生物化学9酶促反应动力学 PPT课件.ppt
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1、2006-1-7上海大学生命科学学院第九章第九章 酶促反应动力学酶促反应动力学一、化学动力学基础一、化学动力学基础二、底物浓度对酶反应速率的影响二、底物浓度对酶反应速率的影响三、酶的抑制作用三、酶的抑制作用四、温度对酶反应速度的影响四、温度对酶反应速度的影响五、五、pHpH对酶反应的影响对酶反应的影响六、激活剂对酶反应的影响六、激活剂对酶反应的影响2006-1-7上海大学生命科学学院一、化学动力学基础一、化学动力学基础化化学学反反应应的的两两个个基基本本问问题题:(1 1)反反应应进进行行的的方方向向、可可能性和限度;(能性和限度;(2 2)反应进行的速率和反应机制。)反应进行的速率和反应机制
2、。(一)反应速率及其测定(一)反应速率及其测定反反应应速速率率是是以以单单位位时时间间内内反反应应物物或或生生成成物物浓浓度度的的改改变变来来表示。用瞬时速率表示反应速率:表示。用瞬时速率表示反应速率:v=dc/dt反反应应速速率率的的测测定定实实际际上上就就是是测测定定不不同同时时间间的的反反应应物物或或生生成物的浓度。成物的浓度。2006-1-7上海大学生命科学学院(二)反应分子数和反应级数(二)反应分子数和反应级数1.1.反应分子数:反应分子数:在反应中真正相互作用的分子的数目。在反应中真正相互作用的分子的数目。单分子反应,双分子反应,单分子反应,双分子反应,判判断断一一个个反反应应是是
3、单单分分子子反反应应还还是是双双分分子子反反应应,应应先先了了解解反应机制,即反应过程中各个单元反应是如何进行的。反应机制,即反应过程中各个单元反应是如何进行的。2.2.反反应应级级数数:根根据据实实验验结结果果,整整个个化化学学反反应应的的速速率率服服从哪种分子反应速率方程式,则这个反应即为几级反应。从哪种分子反应速率方程式,则这个反应即为几级反应。一级反应,二级反应,一级反应,二级反应,零级反应。,零级反应。2006-1-7上海大学生命科学学院(三)各级反应的特征(三)各级反应的特征1.1.一级反应一级反应凡凡是是反反应应速速率率只只与与反反应应物物的的浓浓度度的的一一次次方方成成正正比比
4、的的,这这种反应就称为一级反应。种反应就称为一级反应。速速率率常常数数与与半半衰衰期期成成反反比比,半半衰衰期期与与反反应应物物的的初初浓浓度度无无关。关。2.2.二级反应二级反应凡凡是是反反应应速速率率与与反反应应物物浓浓度度二二次次方方(或或两两种种物物质质浓浓度度的的乘积)成正比的,这种反应就称为二级反应。乘积)成正比的,这种反应就称为二级反应。半衰期与初浓度成反比。半衰期与初浓度成反比。3.3.零级反应零级反应凡凡是是反反应应速速率率与与反反应应物物浓浓度度无无关关而而受受它它种种因因素素影影响响而而改改变的反应。变的反应。半衰期与初始浓度成正比。半衰期与初始浓度成正比。2006-1-
5、7上海大学生命科学学院二、底物浓度对酶反应速率的影响二、底物浓度对酶反应速率的影响(一)中间络合物学说(一)中间络合物学说19031903年,年,HenriHenri用蔗糖用蔗糖酶水解蔗糖的实验酶水解蔗糖的实验在在低低底底物物浓浓度度时时,反反应应速速度度与与底底物物浓浓度度成成正正比比,表表现现为为一一级级反应反应特征。特征。随随着着底底物物浓浓度度的的增增加加,反反应应速速度度不不再再按按正正比比升升高高,反反应应表表现现为为混合级反应混合级反应。当当底底物物浓浓度度达达到到一一定定值值,反反应应速速度度达达到到最最大大值值(V Vmaxmax),此此时时再再增增加加底底物物浓浓度度,反反
6、应应速速度度不再增加,表现为不再增加,表现为零级反应零级反应。2006-1-7上海大学生命科学学院酶与底物的中间络合物学说(酶与底物的中间络合物学说(HenriHenri和和WurtzWurtz)S+E ES P+E中间产物假说证据:中间产物假说证据:(1)ES复合物已被电子显微镜和X射线晶体结构分析直接观察到。(2)酶和底物的光谱特性在形成ES后发生变化。(3)酶的物理性质经常在形成ES后发生变化。(4)已分离得到ES复合物。(5)平衡透析时,底物浓度在半透膜内外不等。(二)酶促反应的动力学方程式(二)酶促反应的动力学方程式1.1.米氏方程式的推导米氏方程式的推导推导原则推导原则:从酶被底物
