,能 否 再 用 5%的 脱 脂 奶 粉 呢?好 似 有 资 料 说 脱 脂 奶
19、粉 会 影 响 亲 和 素 生 物 素 的 生 成,是 吗?解 答:不 能 使 用 脱 脂 奶 粉,由 于 脱 脂 奶 粉 中 含 生 物 素,用 B S A代 替 应 当 好 一 点.M.还 有 一 问 题,一 般 一 次 上 样 的 蛋 白 总 量 是 多 少,跟 目 的 蛋 白 的 表 达 量 有 关 系 吗?解 答:Western Blot 一 般 上 样 3 0-1 0 0微 克 不 等,结 果 跟 目 的 蛋 白 的 丰 度、上 样 量、一 二 抗 的 量 和 抚 育 时 间 都 有 关 系,也 与 显 色 时 间 长 短 有 关。开 头 摸 条 件 时,为 了 拿 到 阳 性 结
20、 果,各 个 步 骤 都 可 以 量 多 一 点 时 间 长 一 点,固 然 背 景 也 就 出 来 了。要 拿 到 好 的 结 果,假 设 抗 体 好 的 话 比 较 简 洁,抗 体 不 好 的 话 就 需 要 反 复 地 试 了,固 然 有 的 不 适 合 Western B lo t的 怎 样 做 也 不 行。所 以 拿 到 好 的 结 果 不 简 洁。N.做 组 织 样 品 的 w estern的 时 候,处 理 样 品 有 什 么 诀 窍 吗?还 有,您 用 过 大 牛 血 清 做 封 闭 剂 吗?浓 度 如 何?效 果 是 不 是 比 BSA好 一 点?解 答:必 需 进 展 研
21、磨、匀 浆、超 声 处 理,蛋 白 质 溶 解 度 会 更 好,离 心 要 充 分,膜 蛋 白 需 用 更 剧 烈 的 方 法 抽 提,低 丰 度 膜 蛋 白 可 能 还 要 分 步 抽 提(超 速 离 心)。还 有 一 点 就 是 组 织 中 的 蛋 白 酶 活 性 更 强,需 要 留 意 抑 制 蛋 白 酶 的 活 性(参 加 PM S F 和 蛋 白 酶 抑 制 剂 cocktail),封 闭 剂 一 般 5%脱 脂 奶 粉 较 常 用。假 设 一 抗 为 多 克 隆 抗 体,使 用 BS A也 是 不 错 的 选 择。0.您 是 否 可 以 介 绍 一 下 大 分 子 量 蛋 白 20
22、0KD,在 做 w estern要 留 意 什 么 呢?解 答:做 200kd蛋 白 的 Western B lo t时 要 留 意,分 别 胶 最 好 选 择 7%的;剥 胶 时 要 留 神:转 移 时 间 需 要 相 应 延 长;要 做 分 子 量 参 照(否 则 消 灭 杂 带 不 知 道 如 何 分 析)。P.有 什 么 方 法 可 以 提 高 上 样 量?解 答:可 以 浓 缩 样 品;增 大 上 样 体 积 来 增 大 上 样 量。Q.我 要 检 测 的 目 的 蛋 白 是 分 子 量 或 许 为 4 2 k d的 膜 蛋 白,膜 蛋 白 提 取 可 不 行 以 不 用 到 超 速
23、 离 心 机,有 没 有 直 接 用 低 温 高 速 离 心 机 就 可 以 的 提 到 膜 蛋 白 的 方 法,4 2 k d的 蛋 白 分 子 量 算 不 算 大?解 答:如 是 需 要 提 取 膜 蛋 白,(而 不 是 只 需 要 提 取 膜 蛋 白),可 以 用 Ripa b u f f e r提 取 膜 蛋 白 和 胞 浆 蛋 白,用 这 个 做 Western B l o t就 可 以 了。假 设 是 非 要 只 提 取 膜 蛋 白 就 要 用 到 超 速 离 心 机。4 2 k d不 算 大,也 不 算 小,所 以,可 以 依 据 一 般 的 转 移 方 法 实 施。R.蛋 白
24、的 上 样 量 有 没 有 什 么 具 体 的 要 求?解 答:上 样 量 要 依 据 试 验 的 要 求 来 定,假 设 要 求 是 定 量 和 半 定 量 的 Western B l o t则 上 样 量 要 均 等,假 设 只 是 要 定 性,则 没 有 太 大 的 关 系,尽 量 多 上 就 行 了,但 是 不 要 超 过 0.3fl g/mm2 oS.一 抗,二 抗 的 比 例 是 否 重 要?解 答:比 较 重 要,调 整 好 一 抗,二 抗 的 比 例,可 以 去 掉 局 部 非 特 异 的 本 底。3.抗 体 T.做 细 胞 信 号 传 导,要 做 磷 酸 化 某 因 子 We
25、stern B l o t,其 二 抗 有 何 要 求?解 答:对 二 抗 无 要 求,要 看 你 试 验 条 件 来 选 择,一 般 推 举 用 HRP标 记 的 二 抗。U.同 一 公 司 的 另 外 抗 体 用 这 个 稀 释 度 做 出 来 效 果 很 好,所 以 没 做 预 试,怕 费 时 间,用 什 么 样 的 稀 释 度 比 较 好 呢?我 用 的 ELL+plus试 剂 盒 显 色。转 膜 过 夜,一 抗 孵 育 也 是 过 夜 的,假 设 封 闭 也 过 夜 的 话 就 要 四 天 才 看 的 到 结 果 了。解 答:不 同 抗 体,即 使 是 同 一 公 司 的 抗 体,其
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- WesternBlot 详解 原理 试剂 步骤 问题解答
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