微生物遗传育种,基因突变 PPT课件.ppt
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1、 第二章第二章 基因突变和诱变育种基因突变和诱变育种第一节第一节 概述:概述:突变的定义及其分类突变的定义及其分类一、突变的定义一、突变的定义 突变的概念最早是由荷突变的概念最早是由荷兰植物学家兰植物学家 H.de.Vries于于19011901年提出的。他在自家的年提出的。他在自家的菜地上找到一种野生型的拉菜地上找到一种野生型的拉马月见草(马月见草(Oenothera lamarckiana)这种植物具)这种植物具有惊人的产生遗传新类型的有惊人的产生遗传新类型的性质,性质,de.Vriesde.Vries把这些新把这些新类型称为类型称为“突变突变”。1、突变(、突变(Mutation):指遗
2、传物质发生了稳定):指遗传物质发生了稳定的可遗传的变化,所有的突变都是的可遗传的变化,所有的突变都是DNA结构中碱结构中碱基所发生的改变。基所发生的改变。2、突变体(、突变体(Mutant):携带突变的生物个体或):携带突变的生物个体或群体或株系,称为突变体。群体或株系,称为突变体。3、突变基因(、突变基因(Mutant Gene)和野生型基因)和野生型基因(Wild Gene):发生了突变的基因称为突变基):发生了突变的基因称为突变基因,没有发生突变的基因称为野生型基因。因,没有发生突变的基因称为野生型基因。突变包括染色体数量的变化和染色体上突变包括染色体数量的变化和染色体上基因本身的变化等
3、多种多样的现象。基因本身的变化等多种多样的现象。染色体较大范围结构的变化称为染色体畸变染色体较大范围结构的变化称为染色体畸变(Chromosomal aberration),即),即DNA的大段变的大段变化(损伤)的现象。染色体上基因本身的变化称化(损伤)的现象。染色体上基因本身的变化称为基因突变(为基因突变(Gene Mutation)。染色体数量变)。染色体数量变化和染色体畸变对进化学家和植物育种学家来说化和染色体畸变对进化学家和植物育种学家来说相当重要,对于微生物遗传及育种来说不如基因相当重要,对于微生物遗传及育种来说不如基因突变重要。突变重要。二、基因符号与命名规律二、基因符号与命名规
4、律 1946年,年,J.lederberg发现细菌杂交时,发现细菌杂交时,E.coli菌中所报导的突变型不过十几个,大菌中所报导的突变型不过十几个,大约二十年后,在约二十年后,在E.coli中已经定位的基因有中已经定位的基因有650个,大约又十年后增加了个,大约又十年后增加了200个,到个,到1983年这个数字已经增加到年这个数字已经增加到1027个。个。基因命名规则:基因命名规则:1、每一个基因座位都用斜体小写的、每一个基因座位都用斜体小写的3个字母来表示,一般个字母来表示,一般这三个字母是代表该基因的一个或两个或三个英文单词的这三个字母是代表该基因的一个或两个或三个英文单词的前三个字母。如
5、色氨酸基因前三个字母。如色氨酸基因trp(tryptophan),但也有例),但也有例外,如外,如xis(excision)是切除修复基因。)是切除修复基因。2、产生同样表型的不同基因座位,在上述斜体小写的英文、产生同样表型的不同基因座位,在上述斜体小写的英文3个字母后加上一个斜体的大写字母以示区别,如个字母后加上一个斜体的大写字母以示区别,如trp A。3、一个基因的不同突变位点是在这个突变基因座位符号后,、一个基因的不同突变位点是在这个突变基因座位符号后,按分离先后次序用数字来表示,如果不知道这些突变属于按分离先后次序用数字来表示,如果不知道这些突变属于哪一个基因座位,则用哪一个基因座位,
