蛋白质与酶工程知识点(完)---仅供参考_高等教育-生物学.pdf
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1、学习必备 欢迎下载 1、易错 PCR:通过调整反应条件来使 PCR 扩增过程中复制 错配率 增加,在目的基因中随机引入突变,继而获得蛋白质分子的随机突变体*提高镁离子浓度或加入锰离子*降低体系中一种的 dNTP 浓度(至少 5-10%)*运用低保真度 DNA 聚合酶*增加 DNA 聚合酶的浓度 属于无性进化:单一基因内进行遗传突变,费力、耗时,多用于小片段(800bp 以下)2、酶的概念:酶是一类由活细胞产生的,对其特异底物(substrate)具有高效催化作用的生大分子,包括蛋白质和核酸 学习必备 欢迎下载 3、辅酶:与酶蛋白结合疏松,可用透析或超滤的方法除去(NAD+)。辅基:与酶蛋白结合
2、紧密,不能用透析或超滤的方法除去(FAD、FMN)酶的活性中心:或称活性部位,指必需基团在空间结构上彼此靠近,组成具有特定空间结构的区域,能与底物特异结合并将底物转化为产物。白质分子的随机突变体提高镁离子浓度或加入锰离子降低体系中一种的浓度至少运用低保真度聚合酶增加聚合酶的浓度属于无性进化单一基因内进行遗传突变费力耗时多用于小片段以下酶的概念酶是一类由活细胞产生的对其特异底 法除去辅基与酶蛋白结合紧密不能用透析或超滤的方法除去酶的活性中心或称活性部位指必需基团在空间结构上彼此靠近组成具有特定空间结构的区域能与底物特异结合并将底物转化为产物学习必备欢迎下载抗体酶或催化抗体是具 具有高度的特异性绝
3、对特异性相对特异性立体结构特异性酶促反应的可调节性对酶量的调节对酶活性的调节诱导契合假说酶与底物相互接近时其结构相互诱导相互变形和相互适应进而相互结合这一过程称为酶底物结合的诱导契合假学习必备 欢迎下载 4、抗体酶 或催化抗体:是具有催化功能的抗体。本质:免疫球蛋白,即具有催化作用的免疫球蛋白 5、酶促反应特点:酶促反应具有极高的效率 酶促反应具有高度的特异性:绝对特异性、相对特异性、立体结构特异性 酶促反应的可调节性:对酶量的调节,对酶活性的调节 6、诱导契合假说:酶与底物相互接近时,其结构相互诱导、相互变形和相互适应,进而相互结合。这一过程称为酶-底物结合的诱导契合假说。7、底物浓度对反应
4、速度的影响:当底物浓度较低时:反应速度与底物浓度成正比;反应为一级反应。随着底物浓度的增加:反应速度不再成正比例加速;反应为混合级反应。当底物浓度高达一定程度:反应速度不再增加,达最大速度;反应为零级反应 白质分子的随机突变体提高镁离子浓度或加入锰离子降低体系中一种的浓度至少运用低保真度聚合酶增加聚合酶的浓度属于无性进化单一基因内进行遗传突变费力耗时多用于小片段以下酶的概念酶是一类由活细胞产生的对其特异底 法除去辅基与酶蛋白结合紧密不能用透析或超滤的方法除去酶的活性中心或称活性部位指必需基团在空间结构上彼此靠近组成具有特定空间结构的区域能与底物特异结合并将底物转化为产物学习必备欢迎下载抗体酶或
5、催化抗体是具 具有高度的特异性绝对特异性相对特异性立体结构特异性酶促反应的可调节性对酶量的调节对酶活性的调节诱导契合假说酶与底物相互接近时其结构相互诱导相互变形和相互适应进而相互结合这一过程称为酶底物结合的诱导契合假学习必备 欢迎下载 8、Km与 Vmax 的意义 白质分子的随机突变体提高镁离子浓度或加入锰离子降低体系中一种的浓度至少运用低保真度聚合酶增加聚合酶的浓度属于无性进化单一基因内进行遗传突变费力耗时多用于小片段以下酶的概念酶是一类由活细胞产生的对其特异底 法除去辅基与酶蛋白结合紧密不能用透析或超滤的方法除去酶的活性中心或称活性部位指必需基团在空间结构上彼此靠近组成具有特定空间结构的区
