病毒学期中作业λ噬菌体的基因调控.pdf
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1、入噬菌体的基因调控姓名:宋庆浩学号:200900140102班级:生工09.02目录入噬菌体的发现入噬菌体的结构组成1.基本结构2.X噬菌体的核心X噬菌体的生活周期I.两种发育途径简介II.调控发育途径的分子基础1.两种途径共同的早期基因表达途径2.溶源发育中基因的相互作用3.裂解途径的建立4.溶源和裂解的平衡5.溶源发育向裂解发育的转变入噬菌体的侵染过程1.吸附2.穿入3.生物合成4.成熟与释放入噬菌体的应用1.细菌的鉴定与分型2.耐药细菌感染的治疗3.分子生物学研究的重要工具4.遗传工程5.其他参考文献入噬菌体的发现:1951 年 J.Lederberg 的妻子 Esther Lederb
2、erg 证明了 J.Lederberg 和 Tatum 用来杂交的K12中有原噬菌体,并命名为入,经10年的研究搞清了溶原化的实质。在E.coli K12中是有原噬菌体的存在。Jacob和Wollman(1956年)发现了合子诱导(zygotic induction)现象,并利用合子诱导确定了几个E.coli染色体上原噬菌体的整合位点。他们发现Hfr(入)XF所得到的重组子频率要比HfrX F-(入)或Hfr(入)X F-(X )要低得多。这是由于在Hfr(入)X F-的杂交中,原噬菌体进入无阻遏物的受体细胞质中,进行大量复制使受体细胞裂解(图8-20b),因此不易得到重组子,此现象就称为合子
3、诱导。现在我们再回过头来查阅一下传递等级作图,中断杂交实验以及重组作图都是采用HfrXF(X )就是不致产生合子诱导的缘故。入噬菌体的结构组成:1 .基本结构入 噬菌体是一种温和的诱导性噬菌体,其基因组除在5,端有12个可互补的碱基外均为线性双链D N A,感染时DNA形成环状。入噬菌体的基因组长达50K b,共6 1个基因,其中38个较为重要。X -DNA的基因顺序组织如图所示,按基因组功能共分六大区域:头部编码区、尾部编码区、重组区、控制区、复制区和裂解区.ffi 2-23 N-DNA的基因顺序组织它们分属四个操纵子结构:阻遏蛋白操纵子、早期左向操纵子、早期右向操纵子以及晚期右向操纵子。在
4、显微镜下,可发现人噬菌体具有头和尾结构的复合形态。而且人噬菌体尾部没有尾丝。入噬菌体的壳体由头部和尾部组成,头部和尾部通过颈部相连。头部通常呈二十面体对称,尾部呈螺旋对称。入噬菌体属于长尾噬菌体,无收缩性。2.人噬菌体的核心6 F U(头壳而|川1人口头亮一入口.MA尾箱用林头行头无入口图五种有尾噬菌体的基本结构及其结构蛋白所在的部位D.EB.B.F II(W.WHHIIH鬟鼻一入噬菌体核心包含线状dsDNA,分子量为30.8MD,含有48502bp,其双链DNA的两5 端分别存在互补的粘性末端,其单链部分的长度为12bp。它 的1链或左链的5 端叫做m端,末端碱基为G,为左向或反时针方向转录
5、的链。r链或右链5 端称为m 端,末端碱基为A。入DNA被注人到宿主细胞后,可借助两5 端单链的氢键缔合和连接酶的作用形成闭合环状DNA。入噬菌体的生活周期人噬菌体为温和噬菌体,其感染周期有两种途径,即裂解途径和溶源途径,通过这两种途径所进行的生活周期分别称为裂解周期和溶源周期。入噬菌体的宿主是大肠杆菌长 它的线状DNA分子具有由12个核甘酸组成的互补单链黏性末端。感染宿主以后,黏性末端互补配对形成环状DNA分子,接着噬菌体基因有顺序的表达。先是早期基因表达,形成相应的阻遏蛋白,其作用是调节或抑制自身其它基因的表达,这时它可以将整个基因组整合到宿主染色体的特定区域,入噬菌体的基因除少数外,其余