6、则用“”来代替。来代替。如如trp A 23,trp 544、表型特性同样用、表型特性同样用3个字母来表示,但第一个字母大写,个字母来表示,但第一个字母大写,以便于基因符号清楚的区别。以便于基因符号清楚的区别。5、细菌对抗生素和、细菌对抗生素和phage的抗性突变表示为的抗性突变表示为r,野生型的菌,野生型的菌对抗生素和对抗生素和phage均为敏感型均为敏感型s,写突变体基因型可以写,写突变体基因型可以写strr或或str-r或或strB strA,写表型时,写表型时,Strr。6、一般用、一般用“”表示一个座位野生型等位基因,表示一个座位野生型等位基因,“”表表示突变型等位基因,一般不写示突
7、变型等位基因,一般不写“”。7、菌株用简单的序号表示,不同的实验室采用不同的英文、菌株用简单的序号表示,不同的实验室采用不同的英文字母作字首,菌株编号不用斜体。一个菌株第一次在论文字母作字首,菌株编号不用斜体。一个菌株第一次在论文中出现时,应详细描述其基因型及相关表型。中出现时,应详细描述其基因型及相关表型。菌株编号菌株编号 性别性别 基因型基因型 表型表型E.coli CSH1 F trpB Trp lacZ Lac thi B1 strA strr8、当染色体上存在缺失时,可用、当染色体上存在缺失时,可用“”来表示,缺失的部来表示,缺失的部分表示在分表示在“”符号后面的括号中,例如符号后面
8、的括号中,例如(Lac,pro)表)表示染色体上乳糖示染色体上乳糖发发酵基因到脯氨酸基因酵基因到脯氨酸基因这这一段染色体一段染色体发发生生缺失。缺失。9、在基因符号书写时,一般应先写生化缺陷标记,然后是、在基因符号书写时,一般应先写生化缺陷标记,然后是糖发酵标记、抗药性标记和形态变异标记,最后是象糖发酵标记、抗药性标记和形态变异标记,最后是象phage一类附加体在细菌中的存在状态或细菌对这类附加一类附加体在细菌中的存在状态或细菌对这类附加体的反应和抑制基因的符号。体的反应和抑制基因的符号。例如:例如:CGSC4252:F 105T thr-1 leuB6 thi-1 argE3 his-4 p
9、roA2 recA13 lacY1 galK2 mtl-1 xyl-5 ara-14 rpsL31 tsx-33 -supE44 三、突变的分类三、突变的分类1、按照突变生成的过程(或原因)来看:可分为自发突变、按照突变生成的过程(或原因)来看:可分为自发突变和诱发突变。和诱发突变。2、从、从DNA碱基序列改变多少来分可分为单点突变和多点碱基序列改变多少来分可分为单点突变和多点突变。突变。点突变点突变碱基替代碱基替代碱基插入碱基插入碱基缺失碱基缺失颠换颠换转换转换3、从阅读框架的影响来看有所谓的移框突变。、从阅读框架的影响来看有所谓的移框突变。4、从对遗传信息的改变来看可将点突变中的碱基替代进
10、一、从对遗传信息的改变来看可将点突变中的碱基替代进一步分为:同义突变(步分为:同义突变(synomymous mutation),错义突变错义突变(missense mutation),无义突变(无义突变(nonsense mutation)。)。5、从突变的效应背离或返回到野生型这两种方向来看分为、从突变的效应背离或返回到野生型这两种方向来看分为正向和回复突变两种。正向和回复突变两种。6、从突变的位点存在于负责基因调控的、从突变的位点存在于负责基因调控的DNA序列当中来序列当中来看分为启动子上升突变和下降突变。看分为启动子上升突变和下降突变。7、从基因突变所带来的表型改变来看分为选择性突变和
