第十章蛋白质的酶促降解和氨基酸代谢高等教育生物学_高等教育-生物学.pdf
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1、(1)蛋白酶的种类和专一性 蛋白酶即内肽酶(endopeptidase,水解蛋白质和多肽 形成各种短肽。蛋白酶具有底物专一性,链内部的肽键,不能水解所有肽键,只能对特定 氨肽酶 羧肽酶 Rn CH H2N7 H N XCHZ O Ri C O Rm Ri H N C i I II O|/CH H 胃蛋白酶 胰凝乳 蛋白酶 胰蛋白酶 H、C N I O 枯草杆菌 蛋白酶 R3(疏)/CH、N COOH H 第十章 蛋白质的酶促降解和氨基酸代谢 第一节蛋白质的酶促降解 生物体内的蛋白质是经常处于动态的变化之中,一方面在不断地合成,另一方面又在 不断地分解。例如,当种子萌发时,蛋白质发生强烈的水解,
2、将胚乳或子叶中的储藏蛋白 质分解,形成氨基酸和其他简单含氮化合物,供幼苗形成组织时用。在植物衰老时,蛋白 质的分解亦很强烈,将营养器官的蛋白质分解成含氮化合物,转移到繁殖器官中,供幼胚 及种子的形成之所需。蛋白质的分解对机体生命代谢的意义并不亚于蛋白质的合成。植物体为了进行正常的 生长和发育,为了适应外界条件的变化,必须经常不断地形成具有不同结构与功能的各种 蛋白质。因此,早期合成的蛋白质在完成其功能之后不可避免地要分解,其分解产物将作 为合成新性质蛋白质的原料。蛋白质的分解是在蛋白(水解)酶催化下进行的,蛋白水解酶存在于植物所有的细胞 与组织中。大量蛋白酶已被人们从植物种子、果实的生长器官中
3、分离出来并进行了研究,如番木瓜汁液中的木瓜蛋白酶,菠萝茎和果实中的菠萝蛋白酶,花生种子中的花生仁蛋白 酶,豌豆种子中的豌豆蛋白酶,小麦、大麦、燕麦籽粒中的相应蛋白酶。其中许多酶已制 成结晶。蛋白水解酶可分为内肽酶(肽链内切酶)和端肽酶(肽链端解酶)两大类。图9-1几种蛋白酶的专一性 的肽键发生作用。如木瓜蛋白酶只能作用于由碱性氨基酸以及含脂肪侧链和芳香侧链的氨 基酸所形成的肽键。几种蛋白水解酶的专一性见图 9-1、表 9-1。表9-1几种蛋白酶作用的专一性 酶 对 R 基团的要求 作用部位 胃蛋白酶 Ri,Ri:芳香族氨基酸或其他疏水氨基酸(NH2端及 COOH 端)f 胰凝乳蛋白酶 R1芳香
4、族及其他疏水氨基酸(COOH 端)f 胰蛋白酶 R2:碱性氨基酸(COOH 端)f 枯草杆菌蛋白酶 R3:疏水氨基酸(NH2端)f 木瓜蛋白酶 碱性氨基酸以及含脂肪侧链和芳香侧链的氨基酸 羧肽酶 A Rm:芳香族氨基酸(COOH 端)J羧基末端的肽键 羧肽酶 B Rm:碱性氨基酸(COOH 端)J羧基末端的肽键 氨肽酶 J氨基末端的肽键 二肽酶 要求相邻两个氨基酸上的 G-氨基和 0(-羧基同时存在 蛋白酶按基催化机理又可分为四类见表 9-2。表9-2蛋白酶的种类 编号 名 称 作用特征 例 子 3.4.21 丝氨酸蛋白酶类 活性中心含组氨酸和丝氨酸 胰凝乳蛋白酶、胰蛋白酶、凝血酶 3.4.2
