生物化学酶化学省公共课一等奖全国赛课获奖课件.pptx
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1、第三章 酶化学Enzymology第1页研究历史n1.1833年佩延(Payen)和Persoz从麦芽中抽提出一个对热敏感物质,这种物质能将淀粉水解成可溶性糖,被称为淀粉糖化酶(diastase)n2.巴斯德提出“酵素”一词,认为只有活酵母细胞才能进行发酵。现在日本还经常使用“酵素”一词(ferment)。第2页n3.1878年德国人库恩(Kuhne)提出“Enzyme”一词,意为“在酵母中”。n4.1896年德国人巴克纳(Buchner)弟兄用石英砂磨碎酵母细胞,得到了能催化发酵无细胞滤液,证实发酵是一个化学反应,与细胞活力无关。第3页n5.19米凯利斯(Michaelis)和门顿(Ment
2、en)利用物理化学方法提出了酶促反应动力学原理米氏学说,使酶学能够定量研究。n6.1926年美国人J.B.Sumner从刀豆中结晶出脲酶(第一个酶结晶),并提出酶是蛋白质观点。以后陆续得到各种酶结晶,证实了这种观点,萨姆纳因而取得1947年诺贝尔奖。第4页7.进入80年代后,核糖酶(ribozyme)、抗体酶、模拟酶等相继出现,酶传统概念受到挑战。1982年Cech等发觉四膜虫26S rRNA前体含有自我剪接功效,并于1986年证实其内含子L-19 IVS含有各种催化功效。今后陆续发觉各种含有催化功效RNA,底物也扩大到DNA、糖类、氨基酸酯。第5页第一节第一节 通论(通论(General I
3、ntroduction)一一 酶是生物催化剂酶是生物催化剂1 酶概念:酶是活细胞产生含有催化作用蛋白质。它含有高酶概念:酶是活细胞产生含有催化作用蛋白质。它含有高度专一性、高效催化性、活性可调性和代谢性等催化特点。度专一性、高效催化性、活性可调性和代谢性等催化特点。2 酶概念提出及当前内涵问题(酶概念提出及当前内涵问题(Enzyme/Ribozyme)1982年,年,Cech首先发觉首先发觉RNA也含有酶催化活性,并提出也含有酶催化活性,并提出核酶(核酶(ribozyme)概念。)概念。1995年年Cuenoud等发觉等发觉DNA也有酶活性。也有酶活性。3 酶是蛋白质证据(酶化学本质)酶是蛋白
4、质证据(酶化学本质)遇热、两性、变性、胶体性质、蛋白酶降解、测序、合成遇热、两性、变性、胶体性质、蛋白酶降解、测序、合成第6页二二 酶催化特征酶催化特征1 1 与普通催化剂相同点与普通催化剂相同点 反应前后不变;热力学上允许反应;缩短抵达平衡点时间反应前后不变;热力学上允许反应;缩短抵达平衡点时间;降低分子活化能。降低分子活化能。2 2 催化特征(与普通催化剂相同点)催化特征(与普通催化剂相同点)高效催化性高效催化性(10(108 8-10-101212/10/103 3);高度专一性;活性可调性;高度专一性;活性可调性;代谢性;对环境非常敏感。代谢性;对环境非常敏感。3 3专一性特点专一性特
5、点 专一性:对底物选择性要求。专一性:对底物选择性要求。类型类型 结构专一(键专一、基团专一、底物专一)结构专一(键专一、基团专一、底物专一)立体异构专一(几何异构;旋光异构)立体异构专一(几何异构;旋光异构)第7页催化剂催化剂每摩尔需活化能每摩尔需活化能无无18 000J18 000J胶态钯胶态钯11 700J11 700J过氧化氢酶过氧化氢酶2 000J2 000J过氧化氢分解反应所需活化能过氧化氢分解反应所需活化能第8页锁钥学说(Lock and key model)Fisher 首次提出首次提出(1894,德国)德国)第9页三点附着学说(Three point attachment t