11、非、从基因突变所带来的表型改变来看分为选择性突变和非选择性突变。选择性突变。突变株突变株的表型的表型选择性突变选择性突变营养缺陷型营养缺陷型抗性突变型抗性突变型条件致死型条件致死型非选择性突变非选择性突变形态突变型形态突变型抗原突变型抗原突变型产量突变型产量突变型第二节第二节 基因突变的规律基因突变的规律一、不对应性一、不对应性 即突变的性状与引起突变即突变的性状与引起突变的原因无直接对应关系。的原因无直接对应关系。1.波动试验波动试验(Fluctuation test)又称变又称变量试验或彷徨试验量试验或彷徨试验第二节第二节 基因突变的规律基因突变的规律1943年年,S.E.Luria和和M
12、.Delbrck发表发表了利用波动试验研究细菌抗噬菌了利用波动试验研究细菌抗噬菌体突变的论文,揭开了细菌遗传学的体突变的论文,揭开了细菌遗传学的新篇章。新篇章。第二节第二节 基因突变的规律基因突变的规律Luria等的波动试验等的波动试验2.涂布试验涂布试验(Plate spread或或Newcombe experiment)第二节第二节 基因突变的规律基因突变的规律1949年,年,H.Newcombe设计设计了一种与波动试验相似,但方法更为了一种与波动试验相似,但方法更为简单的证实突变自发性的试验简单的证实突变自发性的试验涂涂布试验。布试验。第二节第二节 基因突变的规律基因突变的规律Newco
13、mbe的的涂布试验涂布试验第二节第二节 基因突变的规律基因突变的规律3.影印试验影印试验(Replica plating)1952年,年,J.和和E.Lederberg夫妇发明了一种直接证明突变自发夫妇发明了一种直接证明突变自发性的方法性的方法-影印培养法,证明影印培养法,证明了细菌的抗药性是发生在加入药物了细菌的抗药性是发生在加入药物之前的,而药物的作用仅是把突变之前的,而药物的作用仅是把突变型筛选出来。型筛选出来。第二节第二节 基因突变的规律基因突变的规律Lederberg等等设计的平板影印培养法设计的平板影印培养法第二节第二节 基因突变的规律基因突变的规律二、自发性二、自发性各种性状的突
14、变,可以在没有人各种性状的突变,可以在没有人为的诱变因素下自发地发生。为的诱变因素下自发地发生。第二节第二节 基因突变的规律基因突变的规律三、稀有性三、稀有性自发突变虽可随时发生,但其突变自发突变虽可随时发生,但其突变率却是极低和稳定的,一般在率却是极低和稳定的,一般在10-610-9之间。但特定微生物的某一特定性状之间。但特定微生物的某一特定性状的突变率是一定的。的突变率是一定的。第二节第二节 基因突变的规律基因突变的规律1 突变率的概念突变率的概念突变率的一般定义为突变率的一般定义为:任何一个菌任何一个菌体在一定时间内所发生突变的几率。体在一定时间内所发生突变的几率。突变速率突变速率(mu
15、tation rate):是指在每是指在每世代每细胞世代每细胞(或个体或个体)发生的特定的突发生的特定的突变事件的平均几率变事件的平均几率(mutation per cell per generation)。第二节第二节 基因突变的规律基因突变的规律1 突变率的概念突变率的概念突变频率突变频率(mutation frequency):是是指在群体内突变型的频率。它未必能指在群体内突变型的频率。它未必能反映突变发生的速率。因此,我们常反映突变发生的速率。因此,我们常说的突变率是指突变速率。说的突变率是指突变速率。第二节第二节 基因突变的规律基因突变的规律2 突变率的计算突变率的计算 mtm0 m