5、2 硫醇蛋白酶类 活性中心含半胱氨酸 木瓜蛋白酶、无花果蛋白酶、菠萝蛋白酶 3.4.23 羧基(酸性)蛋白酶类 最适 pH 值在 5 以下 胃蛋白酶、凝乳酶 3424 金属蛋白酶类 含有催化活性所必需的金属 枯草杆菌中性蛋白酶、脊椎动物胶原酶 表 9-2中所列的木瓜蛋白酶、菠萝蛋白酶及无花果蛋白酶的活性中心均含有半胱氨酸,因此能被 HCN,H2S、半胱氨酸等还原剂所活化,而被 HQ2等氧化剂及重金属离子所抑 制。其余蛋白酶存在于大豆、菜豆、大麻、玉米、高粱的种子中。这些酶的性质与广泛分 布的动物蛋白酶一一胰蛋白酶和胃蛋白酶等有很多共同之处。(2)肽酶的种类和专一性 端肽酶又称为肽酶(exope
6、ptidase,从肽链的一端开 始水解,将氨基酸一个一个地从多肽链上切下来。肽酶根据其作用性质不同可分为氨肽酶、羧肽酶和二肽酶。氨肽酶从肽链的氨基末端开始水解肽链;羧肽酶从肽链的羧基末端开始 水解肽链(见表 9-1、图9-1);二肽酶的底物为二肽,将二肽水解成单个氨基酸。肽酶又 可分为六类,见表 9-3。表9-3肽酶的种类 编号 名 称 作用特征 反 应 3.4.11 a-氨酰肽水解酶类 作用于肽链的氨基末端(N末端),生成 氨基酸 氨酰肽+HQT氨基酸+肽 3.4.13 二肽水解酶类 水解二肽 二肽+出 0 一 2 氨基酸 酶不能水解所有肽键只能对特定羧肽酶胃蛋白酶芳香族氨基酸或其他疏水氨基
7、酸端及端胰凝乳蛋白酶芳香族及其他疏水氨基酸端胰蛋白酶枯草杆菌蛋白酶木瓜蛋白酶碱性氨基酸端疏水氨基酸端碱性氨基酸以及含脂肪侧链和芳香侧链键要求相邻两个氨基酸上的氨基和羧基同时存在蛋白酶按基催化机理又可分为四类见表表蛋白酶的种类编号名称作用特征例子丝氨酸蛋白酶类活性中心含组氨酸和丝氨酸胰凝乳蛋白酶胰蛋白酶凝血酶硫醇蛋白酶类活性中心含半胱氨性所必需的金属枯草杆菌中性蛋白酶脊椎动物胶原酶表中所列的木瓜蛋白酶菠萝蛋白酶及无花果蛋白酶的活性中心均含有半胱氨酸因此能被半胱氨酸等还原所活化而被等氧化及重金属离子所抑制其余蛋白酶存在于大豆菜豆大麻玉米RC 0 COOH+NH3 3.4.14 二肽基肽水解酶类 作
8、用于多肽链的氨基末端(N-末端),生 成二肽 二肽基多肽+H2CI二肽+多肽 3.4.15 肽基二肽水解酶类 作用于多肽链的羧基末端(C-末端),生 成二肽 多肽基二肽+H 2。多肽+二肽 3416 丝氨酸羧肽酶类 作用于多肽链的羧基末端生成氨基酸 肽基-L-氨基酸+H2C肽+L-氨基酸 3.4.17 金属羧肽酶类 作用于多肽链的羧基末端生成氨基酸 肽基-L-氨基酸+HQ-肽+L-氨基酸 3 蛋白质的酶促降解 在 内 肽 酶、羧 肽 酶、氨 肽 酶 与 二 肽 酶 的 共 同 作 用 下,蛋 白 质 水解成蛋白眎、胨、多肽,最后完全分解成氨基酸,即 蛋白质一内肽酶一;眎、胨、一内肽酶一;多肽一
