酶化学省公共课一等奖全国赛课获奖课件.pptx
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1、第二章 酶化学学习要求学习要求:1、明确酶定义、特征及组成(尤其是辅、明确酶定义、特征及组成(尤其是辅因子)。因子)。2、掌握酶活性中心、诱导契合学说、中、掌握酶活性中心、诱导契合学说、中间产物学说、降低活化能等概念。间产物学说、降低活化能等概念。3、掌握影响酶活力六个原因,了解、掌握影响酶活力六个原因,了解Km值含义及意义以及酶抑制作用分类。值含义及意义以及酶抑制作用分类。4、了解酶命名、分类及别构酶、同工酶、了解酶命名、分类及别构酶、同工酶概念。概念。第1页第一节第一节 酶概念及特点酶概念及特点第二节第二节 酶命名与分类酶命名与分类第三节第三节 酶作用机理酶作用机理第四节第四节 影响酶促反
2、应速度原因影响酶促反应速度原因第五节几个主要调整酶第五节几个主要调整酶第三章 酶化学第2页第一节第一节 酶概念及特点酶概念及特点一、酶定义:一、酶定义:由生物体活细胞产生,在细胞内外都有由生物体活细胞产生,在细胞内外都有催化活性而且有高度专一性蛋白质。催化活性而且有高度专一性蛋白质。酶化学本质:多数酶是蛋白质酶化学本质:多数酶是蛋白质,核酶是核酸。核酶是核酸。第3页酶促反应酶促反应:酶催化生物化学反应。:酶催化生物化学反应。底物(底物(S):在酶催化下,发生化学改变:在酶催化下,发生化学改变 物质。物质。产物(产物(P):反应后生成物质。反应后生成物质。第4页二、酶催化特点二、酶催化特点uu与
3、普通催化剂相同点与普通催化剂相同点uu用量少用量少uu反应前后不变反应前后不变uu降低降低活化能活化能uu缩短时间缩短时间活化能:在一定温度下活化能:在一定温度下1mol底物全部进入底物全部进入活化态所需要自由能,单位为活化态所需要自由能,单位为kJ/mol.第5页催化催化非催化非催化第6页l 酶催化特点酶催化特点 P82 1.高效性高效性2.专一性专一性4.可调控性可调控性3.反应条件温和(易变性)反应条件温和(易变性)5.需要辅助因子需要辅助因子第7页酶与普通催化剂催化效率比较酶与普通催化剂催化效率比较底物底物 催化剂催化剂 反应温度反应温度 反应速度常数反应速度常数尿素尿素 H+62 7
4、.4 10-7 脲酶脲酶 21 5.0 106过氧化氢过氧化氢 Fe 2+22 56 过氧化氢酶过氧化氢酶 22 3.5 107 与普通催化剂相比提升与普通催化剂相比提升1071013第8页 绝对专一性绝对专一性绝对专一性绝对专一性结构专一性结构专一性结构专一性结构专一性 键专一性键专一性键专一性键专一性 相对专一性相对专一性相对专一性相对专一性 基团专一基团专一基团专一基团专一性性性性 光学专一性光学专一性光学专一性光学专一性立体异构专一性立体异构专一性立体异构专一性立体异构专一性 几何专一性几何专一性几何专一性几何专一性2.专一性专一性指酶对底物及其催化反应有严格选择性指酶对底物及其催化反
5、应有严格选择性第9页三、三、酶化学组成酶化学组成酶蛋白酶蛋白 蛋白质部分蛋白质部分+非蛋白质部分非蛋白质部分+辅助因子辅助因子=全酶(有活性)全酶(有活性)结合酶结合酶单纯酶单纯酶 酶酶qq酶蛋白酶蛋白-决定反应专一性决定反应专一性qq辅助因子辅助因子-决定反应类型决定反应类型依据化学组成,依据化学组成,酶可分为酶可分为酶蛋白酶蛋白 结合酶结合酶单纯酶单纯酶酶蛋白酶蛋白 结合酶结合酶单纯酶单纯酶 结合酶结合酶简单蛋白酶简单蛋白酶第10页uu单体酶:一个活性中心,一条肽链组成;单体酶:一个活性中心,一条肽链组成;uu寡聚酶:由两个或多个相同或不相同亚寡聚酶:由两个或多个相同或不相同亚 基组成;基
