T∕CACM 013-2016 金银花快速 PCR 鉴定.docx
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1、ICS : 1 1 . 120 . 99C1 0/29团体 标 准T/CACM 01 3 201 6金银花快速PCR鉴定Quickly PCR identification of Lonicerae Japonicae Flos2016- 12- 12 发布2016- 12- 12 实施中 华 中 医 药 学 会 发 布目 次前言 玉1 范围 12 规范性引用文件 13 术语和定义 14 方案 25 仪器设备 26 试剂和溶液配制 27 检验程序 38 结果判定 49 结果报告 410 质量保证 411 废弃物处理 5附录 A 6前 言本标准的全部技术内容为推荐性。本标准是对 中华人民共和国药
2、典 标准的补充。本标准由中华中医药学会归口。本标准起草单位 : 中国中医科学院中药资源中心 、国药种业有限公司。本标准主要起草人 : 袁媛 、黄璐琦 、蒋超 、赵玉洋 、周骏辉 、何雅莉 、王继永。请注意本标准的某些内容有可能涉及专利 , 本标准的发布机构不应承担识别这些专利的责任。玉T/CACM 0132016金银花快速 PCR 鉴定1 范围本标准规定了使用快速 PCR 鉴定金银花药材和饮片 、种子种苗的通用方法和要求。 本标准适用于金银花药材和饮片 、种子种苗鉴定。2 规范性引用文件下列文件中的条款通过本标准的引用而成为本标准的条款 。凡是注日期的引用文件 , 其随后所有 的修改单 ( 不
3、包括勘误的内容) 或修订版均不适用于本标准 。凡是不注日期的引用文件 , 其最新版 本适用于本标准。 中华人民共和国药典GB/T 6682 分析实验室用水规格和试验方法GB/T 23632 进境植物检疫截获有害生物鉴定复核规程GB/T 27403 实验室质量控制规范食品分子生物学检测GB/T 3543郾 5 农作物种子检验规程真实性和品种纯度鉴定GB/T 3543郾 1 农作物种子检验规程总则3 术语和定义下列术语和定义适用于本标准。3郾 1送检样品 test sample按一定规则取自某一整体的一个或多个部分 , 并能反映该整体的相关信息 , 可以作为判断该整体的基础。3郾 2DNA 提取
4、DNA extraction从样品中提取出 DNA 的方法。3郾 3DNA 扩增 DNA amplification通过一定技术使一段特定的 DNA 片段拷贝数增加的过程 , 可通过聚合酶链式反应扩增技术实现。 3郾 4聚合酶链式反应 polymerase chain reaction ( PCR)模板 DNA 先经高温变性为单链 , 两条引物分别与模板 DNA 两条链上相应的一段互补序列发生退 火 , 在 DNA 聚合酶的作用下 , 以四种脱氧核糖核酸 ( dNTP) 为底物 , 使退火引物得以延伸 , 然后不 断重复变性 、退火和延伸这一循环 , 使位于两段已知序列之间的 DNA 片段拷贝
5、数呈几何倍数增长。 其扩增产物可通过多种特异性和敏感性好的方法进行检测。3郾 5阳性对照 positive control一般使用对照样品代替送检样品同法 DNA 提取 、靶核酸扩增和产物检测过程 , 用于证明鉴定过 程可获得目标核酸片段的操作。3郾 6阴性对照 negative control使用常见伪品药材代替送检样品同法 DNA 提取 、靶核酸扩增和产物检测过程。1T/CACM 01320163郾 7空白对照 blank control以水代替送检样品同法 DNA 提取 、靶核酸扩增和产物检测过程 , 用以证明提取过程中没有核酸污染。3郾 8对照样品 standard sample对照样
6、品包括对照药材和种子种苗对照样品 。种子种苗对照样品是由中药材种子种苗标准起草单 位提交 , 经全国中药材种子 ( 种苗) 标准化技术委员会认定并保存 , 与品种名称相符的种子种苗 样品。4 方案金银花快速 PCR 鉴定应采用抽取有代表性的送检样品与对照样品比较的验证方式 , 即依据金银 花特异性 DNA 位点差异 , 使用单核苷酸多态性标记法进行鉴定 。利用碱裂解法提取金银花模板 DNA , 以提取的 DNA 为模板进行 PCR 扩增 , 荧光检测或琼脂糖凝胶电泳检测 PCR 扩增产物。5 仪器设备所有制备样品使用的器具在使用前应灭菌处理。5郾 1PCR 仪使用前应进行温度校准。5郾 2 手