9、端肽酶一;氨基酸 这些氨基酸可以转移到蛋白质合成的地方用作合成新蛋白质的原料,也可以经脱氨作 用形成氨和有机酸,或参加其他反应。第二节氨基酸的分解与转化 氨基酸的分解反应包括脱氨基作用、脱羧作用与羟基化作用等。、脱氨基作用 高等植物的脱氨基作用在发芽的种子、幼龄植物及正发育的组织中最为强烈。脱氨基 作用是氨基酸分解的最重要的一步,包括氧化脱氨基、非氧化脱氨基、转氨基、联合脱氨 基、脱酰胺基等作用。(1)氧化脱氨基(oxidative deamination)氧化脱氨基是高等植物最基本的脱氨基方 式,氨基酸脱去:-氨基后转变成相应的酮酸:RCH-COOH+1/20 2 NH2 禾本科、豆科作物幼
10、苗及马铃薯块茎中,主要是二羧基氨基酸(天冬氨酸和谷氨酸)的氧化脱氨。如谷氨酸在谷氨酸脱氢酶的催化下,氧化脱氨生成:一酮戊二酸:酶不能水解所有肽键只能对特定羧肽酶胃蛋白酶芳香族氨基酸或其他疏水氨基酸端及端胰凝乳蛋白酶芳香族及其他疏水氨基酸端胰蛋白酶枯草杆菌蛋白酶木瓜蛋白酶碱性氨基酸端疏水氨基酸端碱性氨基酸以及含脂肪侧链和芳香侧链键要求相邻两个氨基酸上的氨基和羧基同时存在蛋白酶按基催化机理又可分为四类见表表蛋白酶的种类编号名称作用特征例子丝氨酸蛋白酶类活性中心含组氨酸和丝氨酸胰凝乳蛋白酶胰蛋白酶凝血酶硫醇蛋白酶类活性中心含半胱氨性所必需的金属枯草杆菌中性蛋白酶脊椎动物胶原酶表中所列的木瓜蛋白酶菠萝
11、蛋白酶及无花果蛋白酶的活性中心均含有半胱氨酸因此能被半胱氨酸等还原所活化而被等氧化及重金属离子所抑制其余蛋白酶存在于大豆菜豆大麻玉米COOH CHNH2 CH2+NADP+H2O CH2 I COOH 谷氨酸 COOH C O CH2+NADPH+NH3 CH2 COOH a酮戊二酸 谷氨酸脱氢酶分布很广,在动植物、微生物中都存在,广泛存在于高等植物的种子、根、胚轴、叶片等组织中。(2)非氧化脱氨基(non oxidative deami nati on)非氧化脱氨基也包括多种方式。直接脱氨基 的:是在氨基酸氨基裂解酶和辅助因子磷酸吡哆醛(PLP基)的催化下进行 H2N CH CH2 COOH
12、 CH I COOH 天冬氨酸 延胡索酸 天冬氨酸在天冬氨酸氨基裂解酶的催化下,裂解成延胡索酸和氨。脱水酶脱氨基脱水酶只作用于含有一个羟基的氨基酸,如 L-丝氨酸在丝氨酸脱水酶(serine dehydratase作用下发生脱氨:COOH I H2N 一 C-H CH2OH L-丝氨酸 COOH I+H2。-1 C O+NH3 CH3 丙酮酸 此酶以磷酸吡哆醛为辅酶,催化丝氨酸脱氨后发生分子内重排,生成丙酮酸。解氨酶可催化氨基酸的非氧化脱氨反应,如苯丙氨酸解氨酶(Phe nylala nine ammo nia COOH 氨基酸氨基袭解酶 COOH I CH+NH3 酶不能水解所有肽键只能对特