6、heory)A.Ogster首次提出首次提出第10页 酶与底物结合诱导契合学说示意图酶与底物结合诱导契合学说示意图诱导契合学说诱导契合学说(Induced fit theory)Koshland 首次提出(首次提出(1958)第11页第二节第二节 酶分类和命名酶分类和命名一一 酶命名酶命名-ase-aseECEC:Enzyme commissionEnzyme commission1 1 习惯名(习惯名(Recommended nameRecommended name)19611961年以前年以前 底物(淀粉酶);催化性质(脱氢酶);起源(胃蛋白酶)底物(淀粉酶);催化性质(脱氢酶);起源(胃
7、蛋白酶)2 2 系统名(系统名(Systematic nameSystematic name)底物:底物底物:底物 性质性质 酶酶 例子:谷丙转氨酶例子:谷丙转氨酶=L-=L-丙氨酸:丙氨酸:-同戊二酸氨基转移酶同戊二酸氨基转移酶 蛋白(:水)水解酶蛋白(:水)水解酶3 3 编号编号乳酸脱氢酶;乳酸:乳酸脱氢酶;乳酸:NADNAD+脱氢酶脱氢酶;EC;EC:1.1.1.271.1.1.27第12页二二 酶国际系统分类法酶国际系统分类法1 标准标准 大类大类-亚类亚类-亚亚类亚亚类-序号序号 第13页分类按反应类型(1)氧化还原酶(2)转移酶(3)水解酶(4)裂合酶(5)异构酶(6)合成酶按酶结
8、构按酶组成单体酶寡聚酶多酶体系多酶融合(复合)体单纯酶结合酶第14页1.氧化还原酶催化氧化还原反应,量最大一类酶,具氧化、产能、解毒功效。通式:通式:AHAH2 2+BBH+BBH2 2+A+A系统命名可分为19亚类,习惯上可分为4个亚类:(1)脱氢酶:受体为NAD或NADP,不需氧。(2)氧化酶:以分子氧为受体,产物可为水或H2O2,常需黄素辅基。(3)过氧化物酶:以H2O2为受体,常以黄素、血红素为辅基。(4)氧合酶(加氧酶):催化氧原子掺入有机分子,又称羟化酶。按掺入氧原子个数可分为单加氧酶和双加氧酶。第15页2.移换酶类 催化功效基团转移反应,也叫转移酶 通式:通式:AR+BBR+AA
9、R+BBR+A 按转移基团性质,可分为8个亚类,较主要有:(1)一碳基转移酶:转移一碳单位,与核酸、蛋白质甲基化相关(2)磷酸基转移酶:常称为激酶,多以ATP为供体。少数蛋白酶也称为激酶(如肠激酶)(3)糖苷转移酶:与多糖代谢亲密相关,如糖原磷酸化酶。(4)氨基转移酶:转移氨基,如AST ALT第16页3、水解酶类 催化底物水解反应,如蛋白酶、脂肪酶等。通式:通式:AB+HAB+H2 2OAH+BOHOAH+BOH 起降解作用,多位于胞外或溶酶体中。有些蛋白酶也称为激酶。可分为水解酯键、糖苷键、肽键、碳氮键等11亚类。第17页n4、裂合酶类n 催化从底物上移去一个小分子而留下双键双键反应或其逆
10、反应。通式:通式:ABA+B ABA+Bn包含醛缩酶、水化酶、脱羧酶等。共7个亚类。第18页n5、异构酶类n 催化同分异构体之间相互转化。通式:通式:ABAB 其中:其中:A A、B B为同分异构为同分异构n包含消旋酶、异构酶、变位酶等。共6个亚类。第19页6、合成酶类 催化由两种物质合成一个物质,必须与ATP分解相偶联。也叫连接酶,如DNA连接酶。通式:通式:A+B+ATPAB+ADP+Pi A+B+ATPAB+ADP+Pi 或或 A+BAB+AMP+PPi A+BAB+AMP+PPi共5个亚类。第20页第21页第22页第23页第24页归纳归纳:氧:氧 转转 水水 裂裂 异异 合合第25页(