6、域能与底物特异结合并将底物转化为产物学习必备欢迎下载抗体酶或催化抗体是具 具有高度的特异性绝对特异性相对特异性立体结构特异性酶促反应的可调节性对酶量的调节对酶活性的调节诱导契合假说酶与底物相互接近时其结构相互诱导相互变形和相互适应进而相互结合这一过程称为酶底物结合的诱导契合假学习必备 欢迎下载 白质分子的随机突变体提高镁离子浓度或加入锰离子降低体系中一种的浓度至少运用低保真度聚合酶增加聚合酶的浓度属于无性进化单一基因内进行遗传突变费力耗时多用于小片段以下酶的概念酶是一类由活细胞产生的对其特异底 法除去辅基与酶蛋白结合紧密不能用透析或超滤的方法除去酶的活性中心或称活性部位指必需基团在空间结构上彼
7、此靠近组成具有特定空间结构的区域能与底物特异结合并将底物转化为产物学习必备欢迎下载抗体酶或催化抗体是具 具有高度的特异性绝对特异性相对特异性立体结构特异性酶促反应的可调节性对酶量的调节对酶活性的调节诱导契合假说酶与底物相互接近时其结构相互诱导相互变形和相互适应进而相互结合这一过程称为酶底物结合的诱导契合假学习必备 欢迎下载 9、不可逆性抑制作用:抑制剂通常以共价键与酶活性中心或活性中心以外的必需基团相结合,使酶失活。可逆性抑制作用:抑制剂通常以非共价键与酶或酶-底物复合物可逆性结合,使酶的活性降低或丧失;抑制剂可用透析、超滤等方法除去。类型:竞争性抑制、非竞争性抑制、反竞争性抑制。三种抑制剂的
8、特点 白质分子的随机突变体提高镁离子浓度或加入锰离子降低体系中一种的浓度至少运用低保真度聚合酶增加聚合酶的浓度属于无性进化单一基因内进行遗传突变费力耗时多用于小片段以下酶的概念酶是一类由活细胞产生的对其特异底 法除去辅基与酶蛋白结合紧密不能用透析或超滤的方法除去酶的活性中心或称活性部位指必需基团在空间结构上彼此靠近组成具有特定空间结构的区域能与底物特异结合并将底物转化为产物学习必备欢迎下载抗体酶或催化抗体是具 具有高度的特异性绝对特异性相对特异性立体结构特异性酶促反应的可调节性对酶量的调节对酶活性的调节诱导契合假说酶与底物相互接近时其结构相互诱导相互变形和相互适应进而相互结合这一过程称为酶底物
9、结合的诱导契合假学习必备 欢迎下载 白质分子的随机突变体提高镁离子浓度或加入锰离子降低体系中一种的浓度至少运用低保真度聚合酶增加聚合酶的浓度属于无性进化单一基因内进行遗传突变费力耗时多用于小片段以下酶的概念酶是一类由活细胞产生的对其特异底 法除去辅基与酶蛋白结合紧密不能用透析或超滤的方法除去酶的活性中心或称活性部位指必需基团在空间结构上彼此靠近组成具有特定空间结构的区域能与底物特异结合并将底物转化为产物学习必备欢迎下载抗体酶或催化抗体是具 具有高度的特异性绝对特异性相对特异性立体结构特异性酶促反应的可调节性对酶量的调节对酶活性的调节诱导契合假说酶与底物相互接近时其结构相互诱导相互变形和相互适应
10、进而相互结合这一过程称为酶底物结合的诱导契合假学习必备 欢迎下载 白质分子的随机突变体提高镁离子浓度或加入锰离子降低体系中一种的浓度至少运用低保真度聚合酶增加聚合酶的浓度属于无性进化单一基因内进行遗传突变费力耗时多用于小片段以下酶的概念酶是一类由活细胞产生的对其特异底 法除去辅基与酶蛋白结合紧密不能用透析或超滤的方法除去酶的活性中心或称活性部位指必需基团在空间结构上彼此靠近组成具有特定空间结构的区域能与底物特异结合并将底物转化为产物学习必备欢迎下载抗体酶或催化抗体是具 具有高度的特异性绝对特异性相对特异性立体结构特异性酶促反应的可调节性对酶量的调节对酶活性的调节诱导契合假说酶与底物相互接近时其
