DNA的生物合成省公共课一等奖全国赛课获奖课件.pptx
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1、目目 录录DNA生物合成生物合成(复制复制)DNA Biosynthesis,Replication 第第 九九 章章第1页目目 录录中心法则(central dogma)遗传信息传递方向规律遗传信息传递方向规律基因表示:基因表示:是指将遗传信息由是指将遗传信息由DNA转录转录为为RNA、再、再翻译翻译成蛋白质过程成蛋白质过程第2页目目 录录第3页目目 录录复制复制(replication)是指遗传物质传代,以母链是指遗传物质传代,以母链DNA为模板合为模板合成子链成子链DNA过程。过程。复制复制亲代亲代DNA子代子代DNA第4页目目 录录复制基本规律复制基本规律Basic Rules of
2、DNA Replication 第一节第一节第5页目目 录录一、半保留复制试验依据和意义一、半保留复制试验依据和意义 DNADNA生生生生物物物物合合合合成成成成时时时时,母母母母链链链链DNADNA解解解解开开开开为为为为两两两两股股股股单单单单链链链链,各各各各自自自自作作作作为为为为模模模模板板板板(template)(template)按按按按碱碱碱碱基基基基配配配配对对对对规规规规律律律律,合合合合成成成成与与与与模模模模板板板板互互互互补补补补子子子子链链链链。子子子子代代代代细细细细胞胞胞胞DNADNA,一一一一股股股股单单单单链链链链从从从从亲亲亲亲代代代代完完完完整整整整地地
3、地地接接接接收收收收过过过过来来来来,另另另另一一一一股股股股单单单单链链链链则则则则完完完完全全全全从从从从新新新新合合合合成成成成。两两两两个个个个子子子子细细细细胞胞胞胞DNADNA都都都都和和和和亲亲亲亲代代代代DNADNA碱碱碱碱基基基基序序序序列列列列一一一一致致致致。这这这这种种种种复复复复制制制制方方方方式式式式称称称称为为为为半保留复制半保留复制半保留复制半保留复制。半保留复制概念半保留复制概念第6页AGGTACTGCCACTGGTCCATGACGGTGACCCCACTGGGGTGACCAGGTACTGTCCATGACTCCATGACAGGTACTGAGGTACTGCCACT
4、GGTCCATGACGGTGACCAGGTACTGCCACTGGTCCATGACGGTGACC+母链母链DNA 复制过程中形成复制过程中形成复制叉复制叉子代子代DNA 目目 录录第7页目目 录录密度梯度试验密度梯度试验 试验结果支持试验结果支持半保留复制半保留复制构想。构想。含重氮含重氮N15-DNA细菌细菌培养于普培养于普通培养液通培养液 第一代第一代继续培养于继续培养于普通培养液普通培养液 第二代第二代梯度离心结果梯度离心结果第8页目目 录录按按半半保保留留复复制制方方式式,子子代代DNA与与亲亲代代DNA A碱碱基基序序列列一一致致,即即子子代代保保留留了了亲亲代代全全部部遗遗传传信信息
5、,表达了遗传息,表达了遗传保守性保守性。半保留复制意义半保留复制意义遗传保守性,是物种稳定性分子基础,但遗传保守性,是物种稳定性分子基础,但不不是绝正确是绝正确。第9页目目 录录二、双向复制二、双向复制原核生物复制时,原核生物复制时,原核生物复制时,原核生物复制时,DNADNA从从从从起始点起始点起始点起始点(origin)(origin)向向向向两个方向解链,形成两个延伸方向相反复制叉,两个方向解链,形成两个延伸方向相反复制叉,两个方向解链,形成两个延伸方向相反复制叉,两个方向解链,形成两个延伸方向相反复制叉,称为称为称为称为双向复制双向复制双向复制双向复制。复制中放射自显影图象复制中放射自