11、二)按酶结构分类1.单体酶 由一条肽链组成酶称为单体酶2.寡聚酶:由多条肽链以非共价键结合而成酶3.多酶体系:一些功效相关酶组织在一起,形成一个酶系4.多酶融合(复合)体:一条肽链上有各种酶活性,称为多酶复合体第26页(三)按化学组成单纯酶及结合酶单纯酶:完全由蛋白质(氨基酸)组成,无辅助因子。属简单蛋白质,如水解酶第27页结合酶结合酶:属结合蛋白,除蛋白质外,还有非蛋白部分辅助因子:金属离子或有机小分子酶蛋白决定酶专一性;辅助因子决定催化反应性质和基团电子等传递第28页辅助因子分类辅助因子分类(按其(按其与酶蛋白结合紧密程度与酶蛋白结合紧密程度)辅酶辅酶(coenzyme):与酶蛋白结合与酶
12、蛋白结合疏松,可用疏松,可用透析或超滤方透析或超滤方法除去。法除去。辅基辅基(prosthetic group):与酶蛋白结合与酶蛋白结合紧密,不能用紧密,不能用透析或超透析或超滤方法除去滤方法除去。第29页第三节第三节 酶催化作用结构基础酶催化作用结构基础一一 酶分子结构特征酶分子结构特征1 酶活性部位酶活性部位 活性部位(中心):活性部位(中心):与底物结合并与酶催化作用直接相与底物结合并与酶催化作用直接相 关部位称为酶活性部位(中心)。关部位称为酶活性部位(中心)。必需基团:必需基团:利用化学修饰将其改变能破坏酶活性相关基利用化学修饰将其改变能破坏酶活性相关基 团称为必需基团团称为必需基
13、团第30页酶分子结构特征酶分子结构特征酶蛋白酶蛋白非必需基团非必需基团必需基团必需基团活性中心活性中心活性中心活性中心以外基团以外基团结合基团结合基团催化基团催化基团第31页酶活性中心示意图第32页酶活性中心酶活性中心酶活性中心酶活性中心第33页 活性中心氨基酸按功效可分为:结合部位结合部位:负责识别特定底物并与之结合。它们决定了酶底物专一性。第34页催化部位催化部位:起催化作用,底物敏感键在此被切断或形成新键,并生成产物。第35页AspHisSer胰胰凝凝乳乳蛋蛋白白酶酶活活性性中中心心活性中心主要基团活性中心主要基团:His57,Asp102,Ser195第36页3 活性中心研究方法1.酶
14、分子侧链基团修饰法(1)非共价特异修饰法:(2)特异性共价修饰法(3)亲和标识法第37页2.动力学参数测定方法3.X射线晶体结构分析法4.定点诱变法第38页二二 酶原及酶原激活酶原及酶原激活没有催化活性酶前体称为酶原(没有催化活性酶前体称为酶原(zymogen)。)。由酶原转变成含有催化作用酶过程称为酶原激活(由酶原转变成含有催化作用酶过程称为酶原激活(activation)。)。这是一个化学改变过程,实质是形成活性中心过程。这是一个化学改变过程,实质是形成活性中心过程。第39页第四节第四节 酶催化作用机理酶催化作用机理一一 酶催化作用机理酶催化作用机理 降低分子活化能。降低分子活化能。有效碰
15、撞有效碰撞-活化分子活化分子-活化能活化能 中间产物学说中间产物学说中间产物中间产物-过渡态过渡态 E+S=ES=EP P+S过渡态过渡态第40页n 中间产物学说及活化能n19Henri Wurtz提出第41页第42页怎样降低活化能?高效催化原因怎样降低活化能?高效催化原因邻近定位效应邻近定位效应张力与形变张力与形变普通酸碱催化普通酸碱催化共价催化共价催化金属离子催化金属离子催化第43页底物与酶邻近效应及定向效应邻近效应:指酶与底物形成中间复合物(ES)后,使催化基团与底物结合成同一个分子而使有效浓度得到极大提升。定向效应:指酶催化基团与底物反应基团之间正确取位所产生效应第44页n包含n反应基