7、饱和的现象出发,按照从酶被底物饱和的现象出发,按照 “稳态平衡稳态平衡”假说的设想进行推导。假说的设想进行推导。米氏方程米氏方程:米氏常数米氏常数:米米氏氏方方程程的的推推导导令令:将将(4)代入代入(3),则,则:ES生成速度生成速度:,ES分解速度分解速度:即即:则则:(1)经整理得经整理得:由于酶促反应速度由由于酶促反应速度由ES决定,即决定,即,所以所以(2)将将(2)代入代入(1)得得:(3)当酶反应体系处于当酶反应体系处于恒态恒态时时:当当Et=ES时时,(4)所以所以 酶反应速度与底物酶反应速度与底物酶反应速度与底物酶反应速度与底物浓度的关系曲线浓度的关系曲线浓度的关系曲线浓度的
8、关系曲线当S Km时当SKm时当S=Km时本条件可准确测定酶活力Km的物理意义2006-1-7上海大学生命科学学院2.2.动力学参数的意义动力学参数的意义(1 1)米氏常数的意义)米氏常数的意义a a.不不同同的的酶酶具具有有不不同同K Km m值值,它它是是酶酶的的一一个个重重要要的的特特征征物物理常数理常数,只与酶的性质有关,而与其浓度无关。只与酶的性质有关,而与其浓度无关。b b.K.Km m值值只只是是在在固固定定的的底底物物,一一定定的的温温度度和和pHpH条条件件下下,一一定的缓冲体系中测定的,不同条件下具有不同的定的缓冲体系中测定的,不同条件下具有不同的K Km m值。值。c c
9、.K.Km m值值表表示示酶酶与与底底物物之之间间的的亲亲和和程程度度:K Km m值值大大表表示示亲亲和和程程度度小小,酶酶的的催催化化活活性性低低;K Km m值值小小表表示示亲亲和和程程度度大大,酶的催化活性高。酶的催化活性高。(同同一一种种酶酶有有几几种种底底物物就就有有几几个个K Km m值值,其其中中K Km m值值最最小小的的底物一般称为该酶的最适底物或天然底物)底物一般称为该酶的最适底物或天然底物)一一般般情情况况下下,1/K1/Km m可可以以近近似似地地表表示示酶酶对对底底物物的的亲亲和和力力大小,大小,1/K1/Km m愈大,表明亲和力愈大。愈大,表明亲和力愈大。所以所以
10、1/K1/Km m表示形成表示形成ESES的趋势大小的趋势大小特例:特例:K Km m=K=K2 2/K/K1 1=K=Ks s(在在K K3 3K K1 1,K K2 2时时)d d.K Km m与与K Ks s K Km m不等于不等于K Ks s。在。在K K3 3K1K1、K K2 2时,时,K Km m看作看作K Ks s,也只,也只有此时有此时1/1/K Km m 才可以近似表示酶与底物结合的难易程度。才可以近似表示酶与底物结合的难易程度。e.e.K Km m与与K Km m 无抑制剂时,无抑制剂时,ESES的分解速度与形成速度的比值的分解速度与形成速度的比值符合米氏方程,为符合米
11、氏方程,为K Km m;而有抑制剂时发生变化,则不符合而有抑制剂时发生变化,则不符合米氏方程,为米氏方程,为K Km m 。2006-1-7上海大学生命科学学院f f.K.Km m和米氏方程和米氏方程的实际应用的实际应用 若已知某个酶的若已知某个酶的K Km m值,可以计算在某一个底物浓度值,可以计算在某一个底物浓度时,反应速度相当于最大反应速度的百分率。时,反应速度相当于最大反应速度的百分率。g g.K.Km m可以帮助推断某一反应的方向和途径可以帮助推断某一反应的方向和途径2006-1-7上海大学生命科学学院(2 2)V Vmaxmax和和k k3 3(k(kcatcat)的意义的意义在在
12、一一定定的的酶酶浓浓度度下下,V Vmaxmax是是一一个个常常数数,它它只只与与底底物物的的种种类及反应条件有关。类及反应条件有关。当当SS很大时,很大时,V Vmaxmax=K=K3 3 E EK K3 3代表酶被底物饱和时每秒钟每个酶分子转换底物的分代表酶被底物饱和时每秒钟每个酶分子转换底物的分子数,称为子数,称为转换数(或催化常数,转换数(或催化常数,K Kcatcat),表明酶的最表明酶的最大催化效率。大催化效率。转转换换数数的的倒倒数数即即为为催催化化周周期期:一一个个酶酶分分子子每每催催化化一一个个底底物分子所需的时间。物分子所需的时间。乳糖脱氢酶转换数为1000/秒,则它的催化
13、周期为10-3秒(3 3)K Kcatcat/K/Km m 的意义的意义在生理条件下,在生理条件下,S/Km=0.011.0SKm 时:K Kcatcat/K/Km m的上限是的上限是K K1 1,即生成,即生成ESES复合物的速度复合物的速度(酶促反应的速度酶促反应的速度不会超过不会超过ESES的形成速度的形成速度K K1 1,在水相中不会超过,在水相中不会超过10108 810109 9)衡量酶催化效率的参数:即其大衡量酶催化效率的参数:即其大小可以比较不同酶或同一种酶催小可以比较不同酶或同一种酶催化不同底物的催化效率化不同底物的催化效率2006-1-7上海大学生命科学学院只有只有K Kc