11、结构相互诱导相互变形和相互适应进而相互结合这一过程称为酶底物结合的诱导契合假学习必备 欢迎下载 10、酶的调节:酶活性的调节(快速调节)酶原与酶原的激活 变构(別构)酶 酶的共价修饰调节 酶含量的调节(缓慢调节)酶蛋白合成的诱导和阻遏 酶降解的调控 11、酶原激活的意义 避免细胞产生的酶对细胞进行自身消化,并使酶在特定的部位和环境中发挥作用,保证体内代谢正常进行。(消化管内的蛋白酶)有的酶原可以视为酶的储存形式。在需要时,酶原适时地转变成有活性的酶,发挥其催化作用。(凝血酶与纤溶酶类)12、变构调节 一些代谢物可与某些酶分子活性中心外的某部分可逆地结合,使酶构象改变,从而改变酶的催化活性,此种
12、调节方式称变构调节 13、两种操纵子:乳糖操纵子、色氨酸操纵子 14:细胞破碎法:实验室小规模 旋刀匀浆法 研磨法 高速珠磨法 反复冻融 白质分子的随机突变体提高镁离子浓度或加入锰离子降低体系中一种的浓度至少运用低保真度聚合酶增加聚合酶的浓度属于无性进化单一基因内进行遗传突变费力耗时多用于小片段以下酶的概念酶是一类由活细胞产生的对其特异底 法除去辅基与酶蛋白结合紧密不能用透析或超滤的方法除去酶的活性中心或称活性部位指必需基团在空间结构上彼此靠近组成具有特定空间结构的区域能与底物特异结合并将底物转化为产物学习必备欢迎下载抗体酶或催化抗体是具 具有高度的特异性绝对特异性相对特异性立体结构特异性酶促
13、反应的可调节性对酶量的调节对酶活性的调节诱导契合假说酶与底物相互接近时其结构相互诱导相互变形和相互适应进而相互结合这一过程称为酶底物结合的诱导契合假学习必备 欢迎下载 渗透压破碎法 超声匀浆法 大规模提取:高压匀浆法 15、解吸方法-洗脱原理 加大反离子的浓度,常用的反离子 是 NaCl 改变溶液的 pH(改变结合基团的电荷)同时改变 pH与离子强度 交换剂选择的一般原则:*酶蛋白稳定存在的 pHpI,用阳离子交换剂 白质分子的随机突变体提高镁离子浓度或加入锰离子降低体系中一种的浓度至少运用低保真度聚合酶增加聚合酶的浓度属于无性进化单一基因内进行遗传突变费力耗时多用于小片段以下酶的概念酶是一类
14、由活细胞产生的对其特异底 法除去辅基与酶蛋白结合紧密不能用透析或超滤的方法除去酶的活性中心或称活性部位指必需基团在空间结构上彼此靠近组成具有特定空间结构的区域能与底物特异结合并将底物转化为产物学习必备欢迎下载抗体酶或催化抗体是具 具有高度的特异性绝对特异性相对特异性立体结构特异性酶促反应的可调节性对酶量的调节对酶活性的调节诱导契合假说酶与底物相互接近时其结构相互诱导相互变形和相互适应进而相互结合这一过程称为酶底物结合的诱导契合假学习必备 欢迎下载*酶蛋白稳定存在的 pHpI,用阴离子交换剂*两种 pH条件下均能稳定存在,二种交换剂均可 4、蛋白质与酶的结构和功能 16、氨基酸的分类:白质分子的
15、随机突变体提高镁离子浓度或加入锰离子降低体系中一种的浓度至少运用低保真度聚合酶增加聚合酶的浓度属于无性进化单一基因内进行遗传突变费力耗时多用于小片段以下酶的概念酶是一类由活细胞产生的对其特异底 法除去辅基与酶蛋白结合紧密不能用透析或超滤的方法除去酶的活性中心或称活性部位指必需基团在空间结构上彼此靠近组成具有特定空间结构的区域能与底物特异结合并将底物转化为产物学习必备欢迎下载抗体酶或催化抗体是具 具有高度的特异性绝对特异性相对特异性立体结构特异性酶促反应的可调节性对酶量的调节对酶活性的调节诱导契合假说酶与底物相互接近时其结构相互诱导相互变形和相互适应进而相互结合这一过程称为酶底物结合的诱导契合假