7、持式紫外灯可检测 365nm 紫外波长。5郾 3 连续可调微量移液枪吸头。至少应该包括 0郾 1 2郾 5滋L 、0郾 5 10郾 0滋L 、10 100滋L 、100 1000滋L 规格 , 并包括配套一次性5郾 4 保温设备至少应包含 4益 与 - 20益 温区。6 试剂和溶液配制除另有规定外 , 实验试剂为不含 DNA 和 DNase 的分析纯或生化试剂 ; 实验用水符合 GB/T 6682 的要求 ; 所配制的试剂均应灭菌后保存 , 并在容器上注明试剂名称 、浓度 、配制时间 、保存条件 、失 效日期和配制者姓名; PCR 试剂应小量分装保存以减少污染 ; 材料及试剂的保存都应有防污染
8、措施。 6郾 1 DNA 提取缓冲液醚 (Triton X 100 ) 溶液 : 在 800mL 去离子水中溶解 20郾 0g NaOH , 冷却至室温后加入 10g PVP 和10mL Triton X 100 , 溶解后加水定容至 1L , 分装后滤过除菌。6郾 2 中和缓冲液含有 0郾 5mol/L 氢氧化钠 ( NaOH) 、1% 聚乙烯吡咯烷酮 - 40 ( PVP - 40) 、1% 聚乙二醇辛基苯基溶解 12郾 1g 三羟甲基氨基甲烷 (Tris) , 冷却至室温后用浓盐酸调节溶液的 pH 值至 8郾 0 , 加水定容至含有 0郾 1mol/L 三羟甲基氨基甲烷盐酸 ( Tris
9、 - HCl) 溶液 , pH 值为 8郾 0 : 在 800mL 去离子水中1L , 分装后高压灭菌。6郾 3 dNTP 混合液含有等量 dATP 、dCTP 、dGTP 、dTTP , 使用时调整浓度至 10mmol/L。6郾 4 10 伊 PCR 缓冲液依据不同类型的 Taq 酶选择对应的 10 伊 PCR 缓冲液。6郾 5 20% PVP 溶液在 80mL 去离子水中溶解 20郾 0g PVP - 40 , 加水定容至 100mL , 分装后滤过除菌 , 冷却后 - 20益2T/CACM 0132016保存。6郾 6 10mg/ mL BSA6郾 7 中溶解 1郾 0g BSA , 加
10、水定容至 100mL , 分装后滤过除菌 , 冷却后 - 20益 保存。检测用 Taq DNA 聚合酶应无 3 爷 寅5 爷 核酸外切酶活性 , Taq DNA 聚合酶在 - 20益 下保存 , 使用 时置冰上操作。6郾 8 金银花检测用引物对序列JYH郾 R : 5 - TGGATGAGAAATATAACGAATTAG - 3 。用灭菌 ddH2 O 将上述引物溶解至 10滋mol/L。 6郾 9 50 伊 TAE 电泳缓冲液JYH郾 F : 5 - AGTCCCTCTATCCCCAAA - 3 爷 ; 爷在 800mL 去离子水中溶解 242g Tris , 37郾 2g 乙二胺四乙酸二钠
11、 Na2 EDTA 2H2 O , 加入 57郾 1ml 的醋酸 , 充分混匀 , 加去离子水定容至 1L , 室温保存 , 使用时用去离子水 50 倍稀释。 6郾 10 6 伊加样缓冲液在 80mL 去离子水中溶解溴酚蓝 250mg 、二甲苯青 250mg 、蔗糖 250mg , 加水定容至 100mL , 分装。7 检验程序为防止交叉污染 , 收样 、取样 、粉碎 、DNA 提取 、核酸扩增与产物检测应在不同操作间或在同 一操作间不同隔离区域进行 , 进入各区域应严格按照单一方向进行 , 即样品制备区寅核酸制备区寅扩增区寅检测区。7郾 1 取样送检样品应可分成 2 批 , 每批可分为同样的