13、定羧肽酶胃蛋白酶芳香族氨基酸或其他疏水氨基酸端及端胰凝乳蛋白酶芳香族及其他疏水氨基酸端胰蛋白酶枯草杆菌蛋白酶木瓜蛋白酶碱性氨基酸端疏水氨基酸端碱性氨基酸以及含脂肪侧链和芳香侧链键要求相邻两个氨基酸上的氨基和羧基同时存在蛋白酶按基催化机理又可分为四类见表表蛋白酶的种类编号名称作用特征例子丝氨酸蛋白酶类活性中心含组氨酸和丝氨酸胰凝乳蛋白酶胰蛋白酶凝血酶硫醇蛋白酶类活性中心含半胱氨性所必需的金属枯草杆菌中性蛋白酶脊椎动物胶原酶表中所列的木瓜蛋白酶菠萝蛋白酶及无花果蛋白酶的活性中心均含有半胱氨酸因此能被半胱氨酸等还原所活化而被等氧化及重金属离子所抑制其余蛋白酶存在于大豆菜豆大麻玉米lyase,PAL)
14、催化苯丙氨酸和酪氨酸脱氨:COOH+NH3 该酶也催化酪氨酸脱氨基并形成对香豆酸反式异构体:CHNH2 L-苯丙氨酸 CH 反式肉桂酸 酶不能水解所有肽键只能对特定羧肽酶胃蛋白酶芳香族氨基酸或其他疏水氨基酸端及端胰凝乳蛋白酶芳香族及其他疏水氨基酸端胰蛋白酶枯草杆菌蛋白酶木瓜蛋白酶碱性氨基酸端疏水氨基酸端碱性氨基酸以及含脂肪侧链和芳香侧链键要求相邻两个氨基酸上的氨基和羧基同时存在蛋白酶按基催化机理又可分为四类见表表蛋白酶的种类编号名称作用特征例子丝氨酸蛋白酶类活性中心含组氨酸和丝氨酸胰凝乳蛋白酶胰蛋白酶凝血酶硫醇蛋白酶类活性中心含半胱氨性所必需的金属枯草杆菌中性蛋白酶脊椎动物胶原酶表中所列的木瓜
15、蛋白酶菠萝蛋白酶及无花果蛋白酶的活性中心均含有半胱氨酸因此能被半胱氨酸等还原所活化而被等氧化及重金属离子所抑制其余蛋白酶存在于大豆菜豆大麻玉米R1C 一 COOH+R 1一 C 一 COOH 转氨酶 II O NH 2 a-氨基酸 a-酮酸 转氨酶的辅酶为磷酸吡哆醛或磷酸吡哆胺,Ri C COOH+R 2 C COOH I O NH2 a-氨基酸 a-酮酸 它们起氨基传递体的作用,反应过程如下:H NH2 磷酸吡哆胺 转氨酶的种类很多,广泛分布于动植物及微生物中,因此氨基酸的转氨基作用在生物体内 是极为普遍的。转氨基作用是氨基酸脱氨的一种主要方式,在氨基酸代谢中占有重要的地 位。实验证明,除赖
16、氨酸、苏氨酸外,其余 _:氨基酸都可参与转氨基作用,并各有其特异 的转氨酶。(4)联合脱氨基作用 生物体内 L-氨基酸氧化酶活力不高,而 L-谷氨酸脱氢酶的 活力很高,转氨酶又普遍存在,因此一般认为 L-氨基酸往往不是直接氧化脱去氨基,而是 CH=CH COOH PAL +NH3 OH 反式香豆酸 如在许 在高等植物中存在催化苯丙氨酸和酪氨酸脱氨基形成氨和不饱和芳香酸的酶,多植物中发现有苯丙氨酸解氨酶。(3)转氨基(脱氨)作用(transamination)种:-氨基酸的氨基可以转移到:-酮酸上,而生成相应的:-酮酸和:-氨基酸,这种作用叫转氨基作用,也叫氨基移换作用。催化转氨基反应的酶叫转氨
17、酶,其辅酶为磷酸吡哆醛或磷酸吡哆胺。转氨基作用的简式如 下:CH2CHNH 2 COOH OH 酪氨酸 R?C COOH R2 C COOH I O a-酮酸 2 a-氨基酸 2 酶不能水解所有肽键只能对特定羧肽酶胃蛋白酶芳香族氨基酸或其他疏水氨基酸端及端胰凝乳蛋白酶芳香族及其他疏水氨基酸端胰蛋白酶枯草杆菌蛋白酶木瓜蛋白酶碱性氨基酸端疏水氨基酸端碱性氨基酸以及含脂肪侧链和芳香侧链键要求相邻两个氨基酸上的氨基和羧基同时存在蛋白酶按基催化机理又可分为四类见表表蛋白酶的种类编号名称作用特征例子丝氨酸蛋白酶类活性中心含组氨酸和丝氨酸胰凝乳蛋白酶胰蛋白酶凝血酶硫醇蛋白酶类活性中心含半胱氨性所必需的金属枯