16、学习必备 欢迎下载 17、拉氏构象图:两相邻肽键平面可相对旋转(构象角,):围绕 C 旋转的构象与角度 白质分子的随机突变体提高镁离子浓度或加入锰离子降低体系中一种的浓度至少运用低保真度聚合酶增加聚合酶的浓度属于无性进化单一基因内进行遗传突变费力耗时多用于小片段以下酶的概念酶是一类由活细胞产生的对其特异底 法除去辅基与酶蛋白结合紧密不能用透析或超滤的方法除去酶的活性中心或称活性部位指必需基团在空间结构上彼此靠近组成具有特定空间结构的区域能与底物特异结合并将底物转化为产物学习必备欢迎下载抗体酶或催化抗体是具 具有高度的特异性绝对特异性相对特异性立体结构特异性酶促反应的可调节性对酶量的调节对酶活性
17、的调节诱导契合假说酶与底物相互接近时其结构相互诱导相互变形和相互适应进而相互结合这一过程称为酶底物结合的诱导契合假学习必备 欢迎下载 18、蛋白质一级结构:多肽链中氨基酸的排列顺序。主要化学键:肽键(+二硫键)白质分子的随机突变体提高镁离子浓度或加入锰离子降低体系中一种的浓度至少运用低保真度聚合酶增加聚合酶的浓度属于无性进化单一基因内进行遗传突变费力耗时多用于小片段以下酶的概念酶是一类由活细胞产生的对其特异底 法除去辅基与酶蛋白结合紧密不能用透析或超滤的方法除去酶的活性中心或称活性部位指必需基团在空间结构上彼此靠近组成具有特定空间结构的区域能与底物特异结合并将底物转化为产物学习必备欢迎下载抗体
18、酶或催化抗体是具 具有高度的特异性绝对特异性相对特异性立体结构特异性酶促反应的可调节性对酶量的调节对酶活性的调节诱导契合假说酶与底物相互接近时其结构相互诱导相互变形和相互适应进而相互结合这一过程称为酶底物结合的诱导契合假学习必备 欢迎下载 19、螺旋(-helix):多肽链的主链原子沿一中心轴盘绕所形成的有规律的右手螺旋构象。简言之,各个肽平面围绕同一轴旋转形成的右手螺旋构象。白质分子的随机突变体提高镁离子浓度或加入锰离子降低体系中一种的浓度至少运用低保真度聚合酶增加聚合酶的浓度属于无性进化单一基因内进行遗传突变费力耗时多用于小片段以下酶的概念酶是一类由活细胞产生的对其特异底 法除去辅基与酶蛋
19、白结合紧密不能用透析或超滤的方法除去酶的活性中心或称活性部位指必需基团在空间结构上彼此靠近组成具有特定空间结构的区域能与底物特异结合并将底物转化为产物学习必备欢迎下载抗体酶或催化抗体是具 具有高度的特异性绝对特异性相对特异性立体结构特异性酶促反应的可调节性对酶量的调节对酶活性的调节诱导契合假说酶与底物相互接近时其结构相互诱导相互变形和相互适应进而相互结合这一过程称为酶底物结合的诱导契合假学习必备 欢迎下载 两亲性螺旋:(重要)氨基酸侧链从螺旋骨架伸出,形成螺旋表面一侧亲水(带电、极性),一侧疏水(易形成疏水内核或疏水表面聚合)的特性。螺旋转轮:螺旋沿着螺旋轴的二维投射图,可以判断 alpa螺旋
20、是否具有两亲性。影响-螺旋稳定因素:侧链基团空间位阻:如 Ile、Trp、Phe侧链基团;连续氨基酸侧链基团带有相同电荷(同种电荷互斥)Pro等亚氨基酸存在(不能形成氢键,且 C 参与吡咯环形成,环内 C-N 和 C-N键不能旋转)。白质分子的随机突变体提高镁离子浓度或加入锰离子降低体系中一种的浓度至少运用低保真度聚合酶增加聚合酶的浓度属于无性进化单一基因内进行遗传突变费力耗时多用于小片段以下酶的概念酶是一类由活细胞产生的对其特异底 法除去辅基与酶蛋白结合紧密不能用透析或超滤的方法除去酶的活性中心或称活性部位指必需基团在空间结构上彼此靠近组成具有特定空间结构的区域能与底物特异结合并将底物转化为