12、 3 份 , 总量不低于 100g 。收样时应检查包装的完整 性 , 并在样品袋上贴上标签 , 填写采集数据表 。对商品包装和送样说明进行拍照记录 , 照片随样品一起备档。7郾 1郾 1 药材和饮片送检样品抽样方法参照 2015 年版 中华人民共和国药典 四部药材和饮片取样法 ( 通则 0211)进行取样 。去除药材和饮片表面附着物 , 依次使用 75% 乙醇和无菌双蒸水擦拭表面后晾干。 7郾 1郾 2 种子种苗送验样品 、试样的抽取 、分取应有代表性 。在生产基地取样 , 送验样品可以为组织或器官 ; 在加工或销售地点取样 , 送验样品为种子或种苗。7郾 2 粉碎取送检样品置乳钵 、匀浆机或
13、球磨粉碎仪中充分研磨粉碎 , 必要时加适量液氮研磨。 7郾 3 DNA 提取800滋L 中和缓冲液 , 充分混匀 ; 12000r/min 离心 1min 或静置 5min; 转移 500滋L 上清液至 一 新的称取经预处理的送检样品 20mg 置 2郾 0mL 离心管中 ; 加入 200滋L 提取缓冲液 , 充分混匀 ; 加入作为 DNA 模板待测或 - 20益 保存备用 。每个送检样品必须重复 2 次 , 每 1 次从送检样品提取核酸的 过程都必须设置 1 个提取空白对照。1郾 5mL 离心管 , 加入 500滋L 中和缓冲液 , 充分混匀 ; 12000r/min 离心 1min 或静置
14、 5min; 转移上清液注 : 使用碱裂解法提取的金银花 DNA 可在 4益 下保存 3 天或 - 20益 下保存 7 天 , 不宜长期保存。 7郾 4 PCR 扩增首次使用本方法时 , 应校对 PCR 仪温控准确性 , 并使用阳性对照和阴性对照以核对使用的 Taq 聚合酶的适用性。3T/CACM 01320167郾 4郾 1 对照试验PCR 检测应重复 2 次 , 并设置阳性对照 、阴性对照和空白对照。7郾 4郾 2 PCR 反应体系在 200滋L 的 PCR 管中进行 , 反应总体积为 25滋L , 反应体系包括 10 伊 PCR 缓冲液 2郾 5滋L 、dNTP0 。分滋L 、Taq D
15、NA 聚 合 酶 1滋L 、模 板 DNA将 PCR 管置 PCR 仪内进行 PCR 反应 。反应程序为 : 94益 预变性 1min; 94益 变性 10s , 62益 退火延伸 10s , 35 个循环 。对扩增产物进行检测或置 4益 下保存。7郾 5 扩增产物检测7郾 5郾 1 荧光染料显色检测PCR 反应结束后在 PCR 反应体系内加入 2滋L 100 伊 SYBR Green 玉染料 , 混匀后于 365nm 紫外波长下检测荧光 , 若 PCR 产物出现与阳性对照相同的荧光即为阳性结果 , 反之为阴性结果。 7郾 5郾 2 琼脂糖凝胶电泳检测取 PCR 扩增产物 , 加入 6 伊上样
16、缓冲液混匀 , 2% 琼脂糖凝胶电泳染色 , 紫外波长下检测 。阴性 对照和空白对照无条带 , 且送检样品与阳性对照在 100 200bp 有一条 DNA 条带为阳性结果 , 否则为 阴性结果。8 结果判定在阴性对照 、阳性对照和空白对照结果符合规定的情况下 , 若送检样品与阳性对照一致 , 则判定 测试结果为阳性 , 否则为阴性。9 结果报告9郾 1 一般要求定性检测结果应表示为阳性“ + 冶 或阴性“ - 冶 。9郾 2 鉴定报告样品经检测后 , 实验室应根据实验的具体操作程序和结果做好详细的实验记录 , 出具检测报告。 检测报告至少包含以下内容 :送检样品的名称 、状态和明确的标识 ;检
17、测依据 ;取样方法与日期 ;储存条件 ;检测开始和结束日期 ;检测负责人和实验人员 ;阳性对照 、阴性对照 、送检样品 ;特定方法取得的结果 , 结果使用的单位及计算方法 ;检测结论 ;检测过程观察到的特别情况 ;其他需要报告的内容。10 质量保证检测结果应来自同一实验室样品的两份送检样品 。当一份送检样品的结果为阳性 , 另一份为阴性 时 , 要重新测试 。可以适当增加核酸扩增反应体系中 DNA 模板量 , 使两份样品得到相同结果 。每个 样品应至少制备两份 DNA , 必要时需检测模板 DNA 的质量 , 确保提取的 DNA 片段大于扩增片段 。核 酸扩增可设置 PCR 抑制剂对照 。如果
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