6、组成;uu多酶复合体:各种酶相互多酶复合体:各种酶相互嵌合,催化连续反应体系。嵌合,催化连续反应体系。酶2酶3酶1酶4酶6酶5(一)、依据酶蛋白特点和分子大小分类:(一)、依据酶蛋白特点和分子大小分类:第11页依据辅助因子与酶蛋白结合牢靠程度来分:辅酶:非共价键辅酶:非共价键 疏松疏松 可去可去除除辅基:共价键辅基:共价键 紧密紧密 不可去不可去除除辅助因子辅助因子小分子有机化合物(二)辅助因子(二)辅助因子金属离子金属离子第12页第二节第二节 酶分类与命名酶分类与命名一、一、酶命名酶命名二、二、酶分类酶分类三、三、酶标码酶标码第13页一、一、酶命名:酶命名:习惯命名;系统命名习惯命名;系统命
7、名第二节第二节 酶分类与命名酶分类与命名习惯命名:习惯命名:1、以底物命名:如脂酶、淀粉酶、以底物命名:如脂酶、淀粉酶2、以作用性质命名:如水解酶、氧化酶、以作用性质命名:如水解酶、氧化酶1、2混合命名:如多酚氧化酶、苯丙氨酸转氨酶混合命名:如多酚氧化酶、苯丙氨酸转氨酶有时附加起源命名:如木瓜蛋白酶有时附加起源命名:如木瓜蛋白酶第14页2 2、系统命名、系统命名标准标准 底物底物1 1:底物:底物2 2 反应性质反应性质 酶酶乳酸乳酸 +NAD+丙酮酸丙酮酸 +NADH+H+命名命名 乳酸:乳酸:NAD+氧化还原酶氧化还原酶 乳酸脱氢酶乳酸脱氢酶第15页二、酶分类二、酶分类按酶所催化反应类型,
8、可分为:按酶所催化反应类型,可分为:1 氧化还原酶类氧化还原酶类2 转移酶类转移酶类3 水解酶类水解酶类4 裂合酶类裂合酶类5 异构酶类异构酶类6 连接酶类连接酶类 第16页三、三、酶标码:以上为大类,大类下为亚酶标码:以上为大类,大类下为亚类,亚类下有亚亚类,最终是编号。所类,亚类下有亚亚类,最终是编号。所以,以,每一个酶标码都包含每一个酶标码都包含4个数字个数字。在其。在其前冠以前冠以EC。如乳酸脱氢酶(。如乳酸脱氢酶(EC 1.1.1.27)。)。每一个酶有一个编号每一个酶有一个编号,如乙醇脱氢酶如乙醇脱氢酶 EC 1.1.1.27 大类大类 亚类亚类 亚亚类亚亚类 序号序号第17页表表
9、示示乳乳酸酸脱脱氢氢酶酶在在此此亚亚亚亚类类中中次次序序号号EC 1.1.1.27 酶学委员会酶学委员会 表示表示第一大类第一大类,即氧化还原酶,即氧化还原酶。表示表示第一亚类第一亚类,被氧化基团为,被氧化基团为CHOH表示表示第一亚亚类第一亚亚类,氢受体为,氢受体为NAD+乳酸脱氢酶系统分类编号乳酸脱氢酶系统分类编号第18页第三节第三节 酶作用机理酶作用机理一、酶活性中心一、酶活性中心二、酶与底物分子结合二、酶与底物分子结合三、影响酶催化效率原因三、影响酶催化效率原因四、酶催化机理四、酶催化机理第19页酶结构酶结构必需基团必需基团其它部分其它部分活性中心活性中心活性中心以外必需基团活性中心以
10、外必需基团催化部位催化部位结合部位结合部位与酶活性相关基团,如用化学方法改变它,则酶失去活性,这些基团称为必需基团酶分子中直接与底物结合并催化底物发生化学酶分子中直接与底物结合并催化底物发生化学反应区域反应区域称为酶活性中心或活性部位称为酶活性中心或活性部位专一性专一性反应类型反应类型一、酶活性中心一、酶活性中心第20页1.活性中心在酶分子中只占相当小部分活性中心在酶分子中只占相当小部分2.酶活性中心含有三维空间结构酶活性中心含有三维空间结构3.组成活性中心氨基酸残基侧链在一级结构组成活性中心氨基酸残基侧链在一级结构上可能相距很远或位于不一样肽链,但因肽上可能相距很远或位于不一样肽链,但因肽链