6、基因都处以失活状态,随宿主染色体一起复制并传递给子代细胞。整合到宿主染色体中的噬菌体基因组称为原噬菌体或原病毒,显然原噬菌体也是繁殖和传递噬菌体自身遗传信息的一个重要形式。带有原噬菌体的细菌如大肠杆菌K(入)就称为溶原性细菌,以上过程称为溶源周期。这种溶源性细菌有两个重要特性:免疫性,由于这种细菌含有原噬菌体而产生一种阻遏蛋白,这种阻遏蛋白不但可抑制原噬菌体DNA复制,也可抑制再度感染的同类或另一近源的噬菌体DNA的复制,因而能抵抗同类噬菌体的超感染。可诱导性,通常由于原噬菌体的自发诱导,每一代可能有万分之一溶源性细菌被裂解,释放出大量入噬菌体,这一过程称为裂解周期。失去原噬菌体的细菌称为非溶
7、源性F lo u re 12.1 O lhc lambda!nic vascodc is interlocked with thecircuitry for入噬菌体的生活周期,细菌。用紫外线或化学物质如丝裂霉素C诱 导90%的溶源性细菌进入裂解周期,这是X噬菌体的部分早期基因以及晚期基因全部表达,噬菌体DNA独立地进行复制,并形成头部及尾部蛋白,从而组装成完整噬菌体释放出来。像这种在感染周期中具有裂解和溶源两种途径的噬菌体称为温和噬菌体。I.两种发育途径简介入噬菌体在裂解发育中的繁殖过程为吸附宿主、向宿主注射核酸物质、基因的复制和蛋白质的表达、宿主细胞的裂解和子代噬菌体的释放。裂解发育通过使噬
8、菌体的基因按照一定的顺序表达而完成,这样就保证了每种成分在生命周期适宜的时间表达。裂解周期可以分为两个主要的阶段:早期感染一从噬菌体DNA进入宿主到开始复制的这一段时期,主要合成与DNA复制有关的酶类,如参与DNA复制、重组和修饰的酶;晚期感染一从复制开始到最后细胞裂解释放出子代噬菌体颗粒的过程,主要合成噬菌体颗粒的蛋白质外壳,由于噬菌体需要许多不同的蛋白质外壳组建成衣壳和尾,因此基因组的绝大部分是用于执行晚期功能的。prophage:整合在细菌基因组中的噬菌体基因组噬菌体基因表达的早期阶段只有少数基因表达,并口严重依赖宿主的转录机构,例 如RNA聚合酶和。因子。这些基因被成为早早期基因(im
9、mediate earlygene)o第二类基因称为迟早期基因(delayed early gene)。裂解周期受到正调控作用,即每组基因只有受到恰当的信号刺激时才能启动表达。因此,早早期基因的表达编码了迟早期基因的调控蛋白,这种调控蛋白对于迟早期基因的表达是必需的。当噬菌体DNA开始复制时,晚 期 基 因(late gene)开始表达。晚期基因的表达需要早早期或迟早期基因的编码产物作为信号,在人噬菌体中,这种调控信号是一种抗终止因子。因此,裂解性感染通常分为三个时期:第一个时期由宿主RNA聚合酶转录噬菌体早期的转录调控因子;第二个时期的基因在前一阶段表达的调控因子的作用下进行转录,此阶段表达
10、的基因大多数为噬菌体复制所必须;第三个时期由编码噬菌体成分的基因组成,他们能够在第二个时期合成的调控因子的指导下转录。每个时期的基因都含有编码下一套基因表达所必须的转录因子基因,而本时期的基因表达也必然要受到上一阶段表达的转录因子的调控,这样裂解发育过程就形成了一种级联反应控制过程。在级联反应中,上一阶段编码的转录调控因子对下一阶段的调控作用有几种不同的机制,调控因子可能是一种新的RNA聚合酶,或者是产生一种新的。因子,从而使得RNA聚合酶在本阶段识别不同的启动子并与之结合,开启不同的基因转录;调控因子也可以是一种抗终止因子,由于抗终止过程,是 的RNA聚合酶不仅能够转录原来的基因片段,而且能
