网状Meta分析中对R软件nlme程序包的开发与应用.docx

《网状Meta分析中对R软件nlme程序包的开发与应用.docx》由会员分享，可在线阅读，更多相关《网状Meta分析中对R软件nlme程序包的开发与应用.docx（5页珍藏版）》请在淘文阁 - 分享文档赚钱的网站上搜索。

1、网状Meta分析中对R软件nlme程序包的开发与应用 打开文本图片集 摘 要：nlme程序包是以广义最小二乘法和线性混合效应模型的基础上研发的，能够对R软件进行广义线性和非线性混合的Meta分析。Nlme程序包能够对网状Meta进行分析，在此过程中要转换数据，这样才能够使其为对数值进行之后运算。本文主要介绍了R软件nlme程序包的网状Meta分析过程，并且具体介绍了数据转化的过程步骤。 关键词：网状Meta；R软件；nlme程序包；开发和应用 中图分类号：TP311 文献标识码：A 1 引言 目前，网状Meta分析在不断的发展，基于此，越来越多的软件被接连探讨及开发出来，运算模型也渐渐进入到人

2、们的视野中，受到人们的亲密关注，其中包括广义线性模型。广义线性模型的主要特点就是不强制性的变更数据的自然度量，并且GLM模型中的Y分布能够以各种形式指数分布。 nlme程序是基于S语言通过S-PLUS软件实现混合效应模型分析的一款软件。所以，它不仅能够进行线性模型，还能够进行非线性混合效应模型分析，nlme程序还能够实现Meta分析。本文就以R软件nlme程序包在网状Meta分析中的应用文中的实例进行分析。 2 软件和程序包的安装和加载 要想探讨网状Meta分析对R软件nlme程序包的开发和应用，首先就要安装R软件，其安装依据电脑提示步骤完成即可，本文运用的是R-3.0.1。完成上述步骤以后，

3、安装nlme程序包，安装程序包的吩咐为：install.package，在程序包安装过程中，会有一个对话框，选中对话框中的CRAN安装，然后安装胜利，利用library吩咐完成加载步骤。那么，软件和程序包就算是安装和加载胜利了1。 3 加载数据及预处理 加载数据 实现R软件nlme程序包中网状Meta分析的实现和应用主要是将因变量y变为效变量，把自变量x变为干预措施，之后依据干预措施进行比较以此计算线性关系。本文中将y设置成log，将x设置成十三种药物，并且将这些药物之间进行了相应的对比和标记2。 本文中具有3臂试验，那么就要将数据中的3臂试验分为2臂依次排列，加载数据的程序为： Lineda

4、tasummary Decription 1MTC dataset：Example Studie per treatment A B C D E 25 4 5 8 4 Number of narmstudise 2 arm 3 arm 52 12 5 绘制图形 最终一步就是通过R软件的绘图功能，绘制与数据结果相关的图形8。下文中的图形就是运用R软件的形式保存的图形。 网状关系图 nlme程序包中并没有绘制网状关系图的功能，那么就要通过R软件进行。 相关图形 nlme程序包绘制的图形和吩咐有四种：其一，收敛诊断。其吩咐为gelman.plot；具有十三个gelman plot，通过此吩咐显示“p

5、ar） nlme.plot”其二，轨迹和密集。其吩咐为plot；其三，森林。其吩咐为forest；其四，网状关系。其吩咐为plot9。 6 结论 网状Meta分析在GLM中的运用正在不断的创新和突破，但是在比较方面还是存在一系列的问题，尤其是在图形绘制方面，另外，其中还要添加一系列的一样性的參数。在进行分析的时候，要先转化数据。nlme程序包为Meta分析打开了全新的方式和思路，目前其还有很多须要完善的部分，比如一样性、异质性的检测等，其最大的缺点就是没有检测功能。社会在不断的发展，nlme程序包也会不断的完善，并且被广泛应用到Meta分析中。 参考文献 1 Fu R，et al.Effect

6、iveness and Harms of Recombinant Human Bone Morphogenetic Protein-2 in Spine Fusion：a Systematic Review and Meta-AnalysisJ.Annals of Internal Medicine，2022，158：890-902. 2 Ten Broek R P，et al.Different Surgical Techniques to Reduce Post-Operative Adhesion Formation：a Systematic Review and Meta-Analys

7、isJ.Human Reproduction Update，2022，19：12-25. 3 Ghooshkhanei H，et al.Risk Stratification and Prognosis Determination UsingF-FDG PET Imaging in Endometrial Cancer Patients：a Systematic Review and Meta-AnalysisJ.Gynecologic Oncology，2022，132：669-676. 4 张超，等.应用R语言netmeta程序包实现网状Meta分析J.中国循证医学杂志，2022：625-

8、630. 5 张超，玉明，曾宪涛.R软件nlme程序包在网状Meta分析中的应用J.中国循证医学杂志，2022：355-360. 6 YI Yuexiong.网状Meta分析图形结果解读J.中国循证医学杂志，2022：103-109. 7 张超，徐畅，曾宪涛.网状Meta分析中网状关系图的绘制J.中国循证医学杂志，2022，13：1382-1386. 8 汪徐林，等.Stata软件在网状Meta分析中的应用J.现代预防医学，2022，43：1387-1391. 9 罗美玲，等.在R软件中实现单个率的Meta分析J.循证医学，2022，13：181-184. 作者简介： 王凤岐，男，本科，讲师.探讨领域：软件工程. 第5页 共5页第 5 页 共 5 页第 5 页 共 5 页第 5 页 共 5 页第 5 页 共 5 页第 5 页 共 5 页第 5 页 共 5 页第 5 页 共 5 页第 5 页 共 5 页第 5 页 共 5 页第 5 页 共 5 页