11、盘绕折叠,共聚在一起。链盘绕折叠,共聚在一起。4.酶活性中心与底物形状不是恰好互补酶活性中心与底物形状不是恰好互补活性中心特点:活性中心特点:第21页活性中心特点:活性中心特点:5.酶分子表面一个裂缝(凹穴)。酶分子表面一个裂缝(凹穴)。6.底物经过次级键与酶分子结合(氢键、离底物经过次级键与酶分子结合(氢键、离子键、范德华力、疏水相互作用)子键、范德华力、疏水相互作用)7.酶活性中心含有柔性或可运动性。酶活性中心含有柔性或可运动性。8.活性中心出现频率最高功效活性中心出现频率最高功效氨基酸残基侧氨基酸残基侧链基团是:链基团是:His咪唑基,咪唑基,SerOH基基,CysSH基,基,Asp和和
12、GluCOOH基。基。第22页二、酶与底物分子结合二、酶与底物分子结合酶专一性与锁钥学说及诱导契酶专一性与锁钥学说及诱导契合学说合学说酶高效性与中间产物学说酶高效性与中间产物学说第23页结构专一性结构专一性绝对专一性绝对专一性相对专一性相对专一性键专一性键专一性基团专一性基团专一性立体异构专一性立体异构专一性旋光异构专一性旋光异构专一性几何异构专一性几何异构专一性二、酶与底物分子结合二、酶与底物分子结合酶专一性酶专一性第24页锁钥学说(刚性)锁钥学说(刚性)诱导契合学说(柔性)诱导契合学说(柔性)二、酶与底物分子结合二、酶与底物分子结合酶专一性假说:酶专一性假说:第25页(1 1)锁钥学说:)
13、锁钥学说:uu认为整个酶分子天然构象是含有刚性结认为整个酶分子天然构象是含有刚性结构,酶表面含有特定形状。酶与底物结构,酶表面含有特定形状。酶与底物结合如同一把钥匙对一把锁一样合如同一把钥匙对一把锁一样第26页(2 2)诱导契合学说)诱导契合学说uu该学说认为酶表面并没有一个与底物互补该学说认为酶表面并没有一个与底物互补固定形状,而只是因为底物诱导才形成了固定形状,而只是因为底物诱导才形成了互补形状互补形状.第27页一、酶催化作用与分子活化能:一、酶催化作用与分子活化能:2、酶促反应、酶促反应降低活化能降低活化能酶高效性与中间产物学说酶高效性与中间产物学说活化分子:含有超出能阀能量,活化分子:
14、含有超出能阀能量,能在分子碰撞中发生化学反应能在分子碰撞中发生化学反应分子分子1 1、活化能:、活化能:分子由常态转变分子由常态转变成活化态所需能量成活化态所需能量第28页uu酶催化作用本质是酶活性中心与底物分酶催化作用本质是酶活性中心与底物分子经过短程非共价力子经过短程非共价力(如氢键如氢键,离子键和离子键和疏水键等疏水键等)作用,形成作用,形成E-SE-S反应中间物。反应中间物。uu其结果使底物价键状态发生形变或极化,其结果使底物价键状态发生形变或极化,起到激活底物分子和降低过渡态活化能起到激活底物分子和降低过渡态活化能作用。作用。酶高效性与中间产物学说酶高效性与中间产物学说第29页E+S
15、P+EES能能量量水水平平反应过程反应过程 G E1 E2酶(酶(E E)与底物(与底物(S S)结合结合生成不稳定中间物(生成不稳定中间物(ESES),),再分解成产物(再分解成产物(P P)并释并释放出酶,使反应沿一个低放出酶,使反应沿一个低活化能路径进行,降低反活化能路径进行,降低反应所需活化能,所以能加应所需活化能,所以能加紧反应速度紧反应速度二、中间产物学说:19提出,(见P92)E+SESE+P第30页第五节第五节 酶作用机理酶作用机理二、中间产物学说二、中间产物学说:在此基础上又提出过:在此基础上又提出过渡态学说。渡态学说。E +S ES ES*EP E +S ES ES*EP