11、够越过终止子通读随后的序列。因此,RNA聚合酶越过终止子通读后期的基因,造成前期和后期基因的共同表达。在入噬菌体中,控制早早期基因向迟早期基因表达的调控因子主要是通过抗终止子起作用的。事实上,当入DNA进入新的宿主细胞时裂解和溶原化的途径并存。早早期和晚早期的基因都需要表达。然后就要分化了:若晚期基因得到表达那么就向裂解途径发育;若阻遏物C I蛋白合成被建立了,那么就要进入溶原化途径。antiterminatori tivetioi/repressor10 head gene$11 tail genes2 lysi$genesLYSOGENICESTABLISHMENTfaunediate e
12、arlyc H/c IIJ regulators-*7 recombinauon genes2 replication genesQ=antiterminatocLYSOGENICMAIOTENANCELYTIC CASCADEPROGENY PHAGE图17 2漉菌体裂解周期与溶原化周期的联系I I.调控发育途径的分子基础入噬菌体的基因组为环状结构,其中与转录调节有关的基因有:P L,P R,0 L,O R,t L l,t R l,c l,c r o,n u t R,n u t L,e l l,c I I I,t R 2,P R M,P R E 等,各基因详细的功能将在下文叙述。人噬菌体基因
13、图入噬菌体基因组为4 8 5 0 2 bp 的环状D N A 分子。图中,O R F 是彩色盒装表示;启动子用三角形箭头表示;转录子用基因上方或下方的彩色线条表示;溶源发育所需基因用红色表示;早期裂解所需基因用绿色(从 P R 开始转录)和紫色(从 P R 开始转录)表示。与细胞裂解和噬菌体头尾部有关蛋白的晚期基因转录子为紫色线条;整合和切除有关的基因(i n t 和 x i s)转录子用桔黄色表示;从 e l l 激活的启动子出开始转录的基因用换色表示;黏合位点(c o s)和噬菌体的结合位点(at t P)用黑色圆环和矩形表示。1.两种途径共同的早期基因表达途径X噬菌体早早期基因只有两个N
14、 基因和c ro 基因,他们都是有宿主的R N A 聚合酶编码的。N基因编码一种抗终止因子,它能够作用与n u t 位点,使得转录进入迟早期基因;c ro 基因的转录产物具有双重功能,既能阻止阻抑物的合成,也能关闭早早期基因的表达。迟早期基因具有两条用于复制的基因,7 条用于重组的基因和3条用于编码的基因,其中调控基因中e l l 和 c I I I 是合成阻抑物所必需的,调控因子Q 是使宿主R N A 聚合酶转录晚期基因的抗终止因子。而 Q 蛋白也是一个反终止蛋白,它使宿主的R N A 聚合酶不是在终止子t R 3 处终止,而继续合成晚期基因。因此我们可以将晚期基因分为两类:有的是噬菌体进入
15、溶原化途径所必须的,而另一类是控制进入裂解周期的。表1人噬菌体主要的调节元件及调节基因产物的功能调节元件或调节基因产物及功能.LQL,PR0R左右向转录的启动子和操纵子/R(1,2,3 4,5)右向转录的终止子,L(1,2)左向转录的终止子PRECI蛋白建立启动子,受C I I蛋白调控P加r基因启动子,受CH蛋白调控PaQQ蛋白反义RNA启动子,受C1 1蛋白调控PRMC I蛋白基因维持启动子,受C I浓度调控PR,晚期转录的启动子MM/L,nutRN蛋白左右两个反终止结合位点qutQ蛋白反终止结合位点croPL和尸R的阻遏蛋白,并可阻遏PE,抑制CI表达clPi.和PR的主要的阻遏物,并可自