16、tm0M=0.69 (ntn0)/ln2 (ntn0)式式中中 M为突变率,为突变率,mt是是t时的时的突变细菌突变细菌数,数,m0为零时的突变细菌数,为零时的突变细菌数,nt为为t时细时细菌总数,菌总数,n0为零时的细菌总数。为零时的细菌总数。第二节第二节 基因突变的规律基因突变的规律2 突变率的计算突变率的计算例例:有一株有一株Tons E.coli菌菌,从从103个细胞个细胞/ml培培养至养至108/ml,涂于营养琼脂平皿上,喷上涂于营养琼脂平皿上,喷上T1噬菌体噬菌体,经培养后经培养后,长出长出10个个Tonr菌株菌株.求突变求突变率。率。100M=0.69 1107 108 103第
17、二节第二节 基因突变的规律基因突变的规律四、独立性四、独立性突变的发生一般是独立的,即在某一群突变的发生一般是独立的,即在某一群体中体中,既可发生抗青霉素的突变型,也可发既可发生抗青霉素的突变型,也可发生抗链霉素的突变型或其它药物的突变型,生抗链霉素的突变型或其它药物的突变型,而且还可发生任何性状的突变型而且还可发生任何性状的突变型.某一基因某一基因的突变的突变,既不提高也不降低其他任何基因的既不提高也不降低其他任何基因的突变率。突变率。第二节第二节 基因突变的规律基因突变的规律五、诱变性五、诱变性某些物理化学因素显著提高突变率的某些物理化学因素显著提高突变率的作用称为诱变作用称为诱变.通过诱
18、变剂的作用,可以提通过诱变剂的作用,可以提高自发突变的几率,一般可提高高自发突变的几率,一般可提高10105倍。倍。第二节第二节 基因突变的规律基因突变的规律六、稳定性六、稳定性七、可逆性七、可逆性第三节第三节 诱变的机制诱变的机制一、碱基类似物在一、碱基类似物在DNA复制复制时的掺入时的掺入第三节第三节 诱变的机制诱变的机制1.5-溴尿嘧啶(溴尿嘧啶(5-BU)第三节第三节 诱变的机制诱变的机制2.2-氨基嘌呤(氨基嘌呤(2-aminopurine,2-AP)第三节第三节 诱变的机制诱变的机制第三节第三节 诱变的机制诱变的机制二、二、DNA分子上碱基的化学分子上碱基的化学修饰修饰第三节第三节
19、 诱变的机制诱变的机制1.亚硝酸(亚硝酸(nitrous acid)引起的氧化引起的氧化脱氨反应脱氨反应凡是含有凡是含有NH2的碱基(的碱基(A,G,C)都都可以被亚硝酸作用,产生氧化脱氨反应,可以被亚硝酸作用,产生氧化脱氨反应,使氨基变为酮基,然后改变配对性质,造使氨基变为酮基,然后改变配对性质,造成碱基转换突变。成碱基转换突变。第三节第三节 诱变的机制诱变的机制第三节第三节 诱变的机制诱变的机制2.NH2OH的致突变作用的致突变作用羟羟胺(胺(HA)是一种重要的化学诱变剂,是一种重要的化学诱变剂,但其作用机制比较复杂。在不同的但其作用机制比较复杂。在不同的pH和不同和不同的的NH2OH浓度
20、时有不同的产物。在浓度时有不同的产物。在pH6.0,浓度浓度0.11.0mol/L时,它专一地与胞嘧啶起时,它专一地与胞嘧啶起反应,将胞嘧啶转变为只能与反应,将胞嘧啶转变为只能与A配对的修饰配对的修饰碱基碱基羟基亚胺(羟基亚胺(Hydoxylimine)碱基,碱基,从而导致从而导致GCAT的转换。的转换。第三节第三节 诱变的机制诱变的机制第三节第三节 诱变的机制诱变的机制3.烷基化试剂的致突变作用烷基化试剂的致突变作用(1)烷化剂的概念:)烷化剂的概念:生物学上的烷化剂是指在正常生理生物学上的烷化剂是指在正常生理条件下,能将烷基转移给重要的生物分条件下,能将烷基转移给重要的生物分子的一类化合物