16、P +EP +E(酶酶酶酶 )(底物)底物)底物)底物)(酶(酶(酶(酶-底物中间物底物中间物底物中间物底物中间物)(过渡态(过渡态(过渡态(过渡态 )(酶酶酶酶-产物中间物)产物中间物)产物中间物)产物中间物)(产物(产物(产物(产物 )1、E与与S首先形成中间复合物(首先形成中间复合物(ES)2、E中功效基团正确定位使中功效基团正确定位使S分子敏感键在活化能低情分子敏感键在活化能低情况下发生反应,使况下发生反应,使S分子发生形变,形成活化底物分子发生形变,形成活化底物(S*)-酶复合物(过渡态酶复合物(过渡态ES*)第31页3 3、ESES*中中S S*旧键断裂、新键形成而转化为旧键断裂、
17、新键形成而转化为EPEP。4 4、EPEP最终最终分解释放出分解释放出E E和和P P。第五节第五节 酶作用机理酶作用机理酶中间产物学说,将酶中间产物学说,将1步需能较高反应变为步需能较高反应变为4步走,步走,降低反应活化能降低反应活化能,大大加紧了反应速度。大大加紧了反应速度。中间产物学说因观察到中间产物学说因观察到ES存在而得到支持存在而得到支持第32页uu 在酶促反应中,底物分子结合到酶活性中心,一方面底物在酶活性中心有效浓度大大增加,有利于提高反应速度;uu其次,由于活性中心立体结构和相关基团诱导和定向作用,使底物分子中参与反应基团相互接近,并被严格定向定位,使酶促反应具有高效率和专一
18、性特点。1、邻近与定向效应:、邻近与定向效应:研究表明,在生理条件下,溶液中底物浓研究表明,在生理条件下,溶液中底物浓度普通很低(度普通很低(0.001mol/L),),而在活性而在活性中心测得底物浓度可达中心测得底物浓度可达100mol/L。高出高出10万倍。万倍。底物浓度越高反应速度越快。底物浓度越高反应速度越快。三、影响酶催化效率原因三、影响酶催化效率原因第33页三、影响酶催化效率原因三、影响酶催化效率原因1.1.定向效应定向效应2 2、底物分子形变与诱导契合、底物分子形变与诱导契合3 3、酸碱催化、酸碱催化4 4、共价催化、共价催化5 5、微环境影响、微环境影响6 6、金属离子催化、金
19、属离子催化7 7、协同催化、协同催化第34页小结:小结:在酶分子活性中心,因为酶与底物邻在酶分子活性中心,因为酶与底物邻近、定向,底物诱导酶构象改变,二者契近、定向,底物诱导酶构象改变,二者契合成中间产物(合成中间产物(ES),),随之底物变形,形随之底物变形,形成成过渡态(过渡态(ESES*)并经过亲核、亲电催化,并经过亲核、亲电催化,酸、碱催化等方式进行多元催化,酸、碱催化等方式进行多元催化,进而转进而转化为化为酶酶-产物中间物(产物中间物(EPEP)最终释放出产最终释放出产物和酶。上述每一步反应所需活化能都很物和酶。上述每一步反应所需活化能都很低,所以,酶促反应能快速进行。低,所以,酶促
20、反应能快速进行。第四节第四节 酶作用机理酶作用机理第35页一、底物浓度对酶促反应速度影响一、底物浓度对酶促反应速度影响二、酶浓度对酶促反应速度影响二、酶浓度对酶促反应速度影响三、温度对酶促反应速度影响三、温度对酶促反应速度影响四、四、pH对酶促反应速度影响对酶促反应速度影响五、激活剂对酶促反应速度影响五、激活剂对酶促反应速度影响六、抑制剂对酶促反应速度影响六、抑制剂对酶促反应速度影响第四节第四节 影响酶促反应速度原因影响酶促反应速度原因第36页一、底物浓度(一、底物浓度(S S)对酶反应速度(对酶反应速度(V)影响:影响:1、SS与与V关系:关系:用用 SS对对V作图,得作图,得到一矩形双曲线