18、草杆菌中性蛋白酶脊椎动物胶原酶表中所列的木瓜蛋白酶菠萝蛋白酶及无花果蛋白酶的活性中心均含有半胱氨酸因此能被半胱氨酸等还原所活化而被等氧化及重金属离子所抑制其余蛋白酶存在于大豆菜豆大麻玉米R I CH NH2 COOH COOH CH2 CH2 NH3+NADH 2(NADPH 2)R-CHNH2 COOH a-酮酸 转氨酶 COOH 谷氨酸 L-谷氨酸脱氢酶 OOH H2 先与:-酮戊二酸经转氨作用变为相应的酮酸与谷氨酸,谷氨酸再经谷氨酸脱氢酶作用重新 变成:-酮戊二酸,同时放出氨。这种脱氨基作用是转氨基作用和氧化脱氨基作用配合进行 的,所以叫联合脱氨基作用。其反应式如图 9-2。a-氨基酸
19、COOH a-酮戊二酸 COOH CH2 CH2+NAD(NADP)图9-2联合脱氨基反应示意图(5)脱酰胺基作用(deamidation)酰胺也可以在脱酰胺酶(deamidase作用下脱去 酰胺基,而生成氨:CONH2 酶不能水解所有肽键只能对特定羧肽酶胃蛋白酶芳香族氨基酸或其他疏水氨基酸端及端胰凝乳蛋白酶芳香族及其他疏水氨基酸端胰蛋白酶枯草杆菌蛋白酶木瓜蛋白酶碱性氨基酸端疏水氨基酸端碱性氨基酸以及含脂肪侧链和芳香侧链键要求相邻两个氨基酸上的氨基和羧基同时存在蛋白酶按基催化机理又可分为四类见表表蛋白酶的种类编号名称作用特征例子丝氨酸蛋白酶类活性中心含组氨酸和丝氨酸胰凝乳蛋白酶胰蛋白酶凝血酶硫
20、醇蛋白酶类活性中心含半胱氨性所必需的金属枯草杆菌中性蛋白酶脊椎动物胶原酶表中所列的木瓜蛋白酶菠萝蛋白酶及无花果蛋白酶的活性中心均含有半胱氨酸因此能被半胱氨酸等还原所活化而被等氧化及重金属离子所抑制其余蛋白酶存在于大豆菜豆大麻玉米CH2+H2O 谷氨酰氨酶 CH2+NH3 HNH2 CHNH2 COOH COOH 谷氨酰胺 谷氨酸 二、脱羧基作用 CONH2 COOH CH2+H2O 天冬酰胺酶 CH 2+NH 3 CHNH 2 CHNH2 COOH COOH 天冬酰胺 天冬氨酸 CH2 酶不能水解所有肽键只能对特定羧肽酶胃蛋白酶芳香族氨基酸或其他疏水氨基酸端及端胰凝乳蛋白酶芳香族及其他疏水氨基
21、酸端胰蛋白酶枯草杆菌蛋白酶木瓜蛋白酶碱性氨基酸端疏水氨基酸端碱性氨基酸以及含脂肪侧链和芳香侧链键要求相邻两个氨基酸上的氨基和羧基同时存在蛋白酶按基催化机理又可分为四类见表表蛋白酶的种类编号名称作用特征例子丝氨酸蛋白酶类活性中心含组氨酸和丝氨酸胰凝乳蛋白酶胰蛋白酶凝血酶硫醇蛋白酶类活性中心含半胱氨性所必需的金属枯草杆菌中性蛋白酶脊椎动物胶原酶表中所列的木瓜蛋白酶菠萝蛋白酶及无花果蛋白酶的活性中心均含有半胱氨酸因此能被半胱氨酸等还原所活化而被等氧化及重金属离子所抑制其余蛋白酶存在于大豆菜豆大麻玉米RCH COOH -卄 R-CH 2+CO2 NH2 天冬氨酸 谷氨酸脱羧后生成丫-氨基丁酸:3-丙氨