16、团之间、酶催化基团和底物反应基n团之间。活性中心内定向使反应变成份子n内反应第45页底物形变及诱导契合第46页第47页酸碱催化狭义:H+OH-参加催化广义:H+OH-供体或受体参加催化机制在机体内,多数处于中性条件,所以狭义酸碱催化所以占百分比很小,多数是弱酸弱碱参加反应第48页第49页第50页共价催化:又称亲核催化或亲电子催化亲核试剂或亲电子试剂能分别释放电子或汲取电子并作用于底物缺电子中心或负电中心,快速形成不稳定共价中间复合物 常见亲核基团有:Ser-OHCys-OH His-OH经典亲电子中心有:磷酰基、酰基、糖基第51页第52页金属离子催化金属离子催化提升水亲核性能提升水亲核性能第5
17、3页五五 几个酶结构事例(略)几个酶结构事例(略)第54页第五节 酶促反应动力学有哪些原因影响酶促反应呢?有哪些原因影响酶促反应呢?酶浓度、底物浓度、温度、酶浓度、底物浓度、温度、pH、激活剂、抑制剂、激活剂、抑制剂一一 酶浓度影响酶浓度影响 底物浓度足够情况下:底物浓度足够情况下:v=kEV=kEt第55页二二 底物浓度对反应速度影响底物浓度对反应速度影响 (一)酶催化单底物反应(多底物非常复杂)(一)酶催化单底物反应(多底物非常复杂)第56页当底物浓度较低时当底物浓度较低时反应速度与底物浓度成正比;反应为一级反应。反应速度与底物浓度成正比;反应为一级反应。SSV VVmaxVmax第57页
18、当底物浓度高达一定程度当底物浓度高达一定程度反应速度不再增加,达最大速度;反应为反应速度不再增加,达最大速度;反应为零级反应。零级反应。SSV VVmaxVmax第58页伴随底物浓度增高伴随底物浓度增高反应速度不再成正百分比加速;反应为反应速度不再成正百分比加速;反应为混合级反应。混合级反应。SSV VVmaxVmax第59页 S 初速度 v0VmaxKm1/2Vmax_ 图5-14 底物浓度对酶促反应速度影响bca在酶促反应起始时阶段反应速率快速增高呈这种反应速率与底物浓度呈正比反应为一级反应(a段)。直线上升,第60页当反应体系中酶分子大部分与底物结合时,反应速率增高则渐渐变缓,即反应第二
19、阶段为混合级反应(b段)。S 初速度 v0VmaxKm1/2Vmax_ 图5-14 底物浓度对酶促反应速度影响bca第61页底物浓度继续增加,全部酶分子均被底物饱和,反应速率不再增加,此时反应速率与底物浓度增加无关,反应为零级反应(c),曲线出现平坦。S 初速度 v0VmaxKm1/2Vmax_ 图5-14 底物浓度对酶促反应速度影响bca第62页酶促反应速度V与底物浓度S关系第63页(二)(二)Michaelis-Menten方程和米氏常数方程和米氏常数 第64页米氏方程式推导起源于中间产物学说米氏方程式推导起源于中间产物学说 解释酶促反应中底物浓度和反应速率关系最合理学说解释酶促反应中底物
20、浓度和反应速率关系最合理学说是中间产物学说。该学说认为酶促反应形成酶底物是中间产物学说。该学说认为酶促反应形成酶底物复合物(复合物(ES),即中间产物,然后此复合物再分解为),即中间产物,然后此复合物再分解为产物和游离酶。产物和游离酶。E +SESE +Pk1k2k3酶底物中间产物产物酶第65页 米氏方程式(米氏方程式(Michaelis equation):):Vmax 为最大反应速率(为最大反应速率(maximum velocity)S为底物浓度为底物浓度 Km 为米氏常数(为米氏常数(Michaelis constant)V 为不一样为不一样S时反应速率时反应速率 VmaxSKm+SV=