6、显影图象第10页目目 录录Cairns复制模型复制模型型复制型复制第11页目目 录录第12页目目 录录A.环状双链环状双链DNA及复制起始点及复制起始点B.复制中两个复制叉复制中两个复制叉C.复制靠近终止点复制靠近终止点(termination,ter)oriterA B C第13页目目 录录53oriorioriori535533553复制子复制子3第14页目目 录录(2)起始点和方向)起始点和方向 原核生物和真核生物复制都是在原核生物和真核生物复制都是在DNA分子特定位分子特定位置起始,如大肠杆菌起始点有固定重复保守次序,可被置起始,如大肠杆菌起始点有固定重复保守次序,可被酶识别。酶识别。
7、方向:大多是双向、对称复制方向:大多是双向、对称复制,也有单向或不对称。也有单向或不对称。速度:速度:原核生物复制叉移动快原核生物复制叉移动快(约约105bp/min);真核生物复制叉移动慢真核生物复制叉移动慢 (约约51025103bp/min)第15页目目 录录复制起始点、复制子与复制叉(动画演示)第16页目目 录录三、复制半不连续性三、复制半不连续性3 5 3 5 解链方向解链方向35335领头链领头链(leading strand)随从链随从链(lagging strand)第17页目目 录录顺顺着着解解链链方方向向生生成成子子链链,复复制制是是连连续续进进行行,这这股股链称为链称为领
8、头链领头链(前导链)前导链)。另另一一股股链链因因为为复复制制方方向向与与解解链链方方向向相相反反,不不能能顺顺着着解解链链方方向向连连续续延延长长,这这股股不不连连续续复复制制链链称称为为随随从从链链(后后随随链链、滞滞后后链链)。复复制制中中不不连连续续片片段段称称为为岡崎片段岡崎片段(okazaki fragment)。领领头头链链连连续续复复制制而而随随从从链链不不连连续续复复制制,就就是是复复制制半不连续性半不连续性。第18页目目 录录参加参加DNA复制物质复制物质 底物底物(substrate):dATP,dGTP,dCTP,dTTP聚合酶聚合酶(polymerase):依赖依赖D
9、NADNA聚合酶,简写聚合酶,简写 为为 DNA-pol模板模板(template):解开成单链解开成单链DNA母链母链引物引物(primer):提供提供3-OH末端使末端使dNTP能够依次聚合能够依次聚合 其它酶和蛋白质因子其它酶和蛋白质因子第19页一、复制化学反应一、复制化学反应 (dNMP)n+dNTP (dNMP)n+1+PPi 目目 录录第20页目目 录录聚合反应特点聚合反应特点 除了底物和酶外,除了底物和酶外,除了底物和酶外,除了底物和酶外,DNA DNA 新链生成需新链生成需新链生成需新链生成需引引引引物物物物和和和和模板模板模板模板;新链延长只可沿新链延长只可沿新链延长只可沿新
10、链延长只可沿5 5 3 3 方向进行方向进行方向进行方向进行 。第21页目目 录录二、二、DNA聚合酶聚合酶全称:全称:依赖依赖DNADNA聚合酶聚合酶(DNA-dependent DNA polymerase)简称:简称:DNA-pol活性:活性:1.53 聚合酶活性聚合酶活性2.核酸外切酶活性核酸外切酶活性第22页目目 录录第23页5 A G C T T C A G G A T A 3|3 T C G A A G T C C T A G C G A C 5 35外切酶活性外切酶活性 53 外切酶活性外切酶活性?能切除突变能切除突变 DNA片段。片段。能识别错配碱基对,并将其水解。能识别错配
11、碱基对,并将其水解。核酸外切酶活性核酸外切酶活性 目目 录录第24页目目 录录第25页目目 录录第26页目目 录录第27页目目 录录第28页目目 录录第29页目目 录录第30页目目 录录功效:53聚合酶活性;酶与模板结合后构象改变,识别碱基,正 确配对后才发挥聚合作用 3 5外切酶活性;主要是对新生DNA链进行校对,预防“错配”53外切酶活性。主要是对DNA损伤修复,以及在DNA复制时RNA引物切除及其空隙填补 可见,DNA pol是1个多功效酶第31页目目 录录323个氨基酸个氨基酸小片段小片段53核酸外切酶活性核酸外切酶活性大片段大片段/Klenow 片段片段 604个氨基酸个氨基酸DNA