21、。子的一类化合物。第三节第三节 诱变的机制诱变的机制(2)烷化剂的分类:)烷化剂的分类:根据分子中反应烷基数目(即功能根据分子中反应烷基数目(即功能基)的多寡,可将烷化剂分成单功能或基)的多寡,可将烷化剂分成单功能或多功能的烷化剂两大类。多功能的烷化剂两大类。第三节第三节 诱变的机制诱变的机制(3)常见(用)的烷化剂:)常见(用)的烷化剂:乙基磺酸乙酯(乙基磺酸乙酯(EES)、)、甲基磺酸乙酯甲基磺酸乙酯(EMS)、)、硫酸二乙酯(硫酸二乙酯(DES)和亚硝基和亚硝基胍(胍(NTG)等,(详见下表)。等,(详见下表)。第三节第三节 诱变的机制诱变的机制第三节第三节 诱变的机制诱变的机制第三节第
22、三节 诱变的机制诱变的机制(4)烷化剂的作用机制:)烷化剂的作用机制:烷化剂能与烷化剂能与DNA分子的许多部位发分子的许多部位发生作用,结果使生作用,结果使DNA分子增加了烷基侧分子增加了烷基侧链(烷基化作用),从而改变了链(烷基化作用),从而改变了DNA的的分子结构,引起生物体发生突变。分子结构,引起生物体发生突变。第三节第三节 诱变的机制诱变的机制A 直接诱发碱基错配:直接诱发碱基错配:鸟嘌呤鸟嘌呤N7位置上的烷化有利于发生位置上的烷化有利于发生电离作用,而离子化的鸟嘌呤则应该具电离作用,而离子化的鸟嘌呤则应该具有同有同T而不是同而不是同C配对的倾向,因此,便配对的倾向,因此,便能产生能产
23、生GCAT的转换。的转换。第三节第三节 诱变的机制诱变的机制B 错误修复:错误修复:鸟嘌呤鸟嘌呤N7烷化作用的另一种效应是使烷化作用的另一种效应是使鸟嘌呤碱基与糖鸟嘌呤碱基与糖-磷酸的键合削弱,从而导磷酸的键合削弱,从而导致烷化的鸟嘌呤从致烷化的鸟嘌呤从DNA上逐渐地脱落下来,上逐渐地脱落下来,这个过程就是所谓的这个过程就是所谓的“烷化脱嘌呤作用烷化脱嘌呤作用”。脱嘌呤形成了分子裂缝,在随后的脱嘌呤形成了分子裂缝,在随后的DNA复复制过程中便会产生转换或颠换。制过程中便会产生转换或颠换。第三节第三节 诱变的机制诱变的机制(5)NTG(NNG)的作用特点:的作用特点:第三节第三节 诱变的机制诱变
24、的机制三、嵌合剂的致突变作用三、嵌合剂的致突变作用吖啶类吖啶类染料和染料和ICR类化合物是通过同类化合物是通过同DNA分子结合而发生诱变作用的两类主要的分子结合而发生诱变作用的两类主要的化学诱变剂。吖啶类化合物主要有原黄素,化学诱变剂。吖啶类化合物主要有原黄素,5-氨基吖啶、吖啶橙等。氨基吖啶、吖啶橙等。ICR化合物是指由化合物是指由美国癌症研究所应用化学方法合成的美国癌症研究所应用化学方法合成的(Institute for Cancer Research),是一些由是一些由烷化剂和吖啶类相结合的化合物。烷化剂和吖啶类相结合的化合物。第三节第三节 诱变的机制诱变的机制致突变作用的机理:诱发移码
25、突变致突变作用的机理:诱发移码突变吖啶类吖啶类化合物都是平面的三环化合物,化合物都是平面的三环化合物,大小和嘌呤大小和嘌呤-嘧啶对大致相等,在水溶液中嘧啶对大致相等,在水溶液中能与碱基堆积在一起,并插入到两个碱基对能与碱基堆积在一起,并插入到两个碱基对之间,这一过程称为嵌入(之间,这一过程称为嵌入(intercalation)。)。一个吖啶分子嵌入后,当一个吖啶分子嵌入后,当DNA分子复制转录分子复制转录时,在顺序中发现一个或两个时,在顺序中发现一个或两个“额外额外”碱基,碱基,造成识别和阅读错误,产生移码突变。有时造成识别和阅读错误,产生移码突变。有时也有很低频率的单碱基缺失,引起移码突变。
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