21、第66页 米氏方程式推导以两个假设为前提:米氏方程式推导以两个假设为前提:稳态观念,当酶促反应趋于稳态时稳态观念,当酶促反应趋于稳态时ES生生成速率与分解速率相等。成速率与分解速率相等。酶促反应中酶促反应中S大大高于大大高于E,所以,所以S改改变在反应过程可忽略不计。变在反应过程可忽略不计。第67页(三)(三)Km和和Vmax意义意义1.当当反反应应速速率率为为最最大大速速率率二二分分之之一一时时,米米氏方程为:氏方程为:Km=S这表示这表示Km值等于酶促反应速率为最大速率值等于酶促反应速率为最大速率二分之一时底物浓度。二分之一时底物浓度。第68页2.一一些些酶酶K2K3,即即ES解解离离成成
22、E和和S速速率率显显著著超超出出分分解解成成E和和P速速率率,K3可可忽忽略略不不计计,即即此此时时m近近似似ES解解离离常常数数Ks。在在这种情况下这种情况下Km可表示酶和和底物亲和力。可表示酶和和底物亲和力。第69页3.Km值是酶特征性常数,它与酶结构,酶值是酶特征性常数,它与酶结构,酶所催化底物和反应环境如温度、所催化底物和反应环境如温度、pH、离、离子强度等相关,而与酶浓度、底物浓度子强度等相关,而与酶浓度、底物浓度无关。无关。实际意义:实际意义:判断最适底物;推测天然底物;推断正逆向催化反应效率。判断最适底物;推测天然底物;推断正逆向催化反应效率。第70页(四)四)Km和和Vmax测
23、测 定定 Lineweaver和和Burk将将米米氏氏方方程程作作双双倒倒数数变变换换处处理理,将将矩矩形形双双曲曲线线变变成成直直线线作作图图,便便可可较较轻轻易易地地用用该该直直线线求得求得Vmax和和Km。第71页2 双底物酶促反应动力学次序机制次序机制 有序次序机制有序次序机制 随机次序机制随机次序机制乒乓机制乒乓机制第72页三 温度对酶促反应影响 酶促反应速率最大时环境温度称为酶促反应最适温度酶促反应速率最大时环境温度称为酶促反应最适温度(optimum temperature)。)。温度对酶促反应速率影响 第73页四四 pH对酶促反应速率影响对酶促反应速率影响 酶催化活性最大时环境
24、酶催化活性最大时环境pH称为酶促反应最适称为酶促反应最适pH(optimum pH)。各种酶最适各种酶最适pH不一样。不一样。n动动物物体体内内酶酶最最适适pH在在6.58之之间间,少少数数酶酶也也有有例例外外,如如胃胃蛋蛋白白酶酶最最适适pH为为1.8,精精氨氨酸酸酶酶最最适适pH为为9.8。n植物为植物为4.56.5。最最适适pH不不是是酶酶特特征征性性常常数数,它它受受底底物物浓浓度度,缓冲液浓度和种类及酶纯度等影响。缓冲液浓度和种类及酶纯度等影响。第74页 pH对酶促反应速率影响对酶促反应速率影响经典经典非经典非经典第75页 温度对酶促反应速率影响温度对酶促反应速率影响 pH对酶促反应
25、速率影响对酶促反应速率影响经典经典第76页五五 激活剂影响激活剂影响 凡是能提升酶活性加速酶促反应物质都称为激活剂凡是能提升酶活性加速酶促反应物质都称为激活剂(activator)。)。1 无机离子无机离子 金属离子:金属离子:K+Na+Ca2+Mg2+Zn2+Fe2+阴离子:阴离子:Br-Cl-I-CN-PO34-2 小分子有机化合物小分子有机化合物 还原剂(抗坏血酸、还原剂(抗坏血酸、GSH等)、等)、EDTA3 生物大分子生物大分子 蛋白激酶系统;霍乱毒素激活腺苷酸环化酶蛋白激酶系统;霍乱毒素激活腺苷酸环化酶激活剂作用含有选择性。激活剂作用含有选择性。第77页六六 抑制剂影响抑制剂影响
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