病原感染快速鉴定分析系统技术参数.docx
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1、病原感染快速鉴定分析系统技术参数一、技术指标1 .适用范围:无需分离培养,无需经验预判,对人或动物原始样本中的微生物进行快速、 准确、全面的鉴定。对细菌、真菌、病毒等病原微生物的测序数据进行组装、进化分析2 .操作界面:Web界面,按钮式操作,易用性强,无需掌握Linux命令和编程语言,上手 快,门槛低3 .数据库:宿主去除:除人源参考序列外,还内置了猪、山羊、绵羊、小鼠、大鼠、鲤鱼、 家鹅、鸡、鸭、牛、猫、狗、兔等常见动物的参考序列,可实现自动过谑此类宿主信息,亦 可根据客户需求定制;微生物鉴定:来源于RefSeq的完整基因组序列,包括细菌(包括古菌)、 病毒、真菌和寄生虫,共25256种完
2、整微生物基因组序列4 .自带实验室信息管理系统,从样本制备到分析报告,端到端的全流程可追溯。5 .既可单独对RNA的宏转录组测序数据进行分析,也可单独对DNA的宏基因组测序数 据进行分析,还能同时对样本的RNA宏转录组以及DNA宏基因组测序数据进行分析,能 解决背景微生物的干扰,对样本进行更加准确的病原微生物鉴定,并找出活跃表达的致病性 微生物6 .能对二代测序得到的Fastq数据进行一键式分析,并自动生成鉴定报告及分析结果:Fastq 压缩文件,gz格式的DNA/RNA及SE/PE数据均可7 . 6小时内完成病原快速鉴定报告及鉴定结果文件,物种鉴定后得到的总的分类信息,并 以交互式饼图的形式
3、展示物种在DNA/RNA水平上的分类结果;提供DNA/RNA按照细菌、 病毒、古生菌、真菌和寄生虫的鉴定表格和相对丰度信息;同时进行DNA和RNA分析的 样本,还提供RNAvsDNA的物种活跃度结果。8 .软件适用于对细菌、真菌、病毒的测序数据进行质控、有参组装和无参组装、基因预测、 泛基因组和核心基因组分析、物种进化等分析9 .可实现基因预测的功能、基于核心基因的进化树以及基于全基因组SNP的物种树分析、 核心基因组分析的功能、变异检测的功能、对细菌进行耐药基因分析的功能、对细菌进行毒 力基因分析的功能10 .报告内容展示分析样品的分析结果,包括质控结果、组装结果以及进化分析的结果: 二、售后服务1 .可免费升级数据库2 .可远程软件维护和数据库升级3 .硬件质保期一年,有本地硬件工程师,软件部分远程维护,可免除人工差旅费用;质保 期外人工费不高于700元/小时。4 .产品故障响应申告时间4小时,上门时间小于48小时三、配置指标1 .病原分析软件及数据库1套2 .病原分析软件配套服务器I套3 .采用HPZ840工作站,稳定可靠性强。CPU: Intel Xeon 5118/5218 ;内存:192GB硬 盘:512GB固态硬盘;12TB机械硬盘,也支持机架与刀片服务器。
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