12、聚合酶活性聚合酶活性 35核酸外切酶活性核酸外切酶活性N 端端C 端端木瓜蛋白酶木瓜蛋白酶DNA-pol Klenow片段是试验室合成片段是试验室合成DNA,进行,进行分子生物学研究中惯用工具酶。分子生物学研究中惯用工具酶。第32页目目 录录功效功效是原核生物复制延长中真正起催化作用酶。是原核生物复制延长中真正起催化作用酶。DNA-pol (250kD)第33页目目 录录第34页目目 录录亚基含有亚基含有53方向合成方向合成DNA催化活性催化活性亚基含有亚基含有35外切酶活性,起校对功效,外切酶活性,起校对功效,可提升聚合酶可提升聚合酶复制复制DNA保真性保真性 亚基可能亚基可能起组建作用起组
13、建作用亚基如同夹子,亚基如同夹子,功效是识别引物、夹住功效是识别引物、夹住DNA 分子向前滑动分子向前滑动 亚基亚基起着促使关键酶二聚化作用起着促使关键酶二聚化作用其余亚基组成其余亚基组成 -复合物,复合物,主要功效是帮助主要功效是帮助 亚基夹住亚基夹住DNA(也称夹子装置器),并有(也称夹子装置器),并有 增强关键酶活性作用增强关键酶活性作用第35页目目 录录(二)真核生物(二)真核生物DNADNA聚合酶聚合酶DNA-pol 起始引发,有引物酶活性。起始引发,有引物酶活性。延长子链主要酶,有解螺旋酶活性。延长子链主要酶,有解螺旋酶活性。参加低保真度复制参加低保真度复制 。在复制过程中起校读、
14、修复和填补缺在复制过程中起校读、修复和填补缺口作用。口作用。在在线粒体线粒体DNA复制中起催化作用。复制中起催化作用。DNA-pol DNA-pol DNA-pol DNA-pol 第36页目目 录录第37页目目 录录(一)解螺旋酶、引物酶和单链(一)解螺旋酶、引物酶和单链DNA结合蛋白结合蛋白第38页目目 录录解螺旋酶解螺旋酶(helicase)利用利用ATP供能,作用于氢键,使供能,作用于氢键,使DNA双链双链解开成为两条单链解开成为两条单链引物酶引物酶(primase)复制起始时催化生成复制起始时催化生成RNA引物酶引物酶单链单链DNA结合蛋白结合蛋白(single stranded D
15、NA binding protein,SSB)在复制中维持模板处于单链状态并保护单在复制中维持模板处于单链状态并保护单链完整链完整 第39页目目 录录拓扑异构酶作用特点拓扑异构酶作用特点既能水解既能水解 、又能连接磷酸二酯键、又能连接磷酸二酯键 拓扑异构酶拓扑异构酶 拓扑异构酶拓扑异构酶分分 类类第40页目目 录录第41页目目 录录第42页目目 录录第43页目目 录录第44页目目 录录第45页目目 录录五、五、DNA连接酶连接酶连连接接DNA链链3-OH末末端端和和相相邻邻DNA链链5-P末末端端,使使二二者者生生成成磷磷酸酸二二酯酯键键,从从而而把把两两段段相相邻邻DNA链链连连接接成成一一
16、条条完完整整链链。以以N(大大肠杆菌)或(真核细胞)为能源。肠杆菌)或(真核细胞)为能源。DNA连接酶连接酶(DNA ligase)作用方式作用方式第46页HO5335DNA连接酶连接酶ATPADP5353目目 录录第47页目目 录录第48页目目 录录DNA连连接接酶酶在在复复制制中中起起最最终终接接合合缺缺口口作作用。用。在在DNA修修复复、重重组组及及剪剪接接中中也也起起缝缝合合缺缺口作用。口作用。也是基因工程主要工具酶之一。也是基因工程主要工具酶之一。功效功效第49页目目 录录(一)复制起始(一)复制起始需要处理两个问题:需要处理两个问题:1.DNA解开成单链,提供模板。解开成单链,提供
17、模板。2.合成引物,提供合成引物,提供3-OH末端。末端。一、原核生物一、原核生物DNA生物合成生物合成 第50页目目 录录原核生物原核生物E.coli为例为例复制由起始点复制由起始点复制由起始点复制由起始点 oriC(origin)oriC(origin)开始双向复制开始双向复制开始双向复制开始双向复制E.coliE.coliE.coliE.coli复制起始点复制起始点复制起始点复制起始点oriCoriCoriCoriC(245bp245bp245bp245bpDNADNADNADNA组分)组分)组分)组分)序列分析有以下特点序列分析有以下特点序列分析有以下特点序列分析有以下特点 3 3 3