16、主调控PRMe l l可以后动PRE、PI和PAQ,使人进入溶原化途径f i l l和CU组成复合物,启动旌产生c l及c ro的反义R N AN,R l R 2及 3 的反终止蛋白Q,R 4的反终止蛋白.0,PDNA复制所需的蛋白5,R,/?2裂解宿主所需的裂解酶int整合酶,使人整合到宿主的染色体中xis切除防,帮助X在att位点和宿主连接bet,exo重组蛋白,帮助人和宿主进行重组W,B,N M3,C,),E,F l ,/I I,Z头部蛋白基因U,V,G,T,H,M,L,K J J尾部蛋白基因cos(cohesive)1 2 bp的回文序列,由线状连接成环状的连接点,A蛋白切割位点A末端
17、酶,识别c o s位点,包装时将环连体切成单个的基因组想箝阂期的启动子 PL PR头部基因 尾环餐因 重娟区 鼎控区 复制区裂解基因MVBCHU3DBF/FfiUV O T H M L O J attintxis。夕 y cflfN c/c m ell O P Q SR下列行为所;5:溶原化珞原化和裂解落原化裂鼾落摩化c。维持c N打开晚期基因c/是裂解的阻遏物c m关闭阴遏物c 打开阻遏物茶因Q打开晚期基因S 1 7-3 4 噬苗体相关功能的基因液及在两种途径选择中的作用图1 7-3提供了 X噬菌体D N A的图。有一组和调节有关的基因在重组和复制有关的基因之间。在调节基因中,有早早期基因N
18、与c r o。它们是由不同的模板继转录的,N向左,c r o向右,N反终止蛋白的存在使转录持续向前(穿过终止子)进入重组基因区;向右进入复制基因区(图1 7-4)。以后,D NA末端相互连接形成了一个环状的D NA (图2-2 3)。图1 7-4表明晚期转录中转录了裂解基因等,在线状D NA的右端,而头部和尾部蛋白基因A、T在线状D NA的右端。晚期基因是作为单个的转录单位表达的,从位于Q和S之间的启动子P R 开始,此启动子是连续使用的。但 当Q蛋白缺乏时,晚期转录终止在t R 3位点,产生了长1 94 b的转录本,称为6 S R NA。当Q蛋白存在时,它阻遏了 t R 3的终止和6 s R
19、 NA的表达,结果晚期基因得到表达了。晚期的反终止的作用与N蛋白的反终止作用是相似的。p Q作用的q u t(Q-u t i li z a t i o n)正好位于晚期启动子的下游,R NA聚通过此处时,p Q与其作用消除了终止(见后)。图1 7-4 人噬菌体的启动于和不同时期的转录晚期基因的转录并不在任何特殊位点终止,它转录所有的晚期基因,进入这些基因以外的区域。左边的晚早期转录与此相似,持续穿过重组基因区。每一方向的转录都有可能在聚合酶闯入另一区域时而终止。图17-5就是比较这两种不同的策略。图17-5启动子识别转换(上)和抗终止作用(下)两种机制的差别(引自Lewin,1994)两种途径
20、共同控制人噬菌体向左向右的转录Similar controlsto left and2.溶源发育中基因的相互作用阻抑物由cl基因编码。d通过与cl基因两侧的操纵子0L和OR的结合而阻止RNA聚合酶起始转录。Figure 12.14 The lambda regulatory region contains a cluster of-acting functions and c/5-actiiigelements.Figure 12.14 X噬菌体具有复杂的调控区当阻抑物cl与PL/QL和PR/QR结合,则抑制了早期基因的转录;否则早期基因得到转录和表达cl与0L结合,阻止了 RNA聚合酶从PL
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- 病毒学 期中 作业 噬菌体 基因 调控
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