14、atcat/K/Km m可以客观地比较不同的酶或同一种酶催化可以客观地比较不同的酶或同一种酶催化不同底物的催化效率不同底物的催化效率2006-1-7上海大学生命科学学院3.3.利用作图法测定利用作图法测定K Km m和和V Vmaxmax值值(1 1)Lineweaver-BurkLineweaver-Burk 双倒数作图法双倒数作图法米氏方程的双倒数形式:米氏方程的双倒数形式:基基本本原原则则:将将米米氏氏方方程程变变化化成成相相当当于于y=ax+by=ax+b的的直直线线方方程,再用作图法求出程,再用作图法求出K Km m。1 K Km m 1 1 =.+v Vmax S Vmax 200
15、6-1-7上海大学生命科学学院(2 2)Eadie-Hofstee Eadie-Hofstee 作图法作图法vv/S/S作图法作图法v=Vmax Km vSSvSvVmax-Km2006-1-7上海大学生命科学学院(3 3)Hanes-Woolf Hanes-Woolf 作图法作图法SSSSvVmaxVmaxKm 1 K Km m 1 1 =.+v Vmax S Vmax 在在两边均乘以两边均乘以SS:以以 SS作图作图Sv-KmSvSSVmax1 1(4 4)Eisenthal Eisenthal 作图法作图法(5 5)Hill Hill 作图法作图法(寡聚酶)-LogKmLogS2006-
16、1-7上海大学生命科学学院(三)多底物的酶促反应(三)多底物的酶促反应1.1.多底物酶促反应按动力学机制分类多底物酶促反应按动力学机制分类有序反应有序反应只有Leading substrate(领先底物A)首先与酶结合,然后B才能与酶结合,形成的三元复合物EAB(ternary complex)转变为EPQ,B 的产物P先释放,A的产物Q后释放。在缺少A时,B不能与E结合E+A+BE+A+BAEBPEQE+P+QAEBPEQE+P+Q(1 1)序列反应)序列反应2006-1-7上海大学生命科学学院E AE AEB QEP QE EABPQPEAAEAEBQEPBQEQA A与其产物与其产物Q
17、Q相互竞争地结合相互竞争地结合E E,但,但A A和和B B互不竟争互不竟争反应的总方向决定于A、Q的浓度和反应的平衡常数NAD 与NADH相互竞争E上的NAD结合部位随机反应随机反应底物A、B与酶结合的顺序是随机的,形成的三元复合物AEB QEP,产物P、Q的释放顺序也是随机的。限速步骤是限速步骤是AEB QEPAEB QEPA A与与Q Q相相互互竞竞争争E E上上的的底底物物结结合合部部位位A A,B B 与与P P相相互互竞竞争争E E上上的的底物结合部位底物结合部位B B反应的总方向决定于反应的总方向决定于A A、B B、Q Q、P P的浓度和反应的平衡常数的浓度和反应的平衡常数(2
18、 2)乒乓反应乒乓反应底物A先与E结合成AE二元复合物,AE PF(修饰酶形式),释放第一个产物P,接着底物B与F形成FB,FB EQ,释放第二个产物Q。A与Q 竞争自由酶形式E,B与P竞争修饰酶形式F。整个反应历程中只有二元复合物形式,没有三元复合物形式。2.2.双底物反应的动力学方程双底物反应的动力学方程(1 1)乒乓机制的动力学方程乒乓机制的动力学方程K Km mA A:BB达到饱和浓度时达到饱和浓度时A A的米氏常数的米氏常数K Km mAA:A A的表观米氏常数的表观米氏常数V Vmaxmax:ABAB都达到饱和浓度时的最大反应速度都达到饱和浓度时的最大反应速度2006-1-7上海大
19、学生命科学学院乒乓机制的动力学曲线是两组平行直线表观米氏常数KmA(KmB)随B(A)浓度的增大而增大表观最大反应速度Vmax随B(A)的增大而增大(2 2)序列机制的底物动力学方程序列机制的底物动力学方程2006-1-7上海大学生命科学学院序列机制的动力学曲线是两组相交直线(交于序列机制的动力学曲线是两组相交直线(交于X轴负侧)轴负侧)交交点点在在X轴轴:表表观观KmA(KmB)不不随随B(A)浓浓度度变变化化而变化(而变化(KmA=KmA 、KmB=KmB)交交点点在在X轴轴上上:表表观观KmA(KmB)随随B(A)浓浓度度的的增增加而减小加而减小交交点点在在X轴轴下下:表表观观KmA(K
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