22、酸 HOOC CHCH2 NH2 CH2COOH CO2 -CH2 NH2 CH 2 CH2 COOH 谷氨酸 NH 吲哚丙酮酸 吲哚乙醛(1)直接脱羧基作用 氨基酸在脱羧酶(decarboxylase 催化下脱去羧基生成胺。通式如下:NH2 氨基酸脱羧普遍存在于动植物及微生物组织中,其辅酶为磷酸吡哆醛。二羧基氨基酸主要在a-位上脱羧,所生成的产物不是胺,而是另一种新的氨基酸。天冬氨酸脱羧后生成3-丙氨酸:CO2 X HOOC CHCH2COOH -CH CH2一 COOH I I NH2 NH2 Y-氨基丁酸 丫-氨基丁酸与 A酮戊二酸进行转氨反应,生成谷氨酸和琥珀酸半醛,后者被氧化成 琥珀
23、酸后进入三羧酸循环:CH 2 CH 2 CH 2 OHC CH 2 CH?COOH HOOC CH 2 CH2 COOH 琥珀酸半醛 琥珀酸 NH2 COOH Y-氨基丁酸 色氨酸在脱氨和脱羧后转变成植物生长素(吲哚乙酸):丝氨酸脱羧生成乙醇胺;乙醇胺经甲基化作用生成胆碱:H 色氨酸 COOH NH2 NH COOH CH2CHO H 吲哚乙酸 酶不能水解所有肽键只能对特定羧肽酶胃蛋白酶芳香族氨基酸或其他疏水氨基酸端及端胰凝乳蛋白酶芳香族及其他疏水氨基酸端胰蛋白酶枯草杆菌蛋白酶木瓜蛋白酶碱性氨基酸端疏水氨基酸端碱性氨基酸以及含脂肪侧链和芳香侧链键要求相邻两个氨基酸上的氨基和羧基同时存在蛋白酶按
24、基催化机理又可分为四类见表表蛋白酶的种类编号名称作用特征例子丝氨酸蛋白酶类活性中心含组氨酸和丝氨酸胰凝乳蛋白酶胰蛋白酶凝血酶硫醇蛋白酶类活性中心含半胱氨性所必需的金属枯草杆菌中性蛋白酶脊椎动物胶原酶表中所列的木瓜蛋白酶菠萝蛋白酶及无花果蛋白酶的活性中心均含有半胱氨酸因此能被半胱氨酸等还原所活化而被等氧化及重金属离子所抑制其余蛋白酶存在于大豆菜豆大麻玉米H2 CH_ OH NH2 丝氨酸 COOH H2 CH2 OH NH2 乙醇胺 CH 3)OH N+(CH3)3 胆碱 CO2 酶不能水解所有肽键只能对特定羧肽酶胃蛋白酶芳香族氨基酸或其他疏水氨基酸端及端胰凝乳蛋白酶芳香族及其他疏水氨基酸端胰蛋
25、白酶枯草杆菌蛋白酶木瓜蛋白酶碱性氨基酸端疏水氨基酸端碱性氨基酸以及含脂肪侧链和芳香侧链键要求相邻两个氨基酸上的氨基和羧基同时存在蛋白酶按基催化机理又可分为四类见表表蛋白酶的种类编号名称作用特征例子丝氨酸蛋白酶类活性中心含组氨酸和丝氨酸胰凝乳蛋白酶胰蛋白酶凝血酶硫醇蛋白酶类活性中心含半胱氨性所必需的金属枯草杆菌中性蛋白酶脊椎动物胶原酶表中所列的木瓜蛋白酶菠萝蛋白酶及无花果蛋白酶的活性中心均含有半胱氨酸因此能被半胱氨酸等还原所活化而被等氧化及重金属离子所抑制其余蛋白酶存在于大豆菜豆大麻玉米RCH2NH2 胺+。2+H2 O RCHO 胺氧化酶 醛+1/2O2 醛脱氢酶 RCOOH 酸 B-氧化 亦
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