18、 3组串连重复序列组串连重复序列组串连重复序列组串连重复序列(13bp(13bp(13bp(13bp),每个次序都由),每个次序都由),每个次序都由),每个次序都由GATCGATCGATCGATC开始开始开始开始 2 2 2 2组反向重复序列组反向重复序列组反向重复序列组反向重复序列(9bp)(9bp)(9bp)(9bp)4 4 4 4个个个个dnaAdnaAdnaAdnaA蛋白结合部位蛋白结合部位蛋白结合部位蛋白结合部位第51页目目 录录1 1、拓扑异构酶解开超螺旋。、拓扑异构酶解开超螺旋。2 2、Dna ADna A蛋白识别并在蛋白识别并在ATPATP存在存在下结合于四个下结合于四个9bp
19、9bp重复序列。重复序列。3 3、在类组蛋白(、在类组蛋白(HUHU、ATPATP参加下参加下,Dan ADan A蛋白变性蛋白变性1313个个bpbp重复序列重复序列,形成开链复合物。形成开链复合物。4 4、Dna BDna B借助于水解借助于水解ATPATP产生能产生能量在量在Dna CDna C帮助下沿帮助下沿5 5 3 3 方向移动,解开方向移动,解开DNADNA双链,形成双链,形成前引发复合物。前引发复合物。5 5、单链结合蛋白结合于单链。、单链结合蛋白结合于单链。6 6、引物合成酶(、引物合成酶(Dna GDna G蛋白)开蛋白)开始合成始合成RNARNA引物。引物。第52页目目
20、录录第53页目目 录录第54页目目 录录 Dna A Dna B、Dna CDNA拓扑异构酶拓扑异构酶引物引物酶酶SSB3 5 3 5 引发体和引物引发体和引物含有解螺旋酶、含有解螺旋酶、DnaC蛋白、引物酶和蛋白、引物酶和DNA复制起始区域复合结构称为引发体。复制起始区域复合结构称为引发体。第55页目目 录录3 5 3 5 引物是由引物酶催化合成短链引物是由引物酶催化合成短链RNA分子。分子。引物引物3 HO5引物引物酶酶第56页目目 录录第57页目目 录录 DNADNA复复复复制制制制调调调调控控控控是是是是在在在在起起起起始始始始阶阶阶阶段段段段进进进进行行行行,一一一一旦旦旦旦复复复复
21、制制制制起起起起始始始始,它它它它就就就就会会会会继继继继续续续续下下下下去去去去直直直直到到到到整整整整个个个个复复复复制制制制子子子子完完完完成成成成复制。复制。复制。复制。复复复复制制制制起起起起点点点点是是是是以以以以一一一一条条条条链链链链为为为为模模模模板板板板起起起起始始始始DNADNA合合合合成成成成一一一一段段段段序序序序列列列列。有有有有时时时时,两两两两条条条条链链链链复复复复制制制制起起起起点点点点并并并并不不不不在在在在同同同同一点上(不对称复制,如一点上(不对称复制,如一点上(不对称复制,如一点上(不对称复制,如DD环复制)。环复制)。环复制)。环复制)。在在在在一
22、一一一个个个个完完完完整整整整细细细细胞胞胞胞周周周周期期期期中中中中,每每每每一一一一个个个个复复复复制制制制起点只使用一次,完成一次复制过程。起点只使用一次,完成一次复制过程。起点只使用一次,完成一次复制过程。起点只使用一次,完成一次复制过程。多数生物复制起点,都是富含多数生物复制起点,都是富含多数生物复制起点,都是富含多数生物复制起点,都是富含A.TA.T。第58页目目 录录(二)复制延长(二)复制延长复复制制延延长长指指在在DNA-pol催催化化下下,dNTP以以dNMP方方式式逐逐一一加加入入引引物物或或延延长长中中子子链链上上,其其化化学本质是磷酸二酯键不停生成。学本质是磷酸二酯键
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