21、。到一矩形双曲线。第五节第五节 影响酶促反应速度原因影响酶促反应速度原因第37页当当 SS很低时,很低时,V随随 SS呈直线上升,表现为一级反呈直线上升,表现为一级反应。当应。当 SS增加到足够大时,增加到足够大时,V几乎恒定,趋向于几乎恒定,趋向于极限,表现为零级反应。极限,表现为零级反应。第五节影响酶促反应速度原因第五节影响酶促反应速度原因曲线表明,当曲线表明,当S增加到一定数值后,酶作用出增加到一定数值后,酶作用出现了饱和状态,这可用中间产物学说加以说明。现了饱和状态,这可用中间产物学说加以说明。此时若要增加此时若要增加V,则应增加则应增加酶浓度酶浓度。2、SS与与V关系解释:关系解释:
22、第38页3 3、米氏方程:、米氏方程:19 19,MichaelisMichaelis和和MentenMenten应用中间产物学说推应用中间产物学说推导出导出 SS与与V之间数学表示式之间数学表示式,称为米,称为米-曼方程(简曼方程(简称米氏方程)称米氏方程)V Vmax max SS V=V=K Km m+S+S其其中中:VV酶酶促促反反应应速速度度;V Vmaxmax酶酶完完全全被被底底物物饱饱和和时时最最大大反反应应速速度度;S S 底底物物浓浓度度;K Km m米米氏氏常数常数第四节影响酶促反应速度原因第四节影响酶促反应速度原因第39页4 4、米氏常数(、米氏常数(KmKm):当:当V
23、=1/2 Vmax V=1/2 Vmax 时时,V Vmax max V Vmax max S 1 S S 1 S =即:即:=2 2 K Km m+S 2 K+S 2 Km m+S+S 2 S=K 2 S=Km m+S +S 即:即:Km=SKm=S KmKm涵义是:酶促反应速度到达最大反应速度涵义是:酶促反应速度到达最大反应速度二分之一时底物浓度二分之一时底物浓度。KmKm单位为浓度单位,普单位为浓度单位,普通用通用mol/L mol/L 或或 mmol/Lmmol/L表示表示第四节第四节 影响酶促反应速度原因影响酶促反应速度原因第40页5 5、KmKm值值意义:酶学研究中一个极主要数据意
24、义:酶学研究中一个极主要数据(1 1)KmKm值是酶特征常数之一值是酶特征常数之一。不一样酶有不不一样酶有不一样一样KmKm值,一个酶对一个底物有一定值,一个酶对一个底物有一定KmKm值,当一个值,当一个酶有多个底物时则每一个底物酶有多个底物时则每一个底物KmKm值也不相同,其中值也不相同,其中KmKm值最小底物为酶最适底物值最小底物为酶最适底物第四节第四节 影响酶促反应速度原因影响酶促反应速度原因第41页(2 2)KmKm值可用于判断酶与底物亲和力大小,值可用于判断酶与底物亲和力大小,KmKm愈大,说明酶与底物亲和力弱,愈大,说明酶与底物亲和力弱,KmKm愈小,愈小,说明酶与底物亲和力愈强。
25、说明酶与底物亲和力愈强。第四节第四节 影响酶促反应速度原因影响酶促反应速度原因(1)Km值是酶特征常数之一值是酶特征常数之一第42页第四节第四节 影响酶促反应速度原因影响酶促反应速度原因5 5、KmKm值值意义意义(3)Km大小近似地反应了酶与底物结大小近似地反应了酶与底物结合亲和力大小。合亲和力大小。Km越小,酶与底物亲越小,酶与底物亲和力越大。和力越大。(5).Km能够帮助推测某一代谢反应方能够帮助推测某一代谢反应方向和路径。向和路径。(4)用已知)用已知Km值带入米氏方程计算任意值带入米氏方程计算任意S 时时V,或任何或任何V下下S(补充)补充)。第43页第四节第四节 影响酶促反应速度原
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