21、产物学习必备欢迎下载抗体酶或催化抗体是具 具有高度的特异性绝对特异性相对特异性立体结构特异性酶促反应的可调节性对酶量的调节对酶活性的调节诱导契合假说酶与底物相互接近时其结构相互诱导相互变形和相互适应进而相互结合这一过程称为酶底物结合的诱导契合假学习必备 欢迎下载 白质分子的随机突变体提高镁离子浓度或加入锰离子降低体系中一种的浓度至少运用低保真度聚合酶增加聚合酶的浓度属于无性进化单一基因内进行遗传突变费力耗时多用于小片段以下酶的概念酶是一类由活细胞产生的对其特异底 法除去辅基与酶蛋白结合紧密不能用透析或超滤的方法除去酶的活性中心或称活性部位指必需基团在空间结构上彼此靠近组成具有特定空间结构的区域
22、能与底物特异结合并将底物转化为产物学习必备欢迎下载抗体酶或催化抗体是具 具有高度的特异性绝对特异性相对特异性立体结构特异性酶促反应的可调节性对酶量的调节对酶活性的调节诱导契合假说酶与底物相互接近时其结构相互诱导相互变形和相互适应进而相互结合这一过程称为酶底物结合的诱导契合假学习必备 欢迎下载 白质分子的随机突变体提高镁离子浓度或加入锰离子降低体系中一种的浓度至少运用低保真度聚合酶增加聚合酶的浓度属于无性进化单一基因内进行遗传突变费力耗时多用于小片段以下酶的概念酶是一类由活细胞产生的对其特异底 法除去辅基与酶蛋白结合紧密不能用透析或超滤的方法除去酶的活性中心或称活性部位指必需基团在空间结构上彼此
23、靠近组成具有特定空间结构的区域能与底物特异结合并将底物转化为产物学习必备欢迎下载抗体酶或催化抗体是具 具有高度的特异性绝对特异性相对特异性立体结构特异性酶促反应的可调节性对酶量的调节对酶活性的调节诱导契合假说酶与底物相互接近时其结构相互诱导相互变形和相互适应进而相互结合这一过程称为酶底物结合的诱导契合假学习必备 欢迎下载 20、motif 的层次、线性 motif 的概念(重要)白质分子的随机突变体提高镁离子浓度或加入锰离子降低体系中一种的浓度至少运用低保真度聚合酶增加聚合酶的浓度属于无性进化单一基因内进行遗传突变费力耗时多用于小片段以下酶的概念酶是一类由活细胞产生的对其特异底 法除去辅基与酶
24、蛋白结合紧密不能用透析或超滤的方法除去酶的活性中心或称活性部位指必需基团在空间结构上彼此靠近组成具有特定空间结构的区域能与底物特异结合并将底物转化为产物学习必备欢迎下载抗体酶或催化抗体是具 具有高度的特异性绝对特异性相对特异性立体结构特异性酶促反应的可调节性对酶量的调节对酶活性的调节诱导契合假说酶与底物相互接近时其结构相互诱导相互变形和相互适应进而相互结合这一过程称为酶底物结合的诱导契合假学习必备 欢迎下载 白质分子的随机突变体提高镁离子浓度或加入锰离子降低体系中一种的浓度至少运用低保真度聚合酶增加聚合酶的浓度属于无性进化单一基因内进行遗传突变费力耗时多用于小片段以下酶的概念酶是一类由活细胞产
25、生的对其特异底 法除去辅基与酶蛋白结合紧密不能用透析或超滤的方法除去酶的活性中心或称活性部位指必需基团在空间结构上彼此靠近组成具有特定空间结构的区域能与底物特异结合并将底物转化为产物学习必备欢迎下载抗体酶或催化抗体是具 具有高度的特异性绝对特异性相对特异性立体结构特异性酶促反应的可调节性对酶量的调节对酶活性的调节诱导契合假说酶与底物相互接近时其结构相互诱导相互变形和相互适应进而相互结合这一过程称为酶底物结合的诱导契合假学习必备 欢迎下载 21、四级结构:两条和两条以上多肽寡聚蛋白或多聚蛋白质形成的高级结构。亚基种类、数目、空间排布以及亚基互作是四级结构稳定因素。白质分子的随机突变体提高镁离子浓
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